Utilizando el análisis de material genético y el aprendizaje automático, Los investigadores de la UBC han identificado varios factores clave para garantizar el éxito de los trasplantes de microbiota fecal (FMT), que han demostrado ser exitosos en el tratamiento de infecciones bacterianas en el intestino, incluidas enfermedades como C. difficile , Enfermedad de Crohn, Colitis e incluso obesidad, explica el autor principal, Negin Kazemian.
Esta terapia aún está en pañales, pero estudios como el nuestro están ayudando a identificar contribuyentes clave para su éxito general ".
Negin Kazemian, Autor principal del estudio y estudiante de posgrado, Escuela de Ingeniería, Campus Okanagan de la Universidad de Columbia Británica
Kazemian y su supervisor, Profesora asistente Sepideh Pakpour, están investigando la dinámica interna tanto de donantes como de receptores para establecer una fórmula para la eficacia de la terapia.
C. difficile es una de las infecciones asociadas a la atención médica identificadas con mayor frecuencia en América del Norte, ella agrega. Una vez que el paciente lo contrae, la enfermedad a menudo se repite, teniendo un impacto negativo significativo en los microorganismos intestinales de un paciente.
Kazemian explica que los ecosistemas intestinales gravemente dañados, como alguien que ha tenido C. difficile , no se renuevan por sí mismos. Por lo tanto, FMT puede ayudar restaurando sistemas dañados mediante la recreación del ecosistema original, o la construcción de un ecosistema completamente nuevo y alternativo.
"En nuestro estudio, Demostramos que el éxito de la recuperación ecológica intestinal a través de FMT depende de varios factores, incluido el microbioma intestinal del donante, la presencia de bacterias específicas, así como las estructuras de la comunidad intestinal del receptor previo al FMT y la ausencia de bacterias y hongos específicos ".
Algunos estudios previos han apuntado a la posibilidad de "super" donantes, pero estos nuevos hallazgos indican que la relación entre donantes y receptores es mucho más compleja. Pakpour dice que la noción de superdonante se simplifica demasiado debido a las fluctuaciones observadas a corto plazo. La microbiota de un receptor puede ser igualmente importante de considerar al predecir los resultados del tratamiento, especialmente en condiciones de desequilibrio como la colitis ulcerosa.
"Llevar, por ejemplo, trasplantes de sangre en los que tenemos un sólido conocimiento de los cuatro grupos o tipos principales de sangre, y cómo interactúan entre sí, "dice Pakpour." Con los trasplantes fecales, la investigación hasta este punto no ha sido tan clara en lo que constituye una buena compatibilidad o compatibilidad ".
Trabajando con datos del Hospital de la Universidad de Alberta, Kazemian y Pakpour analizaron la composición intestinal y el ADN de muestras extraídas antes y después de FMT.
Según Kazemian, sus hallazgos indican que no existe un enfoque de "un solo taburete para todos" para garantizar el éxito del trasplante.
"Los datos ilustran que los microorganismos únicos en el cuerpo de todos responden de manera diferente con el tiempo, y esto tiene profundas implicaciones sobre si estos trasplantes funcionan bien o no ".
Los investigadores sugieren que preparar los ecosistemas intestinales de donantes y pacientes antes del trasplante, tal vez usando metabolitos, potencialmente sincronizaría su microbiota abriendo el camino hacia una mayor probabilidad de éxito del trasplante.