PLoS One: gén polimorfizmus a mikroRNS a Helicobacter pylori által kiváltott magas kockázatú sorvadásos gyomorhurut és gyomorfekély Cancer

absztrakt katalógusa

Háttér és célkitűzések katalógusa

A mikroRNS (miRNS) ismertek a funkciót transzlációs szabályozó tumor szuppresszor vagy onkogének. Egységes nukleotid polimorfizmusok (SNP-k) A miRNS-ek kapcsolatos gének kimutatták, hogy befolyásolja a szabályozó képességét miRNS és arra kapcsolódik gyomorrák (GC) és premalignus gyomor feltételek mellett. A tanulmány célja az volt, hogy értékelje a lehetséges összefüggést miRNS kapcsolatos gén polimorfizmusok ( miR-27a katalógusa, miR-146a katalógusa, miR-196a-2 |, miR-492 katalógusa és miR-608 katalógusa), és a jelenléte GC vagy magas kockázati sorvadásos gyomorhurut (HRAG) az európai népesség. katalógusa

módszerek katalógusa

Gene polimorfizmusok elemeztük 995 tantárgyak (ellenőrzések: n = 351; GC: n = 363; HRAG: n = 281) az európai származású. a miR-27a katalógusa T > C (rs895819), miR-146a katalógusa G > C (rs2910164), miR-196a-2 | C > T (rs11614913), miR-492 katalógusa G > C (rs2289030) és a miR-608 katalógusa C > G (rs4919510) SNP genotipizálása RT-PCR. katalógusa

Eredmények katalógusa

Összességében SNP a miRNS nem függött össze a jelenléte GC vagy HRAG. Megfigyeltük a tendencia miR-196a-2 | CT genotípusú, összefüggő nagyobb a kockázata a GC képest CC genotípus, bár a különbség nem érte el a korrigált P katalógusa -érték (esélyhányados (OR) - 1,46, 95% -os megbízhatósági intervallum (CI) 1,03-2,07, P katalógusa = 0,032). A miR-608 katalógusa GG genotípus gyakoribb volt a GC a kontrollcsoporthoz viszonyítva (OR -2,34, 95% CI 1,08-5,04), de jelentősége marginális maradt ( P katalógusa = 0,029). Hasonló tendencia figyelhető meg a recesszív modellt miR-608 katalógusa, ahol CC + CG vs GG genotípus összehasonlítás tendenciát mutatott fokozott kockázatának GC OR 2,44 (95% CI 1,14-5,22, P katalógusa = 0,021). A genotípus és allélja miR-27a katalógusa, miR-146a katalógusa, miR-196a-2 |, miR-492 katalógusa és miR-608 katalógusa SNP is hasonló eloszlás között szövettani altípusa a GC és nem kapcsolódnak a jelenléte diffúz vagy bél típusú GC. katalógusa

Következtetések katalógusa

Gene polimorfizmusok miR -27a katalógusa, miR-146a katalógusa, miR-196a-2 |, miR-492 katalógusa, miR-492A katalógusa és miR-608 katalógusa nem függött össze a jelenléte HRAG, GC vagy különböző szövettani altípusok GC európai témákról. katalógusa

Citation: KUPČINSKAS J, Wex T, link a, Leja M, Bruzaite I, Steponaitiene R, et al. (2014) gén polimorfizmus a mikroRNS Helicobacter pylori katalógusa indukált magas kockázatú sorvadásos gyomorhurut és a gyomorrák. PLoS ONE 9 (1): e87467. doi: 10,1371 /journal.pone.0087467 katalógusa

Szerkesztő: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japán katalógusa

Beérkezett: szeptember 14, 2013; Elfogadva: december 26, 2013; Megjelent: január 27, 2014 katalógusa

Copyright: © 2014 KUPČINSKAS et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a munka támogatta az Európai Szociális Alap (No. VP1-3.1-MM-07-K-01-156), és részben a támogatás a BMBF (BMBF-0315905D) keretében az ERA-Net projekt PathoGenoMics. A betegek toborzása Lettország részben támogatta a projekt az Európai Regionális Fejlesztési Alap (No. 2010/0302 /2DP /2.1.1.1.0 /10 /APIA /VIAA /158). A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

Annak ellenére, csökkenő előfordulási gyomorrák (GC) a legtöbb fejlett országban, GC elszámolni összesen 989.600 új esetet és 738.000 halálesetet 2008 világszerte [1]. Helicobacter pylori katalógusa ( H. Pylori katalógusa) fertőzés gyomornyálkahártya vezethet a fejlesztési atrophiás gastritis (AG) és intestinalis metaplasia (IM) és a bíboros kialakulásának kockázati tényezője a GC [2]. Mindazonáltal, a fejlesztés a gyomor adenokarcinóma nem magyarázható a jelenléte H. pylori
egyedül. Szinergikus hatását környezeti, fogadó, a táplálkozási és bakteriális tényezők úgy gondolják, hogy kiváltó gyomor karcinogenezis, azonban a mechanizmusok és kölcsönhatás még mindig kevéssé ismert [3]. Számos gén eltéréseinek hozták összefüggésbe a gyomor karcinogenezis, de egyikük sem került még át a mindennapi klinikai gyakorlat hiánya miatt az egyesülési erő [4]. A legújabb adatok arra utalnak, hogy a potenciális hatása egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP) mikroRNS kapcsolatos gének (miRNS) a kockázata a rák fejlődését. [5] katalógusa

miRNS csak ~22 bp hosszú, és mert az egyedülálló biogenesis igen stabilak különböző szövetekben vagy példányokat, így vonzó célpontot biomarker kutatás terén [6], [7]. Egyre több a funkcionális vizsgálatok arra utalnak, hogy a miRNS-ek is be lehet vonni különböző szakaszaiban gyomor carcinogenesis [8]. Ez összhang is tükröződik miRNS profil vizsgálatok feltárt specifikus módosításokat expressziós mintázatot nyálkahártyájában GC betegeknél. Továbbá miRNS expressziós változások már kimutatható korai szakaszában gyomor karcinogenezis beleértve H. pylori
indukált AG [8]. katalógusa

jobb megértéséhez funkcionális szerepe miRNS nyitott egy új Capitel gén polimorfizmus kutatás rák [7], [9]. Single miRNS képes célba több gén; Ezért a jelentősége a SNP miRNS génszekvencia összefüggésben lehetnek figyelemre méltó változások génexpresszió szabályozásában és módosítása a kockázatot, hogy fejlődés bizonyos emberi betegségek, beleértve a GC [8]. Különböző tanulmányok kimutatták, hogy bizonyos SNP miRNS-kódoló gének megváltoztathatják miRNS expressziós vagy annak funkcionális szerepét és ily módon befolyásolja a kockázata a rák kialakulásának vagy súlyosbodásának [10], [11]. Egyre több eset-kontroll vizsgálatok kimutatták közötti társulás polimorfizmusok kódoló gének miRNS és a kockázat a különböző rosszindulatú daganatok [5]. Gén polimorfizmus öt miRNS kapcsolatos gének, miR-27a katalógusa T > C (rs895819), miR-146a katalógusa G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492 katalógusa G > C (rs2289030) és a miR-608 katalógusa C > G (rs4919510) került kiválasztásra a jelen tanulmány miatt korábban javasolt társulás rákrizikót [5], [12] - [14]. katalógusa

A fent említett, a miRNS-ek hozták összefüggésbe a különféle rákos kapcsolódó utakat. Liu et al. kimutatta, hogy a miR-27a katalógusa up-szabályozott GC és működik, mint egy onkogén megcélozva prohibitin [15]. SNP miR-27a katalógusa (rs895819) hozzájárul a GC érzékenység révén befolyásolja a kifejezés a miR-27a katalógusa és megcélozza gén cink-ujj és BTB domént, amely 10 ( ZBTB10 katalógusa ) [16]. miR-146a katalógusa kimutatták, hogy modulálja H. pylori
indukált gyulladásos válasz a humán gyomor hámsejtek megcélozva az IL-1 a kapcsolódó kináz 1 ( IRAK1
) és TNF-receptor-asszociált faktor 6 ( TRAF6
) [17]. Továbbá, miR-146a katalógusa SNP (rs2910164) összefüggésbe hozták AG japánok esetében [18]. Korábbi tanulmányok azt mutatták, aberráns túlexpressziója miR-196a-2 katalógusa és ebből le szabályozása p27 (kip1) GC [16]. Egy másik tanulmány kimutatta, hogy a gén polimorfizmusa miR-196a-2 | (rs11614913) volt összefüggésbe hozható a megnövekedett kockázata GC [19], [20], míg egy tanulmány Ahn et al. (2012) nem tudta megerősíteni ezt a kapcsolatot, de ez a SNP kapcsolódó túlélés GC betegeknél [21]. miR-492
azonosították, hogy fontos szerepet játszanak a progressziójában rosszindulatú embrionális májtumorok [22] és deregulált colorectalis rák, ha összehasonlítjuk a normális vastagbél nyálkahártya [23]. A jelentés a kínai lakosság azt mutatták, hogy az SNP miR-608 katalógusa (rs4919510) befolyásolhatja a HER2-pozitív emlőrák kockázata és a tumor proliferációt [14]. Katalógusa

A jelenleg publikált genotípus-vizsgálatok a kapcsolódó a miRNS gének GC végeztünk csak az ázsiaiak, korlátozza a kis esetszám és az egymásnak ellentmondó adatokat közöltek. Továbbá nagyon kevés tanulmány foglalkozott korábban a szerepe ezeknek a miRNS összefüggő SNP premalignus gyomorrák körülmények között. Bizonyítékok alapján a fent megadott végeztünk rendszeres genotípus-elemzés miR-27a katalógusa, miR-146a katalógusa, miR-196a-2 |, miR 492 katalógusa és miR-608 katalógusa SNP betegeknél GC, nagy kockázatú sorvadásos gyomorhurut és kontrollok három betegcsoport Németország, Litvánia és Lettország az európai származású. katalógusa

módszerek

Etikai nyilatkozat katalógusa

a jóváhagyta a vizsgálatot az etikai bizottságok az Otto-von-Guericke Egyetem Magdeburg, litván University of Health Sciences és Közép Orvosi Etikai Bizottságának lett. Minden beteg írásos beleegyezését formában vesz részt a vizsgálatban. Katalógusa

Study lakosság katalógusa

Tantárgyak részt a vizsgálatban származik korábbi kutatási projektek SNP GC és praemalignus gyomor feltételek [24] , [25]. Betegek és kontrollok vettek az évek során 2005-2012 három gasztroenterológiai központ Németországban (Department of Gastroenterology, hepatológiai és Fertőző Betegségek, Otto-von-Guericke Egyetem, Magdeburg) Litvánia (Department of Gastroenterology, litván University of Health Sciences, Kaunas) és Lettország (Riga keleti Egyetemi Kórház és Digestive Diseases Központ GASTRO, Riga). Betegek HRAG és kontrollokat a járóbeteg-osztályok, akik átadták a felső endoszkópia, mert emésztési tünetek. A felvétel kritériumai HRAG és ellenőrzések nem voltak kórtörténetében malignitás, gyomor-bélrendszeri betegség vagy műtét után. GC betegek szövettani vizsgálata gyomor adenokarcinóma és verbuválódtak járóbeteg és az álló osztályok. Összesen 995 egyének, akik számára anyag megfelelő DNS-minőség elérhető volt (351 ellenőrzés, 281 HRAG és 363 GC), vontunk be a vizsgálatba. Voltak 310 tantárgyak német csoport (63 kontroll, 106 GC és 141 HRAG), 340 tantárgyak Lett csoport (142 ellenőrzés, 139 GC és 59 HRAG) és 345 alanyok litván csoport (146 ellenőrzés, 118 GC 81 HRAG). Minden beteg az európai származású. Katalógusa

szövettani elemzése és H. pylori katalógusa állapot katalógusa

Részletes szövettani értékelése gyomornyálkahártya végeztek ellenőrzéseket és HRAG csoportok szerint a módosított Sydney osztályozás [26]. HRAG úgy definiáltuk, mint pán-gastritis (hasonló gyulladásos pontszámok antrum, és corpus), Corpus-predomináns gyomorhurut vagy jelenléte nélkül gyomor atrophia, és IM akár antrumban vagy corpus a gyomor [27]. H. pylori katalógusa állapot határoztuk tesztelésével anti- H. pylori
IgG antitestek szérumban. A szövettani altípus GC szerint végeztük a Laurén besorolás bél és diffúz-típusú [28]. Katalógusa

DNS kivonás és genotípus-katalógusa

A genomiális DNS-német csoport kivont perifériás vér mononukleáris sejtek QIAamp DNA Blood reagenskészlet (Qiagen, Hilden, Germany) alkalmazásával a gyártó utasításai szerint. Genomi DNS-mintákból származó litván és lett csoportok extraháljuk fenol-kloroform segítségével extrakciós módszerrel a perifériás vér mononukleáris sejtekben. DNS mintákat -20 ° C-ig elemzést. SNP a miR-27a katalógusa C > G (rs895819), miR-146a katalógusa C > G (rs2910164), miR-196a-2 | C > T (rs11614913 ) miR-492 katalógusa C > G (rs2289030) és a miR-608 katalógusa C > G (rs4919510) genotípust segítségével megtervezett TaqManR vizsgálatok egy 7500 ™ valós idejű cycler, összhangban a gyártó utasításai (Life Technologies, CA, USA). Genotípus megbízásokat manuálisan megerősítette szemrevételezéssel az SDS 2.0.5 szoftver kompatibilis a TaqManR rendszer. Katalógusa

Genotyping minőségellenőrzési katalógusa

A minőségellenőrzési eljárások vittük végig genotípus-minták. Miután genotipizálás, körülbelül 10% a minták az egyes genotípus csoport került kiválasztásra az ismétlődő elemzés 100% -os konkordancia arány. Kétes mintáknak triplett ismétlődő elemzést. Minden részt vevő felek genotipizálás nem ismerték az ügyet vagy ellenőrzési státusát a minták. Mintákat, amelyek nem genotípus feljegyeztük meghatározatlan. Katalógusa

A statisztikai elemzés katalógusa

Minden alanyokat három csoportba sorolhatjuk vizsgálati csoportok: kontroll (n = 351), HRAG (n = 281), GC (n = 363). Kor jelenik meg, mint eszközök és standard eltérésekkel, és összehasonlítottuk az ANOVA használatával és páratlan Student-féle t-teszt. Kategorikus adatok (például a nem, a H. Pylori fertőzés katalógusa, szövettani GC altípusok genotípusok eloszlását vagy allél) kerülnek bemutatásra frekvenciákat; összehasonlításokat végeztük a Chi-négyzet próba alapján. katalógusa

A minőségi vizsgálatok és statisztikai elemzés a genotípus-adatok felhasználásával végeztük Plink szoftververziót 1.07 [29]. Egyének több mint 10% hiányzik a genotípusok és SNP-k egy call-arány 90% alatti, vagy eltérés a Hardy-Weinberg (HWE) a kontrollcsoportban ( P katalógusa < 0,05) kizárták a további elemzésből. Az átlagos genotipizálási arány összes minta 99,6% volt. Különbségek allélfrekvenciák közötti esetek és a kontrollok számoltuk a kombinált német, litván és a lett vizsgált mintában, a Breslow-Day teszt heterogenitása legkülső régiók. Csak egy SNP ( miR-608 katalógusa C > G rs4919510) kimutatta heterogenitása legkülső régiók közötti három GC vizsgálati csoportban ( P katalógusa _{BD < 0,05), és ezért az ország születési felvette a kovariáns további elemzést. Közötti társulás HRAG és GC-gén polimorfizmusok számítottuk logisztikus regressziós analízissel az életkor, a nem és a születési ország 95% -os konfidencia intervallum (CI). A relatív kockázatok mutációk alkalmazásával vizsgáltuk recesszív és domináns modell, amely ahhoz vezetett, hogy összehasonlítását vad típusú + heterozigóta vs. homozigóta vad típusú és vs. Katalógusa heterozigóta + homozigóta, ill. Beállításához több tesztelés számított korrigált jelentősége küszöb α = 0,01 (0,05 /5). Katalógusa}

Eredmények katalógusa

Jellemzői a tárgyak katalógusa

A jellemzői az ellenőrzés, GC és HRAG csoportok az 1. táblázat szerint a valós életben kor alanyok szignifikánsan különbözött az életkor és a nemek eloszlása ​​a csoportok között. Ahogy az várható volt, a férfiak elszámolt 63,6% GC csoportban, míg a kontroll és HRAG csoportban ez nem minősül 26,8% és 37,7% volt. Kontroll alanyok szignifikánsan fiatalabbak voltak, mint HRAG csoport (3 év) és GC-csoport (5 év). 52,6% -ánál volt pozitív H. pylori
GC-csoport, azonban mintegy 27% -a magánszemélyek GC csoport H. pylori IgG katalógusa állapotát nem lehetett szerezni. Több mint 47% -ánál a kontrollcsoport és 42,7% -ban HRAG csoportban H. pylori
pozitív. Szövettani besorolását diffúz és bélrendszeri GC típusú gyűjtöttek a 62,0% GC beteg (1. táblázat). Katalógusa

Egyesületek miRNS SNP és a kockázat a GC-HRAG katalógusa

A genotípus eloszlás mind az öt polimorfizmusok a vizsgálat hasonló volt várható Hardy-Weinberg: rs895819 (p = 0,94); rs2910164 (p = 0,44); rs11614913 (p = 0,95); rs2289030 (p = 0,44); rs4919510 (p = 0,39). Genotípus és allél disztribúciók miR-27a katalógusa C > G (rs895819), miR-146a katalógusa C > G (rs2910164), miR-196a-2 | C > T (rs11614913), miR-492 katalógusa C > G (rs2289030) és a miR-608 katalógusa C > G (rs4919510) gén polimorfizmus GC és HRAG tanulmányi csoportok a 2. táblázatban közöljük. nem találtunk szignifikáns összefüggést figyeltek meg a járványos tanulmány következő korrekciós többszörös vizsgálatra. Megfigyeltük a tendencia, miR-196a-2
CT genotípusú, társított nagyobb a kockázata a GC képest CC genotípusú, azonban a különbség nem érte el a beállított szignifikancia küszöb (OR - 1,46, 95% CI 1,03-2,07, P katalógusa = 0,032). A miR-608 katalógusa GG genotípus mértékben kapcsolódik a magasabb kockázatot a GC képest CC genotípus (OR - 2,34, 95% CI 1,08-5,04, P katalógusa = 0,029). Hasonló tendencia figyelhető meg a recesszív modellt miR-608 katalógusa, ahol CC + CG vs GG genotípus összehasonlítás eredménye egy OR - 2,44 (95% CI 1,14-5,22), ( P
= 0.021). katalógusa

Egyesületek miRNS SNP és a kockázat a bél és a diffúz típusú GC katalógusa

a miR-27a katalógusa, miR-146a katalógusa, miR-196a-2 |, miR-492 katalógusa és miR-608 katalógusa SNP egyesületek vizsgáltak két szövettani típusú GC (diffúz vagy a bél típus-GC). Genotípus és allél frekvenciák a tanulmány csoportok 3. táblázat mutatja be domináns modellt miR-27a katalógusa tendenciát mutatott az allél T vs. C kapcsolható össze nagyobb a kockázata a diffúz típusú GC (OR - 2,07 95% CI 1,13-3,79, P katalógusa = 0,018). A miR-196-a2 katalógusa SNP mutatott tendencia kockázatának csökkenésével intesztinális típusú GC recesszív modellben (CC + CT vs. TT), azonban a szövetség ereje nem érte el a statisztikailag szignifikáns mértéket (OR - 0,47, 95 % CI 0,20-1,08, P katalógusa = 0,077). Hasonló megfigyelést tett domináns modellt miR-492 katalógusa SNP (OR - 1,95, 95% CI 1,01-3,75), ahol GG vs GC összehasonlítás vezetett fokozott kockázata diffúz típusú GC azonban a P katalógusa értéke nem éri a szükséges szignifikancia szint ( P katalógusa = 0,046). Az összes többi összehasonlítására szabályozás és diffúz, vagy bél típusú GC csoportok nem mutattak szignifikáns összefüggést vagy trendek öt SNP a miRNS-ek. Katalógusa

Vita katalógusa

A jelen vizsgálatban végeztünk genotipizáló elemzés miR-27a katalógusa (rs895819), miR-146a katalógusa (rs2910164), miR-196a-2 | (rs11614913), miR-492 katalógusa (rs2289030) és a miR-608 katalógusa (rs4919510) gén polimorfizmus egy eset-kontroll vizsgálat, beleértve a 351 ellenőrzés, 281 HRAG és 363 GC betegek három európai vizsgálati csoportban. Ezen polimorfizmusok összefüggésbe hozták a veszélye GC illetve az általános rák kockázatokat; azonban közölt adatok részben ellentmondó alapján vagy csak kevés tanulmány kapcsolódik az ázsiai csoportokra. Annak ellenére, hogy néhány apró eltérés, eredményeink nem támogatják a kapcsolatot miR-27a katalógusa, miR-146a katalógusa, miR-196a-2 |, miR 492 katalógusa és miR-608 katalógusa gén polimorfizmusok és a jelenléte GC vagy HRAG. Továbbá nem találtunk összefüggést SNP a miRNS-ek és a jelenléte a különböző szövettani altípusa a GC. Mivel miRNS Kimutatták, hogy a mélyreható hatása a gyomor karcinogenezis [8], azt vártuk, hogy ezek a polimorfizmusok lehetne módosítani a kockázatát GC vagy prekurzorai. Ahhoz, hogy a legjobb tudásunk szerint, ez az első tanulmány, amely vizsgálta az egyesületek közötti miRNS polimorfizmusok és a kockázat a GC vagy HRAG alanyoknál az európai származású. Mi több, SNP-k a miR-492 katalógusa (rs2289030) és a miR-608 katalógusa (rs4919510) nem vizsgálták kapcsolatban GC vagy premalignus gyomorrák körülmények korábban. Katalógusa

Génpolimorfizmus miR-27a jelenleg az egyik legtöbbet tanulmányozott SNP daganatos eset-kontroll vizsgálatok. Azt vártuk, hogy a fuvarozók a C allél az miR-27a katalógusa SNP volna egy kisebb kockázata GC felvetődött néhány kutatócsoport. Egy kínai eset-kontroll vizsgálat, beleértve a 311 GC betegek és 425 ráktól mentes ellenőrzések megállapították, hogy minor allél C rs895819 a miR-27a
jelentősen csökkent kockázatát GC OR - 0,77 [30]. Egy másik tanulmány szerint jelentősen megnövekedett kockázata GC (OR - 1.48) A miR-27a katalógusa SNP és további funkcionális elemzések azt mutatták, hogy variáns allél felelős lehet az emelkedett miR-27a katalógusa szintet és csökkent ZBTB10 katalógusa mRNS szinteket [16]. Ezzel szemben a tanulmány többek között 2380 résztvevők változatos gyomornyálkahártya-elváltozások nem találtunk fokozott a gyomor- IM vagy dysplasia az rs895819 [12]. A meta-analízis összefoglaló megállapításait különböző eset-kontroll vizsgálatok során kiderült, hogy rs895819 polimorfizmus szignifikáns csökkenésével jár kockázatokkal rák fehér, de nem ázsiaiak [31]. A vizsgálati eredmények azt nem támogatják a lehetséges védő hatása a C allél GC fejlődés európai témákról. A tanulmány az első, amely értékelte a szerepét miR-27a katalógusa rs895819 GC és HRAG alanyok az európai származású, de nincs szignifikáns összefüggést figyeltek meg. Katalógusa

Figyelembe véve a meglévő bizonyítékok miR-146a katalógusa SNP (rs2910164) a rák fejlődését akartuk, hogy értékelje a lehetséges összefüggést a csoportban a betegek GC és HRAG. Song et al. megállapította, hogy a CC hordozók rs2910164 szignifikánsan megnövekedett kockázata IM (OR - 1,42) és diszplázia (OR - 1,54), mint a GG hordozók [12]. Hasonló megfigyelést tett egy másik vizsgálatban, ahol együttes hatása miR-146a katalógusa (rs2910164) G /G és TLR4 SNP a fokozott a súlyos AG között japánok volt megfigyelhető [18]. A papír Okubo et al. [32] számolt be, hogy a kocsi rs2910164 CC genotípus esetén jelentősen nagyobb a kockázata a GC képest nem rákos beteg (OR - 1,30). A meta-analízis szerint Wang et al. [33] A miR-146a katalógusa rs2910164 köztük 19 eset-kontroll vizsgálatok során azt találták, hogy az rs2910164 kapcsolódott megnövekedett rák fogékonyság ázsiaiak az általános OR - 1,18, de ugyanaz a meta-analízis arra ösztönzi a további jól megtervezett tanulmányok nagy mintanagyság további kockázatok azonosítása. Az eredményeket a mi eset-kontroll vizsgálat nem tárt fel olyan szignifikáns összefüggést rs2910164 és a kockázat a GC vagy HRAG. Katalógusa

A miR-196a-2 | C > T SNP (rs11614913) egyike a legjobban tanulmányozott miRNS SNP kapcsolatban különböző rosszindulatú daganatok. A jelentés szerint Wang et al. (2013) kimutatta, hogy a CC genotípus esetén jelentősen csökkent kockázatát gyomorrák (OR - 0,78), mint a CT és TT genotípusok nagy eset-kontroll tanulmány [33]. A meta-analízis szerint Wang et al. (2013) azt találták, hogy jelentős mértékben megnövekedett GC kockázatot, de az egyesület volt megfigyelhető csak homozigóta képest. Ez a meta-analízis szerint rs11614913 polimorfizmus szignifikáns összefüggésben áll az általános gyomor-bélrendszeri rákok [34]. Okubo et al. [32] nem talál egy linket erre az SNP és a GC azonban a vizsgálat során rs11614913 járt foka H. pylori katalógusa indukált mononukleáris sejtes beszűrődés. Érdekes módon, egy másik metaanalízis ugyanazon SNP nem határozza meg viszonyát rs11614913 és GC fejlesztés [35]. A vizsgálati eredmények azt összhangban vannak a következtetést az utóbbi meta-analízis nem tapasztaltunk szignifikáns összefüggést SNP miR-196a-2 katalógusa és GC kockázat. Katalógusa

polimorfizmusa miR-492 katalógusa (rs2289030) Feltételezik, hogy közvetítsen a rák kockázatát, de az adatok esetleges egyesületek erre SNP és a rák kockázata még mindig kevés. Egy tanulmány szerint Yoon és mtsai. (2012) nem talált összefüggést az SNP miR-492 katalógusa, és a kockázat vagy betegek túlélésének nem kissejtes tüdőrák [36]. Egy másik tanulmány végbélrák bebizonyította, hogy a progresszió-mentes túlélés a betegek kombinált miR-492 katalógusa CG és GG genotípus szignifikánsan rosszabb, mint a betegek a miR-492 katalógusa CC genotípus [13]. Eredményeink azt mutatják, hogy a rs2289030 miR-492 katalógusa, nem kapcsolódik a jelenléte GC vagy HRAG. A legjobb tudomásunk ez az első tanulmány, amely kapcsolatát vizsgálja miR-492 katalógusa SNP és premalignus gyomorrák feltételek vagy GC, és ezért nem lehet összehasonlítani a mi adataink is készülhet. Katalógusa

SNP miR-608 katalógusa (rs4919510) nem vizsgálták kapcsolatban GC kockázatok korábban. A tanulmány az első jelentést null társítást ezen polimorfizmus és a kockázat a GC vagy rosszindulatúvá válás előtti gyomor feltételeket. Colorectalis daganatos betegek rs4919510 szignifikánsan összefügg a rák kiújulásának és a halál [37]. Egy másik eset-kontroll tanulmány kolorektális rákban szenvedő betegeknél nem találtak társulás rák kockázatát, de az eredmények azt mutatták, hogy a GG genotípus együtt jár a halál kockázatának fehér lakosság és csökkent a halálozás kockázata az afrikai amerikaiak [38]. További nagyobb léptékű vizsgálatok esetleg milyen szerepet tölt be a miR-608 katalógusa rs4919510 SNP a gyomor és más rosszindulatú. Katalógusa

bél és diffúz-típusú GC kimutatták, hogy a különböző patogenetikai utak [3]. Egyes tanulmányok azt találták, hogy a miRNS polimorfizmusok esetleg eltérő hatást szövettani altípusa a GC. Miután rétegezésére betegek intesztinális és diffúz típusú GC csoportok, miR-499
rs3746444 kimutatták, hogy befolyásolja a kockázatot a diffúz típusú GC koreai populációban [21]. Bár az egyedszám belül bél és diffúz típusú GC csoportok között nem volt nagyon magas az általunk vizsgált, összehasonlító elemzés két különböző szövettani típusú GC végeztünk. Összességében miR-27a katalógusa, miR-146a katalógusa, miR-196a-2 |, miR-492 katalógusa és miR-608
SNP nem kapcsolódik a jelenléte a különböző szövettani altípusa a GC. Bár néhány ismertetett tendenciák az eredmények fejezetben már megfigyelhető a szövettani alcsoportja GC, a különbségek genotípus és allél frekvenciák nem érte el a kívánt szignifikancia szinten. Katalógusa

Munkánk eredménye egyértelműen támogatja a fontosságát gondos értékelése gén polimorfizmus különböző etnikai csoportok. Korábban azt miRNS kapcsolatos SNP nem mutatott jelentős GC különbség a mi európai népesség. Mindazonáltal el kell ismernünk, hogy vannak bizonyos korlátai kialakításával kapcsolatos vizsgálatunk. Voltak nemi megoszlás különbségek GC, HRAG és a kontroll csoportban; azonban, ha statisztikai elemzése azt szerepel a nemek, mint kovariáns, ezzel minimalizálva a potenciális hatását a nemek kimenetelére eredményeinket. Itt, ebben a tanulmányban összpontosított szövettani változások helyett jelenlétében H. pylori
; ezért további vizsgálatokat eltekintve IgG antitestek kimutatására ez a baktérium nem alkalmaznák. Továbbá azt is jól tudja, hogy a krónikus atrófiás gasztritisz által okozott H. pylori fertőzés
. Mi nem módosíthatja vagy a H. pylori katalógusa IgG antitestek, CagA katalógusa vagy VacA katalógusa állapot, mert ez az információ nem áll rendelkezésre az összes tantárgy. Nem tudtuk elvégezni társításelemzés SNP a miRNS-ek a túlélést a GC betegek, mivel az információ csak egy kis részét az alanyok. Ugyanaz az oka, hogy még nem végzett elemzésre szerint anatómiai helyét a gyomorban (proximális vs. disztális). Ebben a vizsgálatban végeztünk kizárólag gén polimorfizmus elemzés kezelése nélkül a miRNS expressziós különbségek a rákos és a nem rákos szöveteket, és ezért nem tudjuk tételezzük, ha ezek a polimorfizmusok volna egy funkcionális szerepet. További vizsgálatok szükségesek értékelték a SNP-k miRNS szinten GC szövetek és a potenciális célpont gének funkcionális vizsgálatok. Az egyedszám az alcsoportok tanulmányozásánál bél és diffúz típusú GC csoportok viszonylag kicsi, és lehet, hogy elegendők kimutatására specifikus egyesületek. Találtunk néhány különbség a miR-196a-2 és miR-608 SNP csoport közötti P katalógusa < 0,05; Úgy gondoljuk azonban, hogy nem tudunk beszámolni szignifikáns összefüggést, mivel nem érte el a korrigált P katalógusa értéket. Többszörös összehasonlítások genetikai asszociációs vizsgálatokat papírban alkalmazott, és hisszük, hogy fel kell használni a korrigált P katalógusa érték következtetések levonása. Katalógusa

Következtetések katalógusa

A tanulmány azt mutatja, a gén polimorfizmusok miR-27a katalógusa, miR-146a katalógusa, miR-196a-2 |, miR-492 katalógusa és miR -608 katalógusa nem járó kockázatot a GC-HRAG alanyok az európai származású. SNP nem jelennek meg, mint potenciális biomarkerek azonosítására egyének fokozott kockázata GC. Katalógusa

Köszönetnyilvánítás katalógusa

Szeretnénk megköszönni Lina Baldauskiene kiváló segítséget genotípus-kísérleteket a laborban. Katalógusa