A gyomorrák (GC) magas aránya a morbiditás és mortalitás között a különböző rákos megbetegedések világszerte. A fejlesztés a noninvazív diagnosztikai módszereket vagy technológiákat követés előfordulása GC sürgős, és keres megbízható biomarkerek van considered.This tanulmány célja, hogy közvetlenül felfedezni eltérés biomarkerek GC szövetek két dimenzió-eltérés gélelektroforézis (2D-DIGE), és további érvényesítésére fehérje expresszióját western blot (WB) és immunhisztokémiai (IHC) .Pairs GC szövetek (gyomorrák szövetek és a szomszédos normál szövetben) nyert műtét vizsgáltuk a 2D-DIEG.Five fehérjék wereconfirmed WB és IHC, beleértve a glükózt -regulated protein 78 (GRP78), a glutation s-transzferáz PI (GSTpi), az apolipoprotein AI (ApoAI), alfa-1 antitripszin (A1AT) és gastrokine-1 (GKN-1). Az eredmények között, GRP78, GSTpi és A1ATwere significantlyup szabályozott és lefelé szabályozni rendre gyomorrákos betegek. Sőt, GRP78 és Apo korreláltatták A1AT fehérje expressions.This tanulmány feltételezi, ezek a fehérjék jelöltek lehetnek megbízható biomarkerek gyomorrák. Katalógusa
Citation: Wu JY, Cheng CC, Wang JY, Wu DC, Hsieh JS Lee SC, et al. (2014) Discovery tumormarkerek gyomorrák által proteomikai. PLoS ONE 9 (1): e84158. doi: 10,1371 /journal.pone.0084158 katalógusa
Szerkesztő: Salvatore V. Pizzo, Duke University Medical Center, Amerikai Egyesült Államok katalógusa
Beérkezett: augusztus 19, 2013; Elfogadva: november 12, 2013; Megjelent: január 3, 2014 katalógusa
Copyright: © 2014 Wu et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa
Forrás: Ez a munka támogatott pályázatok NSC96-3111-P-042A-004-Y, NSC100-2314-B-037-040, valamint a Nemzeti Tudományos Tanács a kínai Köztársaság. Ez a munka is támogatta Kaohsiung Medical University Hospital (KMUH97-7R32, KMUH98-8R33). A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa
Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa
Bevezető
Bár theprevalence gyomorrák csökken és változó földrajzilag, továbbra is az egyik leggyakoribb daganatos megbetegedés ázsiai országok és a negyedik leggyakrabban előforduló rákos (9% az összes rák) világszerte. A korra standardizált incidencia aránya (ASR) nagyobb, mint 20 100000 a nagy kockázatú országokban, mint Kína, Japán és Korea [1], [2], [3]. Ugyancsak a második vezető daganatos halálok mindkét nemnél világszerte (737,000 haláleset 9,7% -a). Kelet-Ázsiában, a halálozás becsülték mintegy 28,1 100.000 férfiaknál és 13,0 100.000 nők, whilein Észak-Amerikában, ezek körülbelül 2,8 és 1,5 között [4]. Katalógusa
Az ötéves túlélési arány között mozgott 90% kevesebb, mint 5 százaléka, elsősorban attól függően, a színpadon a diagnózis [5], [6] .Ha gyomorrák is kimutatható és kezelhető a korai szakaszában, az ötéves túlélési rateis jobb, mint 90%; Azonban isno látszólagos vagy konkrét tünet a korai stádiumú gyomor cancer.Thus, korai detectionof gyomorrák becomesmore difficult.Although szérum pepszinogén (PG) testssuch alacsony PGI koncentráció és /vagy alacsony PGI /II arány voltak utaló szűrővizsgálatok nagy kockázattal rendelkező országok, mint Japán, azok weregood mutatók az atrophiás gastritis helyett diagnosztikai markersof gyomorrák [7] - [9] .Essentially, endoszkópia beenthe ígéretes eszköz 2,7-4,6-szer nagyobb, mint az észlelési arány bárium tanulmányok [10]. Azonban a korai gyomorrák diagnózist endoscopydependson szakmai készség. Katalógusa
Néhány nem-invazív biomarkerek diagnózis vagy nyomon követés a gasztrointesztinális és máj tumorshave számoltak be. Például az alfa-fetoprotein (AFP) egyike a klinikailag hasznos biomarkerek diagnosztizálására és nyomon követését a hepatocelluláris karcinóma (HCC) .AFP emelkedett volt felett 20 ng /ml egy vizsgálatban több mint 70% -ánál a HCC [11]. Következtetései szerint a Barcelona-2000 Európai Szövetség a tanulmány a Liver (EASL) konferencián, HCC lehetne diagnosztizálni nélkül biopsyin az esetekben, amikor az AFP nagyobb, mint 400 ng /ml, a góc nagyobb, mint 2 cm, bizonyító artériás hypervascularization cirrhosisban szenvedő betegek [12] .Incolorectal carcinoma (CRC), preoperatív karcinoembrionális antigén (CEA) szintje erősen szignifikáns prognosztikai kovariáns és ajánlott az American Society of Clinical Oncology (ASCO), hogy meg kell vizsgálni, hogy a műtét előtt nyújtanak prognosztikai információt [13]. Soros emelkedés CEA jelzik nagyobb lehetőségét megismétlődésének CRC. Azonban nincs megbízható biomarker gyomorrák. Katalógusa
Ezért keres megbízható biomarkerek gyomorrák nagyon fontosak a klinikai gyakorlatban. Ez a tanulmány célja, hogy fedezze megbízható fehérje biomarkerek illesztett szövetekben (a tumor és a szomszédos normális szövetekben) két-dimenzió-különbség gél elektroforézissel (2D-DIGE), és azonosítja a fehérjék által mátrix-segített lézer deszorpciós /ionizációs képalkotó tömegspektrometria (MALDI -IMS). katalógusa
anyagok és módszerek katalógusa
A szövetminták
A szövettani mintákat után kapott tájékoztatja hozzájárul írtak alá. Páros samplesincluding tumor és szomszédos normál tissuesfrom beteget származó endoszkópos biopsziás vagy surgery.The tumor fokozat szerint határoztuk meg az amerikai vegyes bizottság Cancer Staging (AJCCS) rendszer a patológusok szerint metilénkék staining.Clinical információt a betegek került rögzítésre, ideértve életkor, a nem, a daganat típusa, invázió és a túlélés. Továbbá, a CEA szérum is mérhető radioaktív immunoassay rutin orvosi diagnosis.The individualsenrolled a jelen tanulmányban adott írásos beleegyezését adta, hogy tegye közzé ezeket az esetben details.This jóváhagyta a vizsgálatot az intézményi Review Board Kaohsiung Medical University Chung- Ho Memorial Hospital (KMUH-IRB-980382). katalógusa
Két dimenzió-különbség gélelektroforézis katalógusa
Egy (1. táblázat) pár szövetminták washomogenized (PRO 200, Bertec, Tajvan) a mérsékelt mennyiségű lízis pufferben (50 mM Tris-HCl, 8M karbamidot, 4% -os (w /v) 3 - [(3-kolamido-propil) -dimetil-ammónio] -1-propánszulfonát, és pH = 8,5). Az egyes 50 pg mintát fehérje jelzett 400 pmol Cy3 vagy Cy5-külön 30 percig (ábra. 1B). Ezen túlmenően, az egyesített mintában keverék (100 ng) jelöltük 800 pmol Cy2 belső standard egyidejűleg. Ezt követően a címkézés reactionswere inkubálással leállítjuk 1 ul 10 mmol lizin pufferben 30 percig, majd egy-szeres térfogatú minta pufferrel (8 M karbamid, 20 mM ditio-treitol, 4% -os (w /v) 3 - [(3 -Cholamidopropyl) -dimetil-ammónio] -1-propánszulfonát, 0,5% (v /v) IPG puffer és kevés brómfenolkék) adunk added.The első szeparációs, izoelektromos fókuszálás, végeztünk sapka a gélre csíkokat (7 cm, pI 4- 7) 20 ° C alatt tartva 15000voltage óra (IPGphor rendszer, GE Healthcare). Kiegyenlítés után nátrium-dodecil-szulfát, a második separationwas végzett using4-12% -os nátrium-dodecil-szulfát-poliakrilamid gél-elektroforézissel. A gél kép szerzett (Typhoon TRIO Variable mód Kamera, GE Healthcare) segítségével 488, 532 és 633 nm-es lézerek emissziós filter 520, 532 és 670 nm volt. Az összes kép elemeztük DeCyder 6.5 szoftver (GE Healthcare) válassza ki a differenciál fehérjék wereselected függően onthe elhelyezés alatt jelentős értéke 0,05 szerint Student t katalógusa -teszt. A géleket megfestettük Sybro Ruby (Sigma) ezt követően a festéket eltávolítjuk, 10% metanolt és 7% ecetsav ionmentesített vízzel pontosan 30 percen keresztül látható foltok gélek alatt UV átvilágító (Spectroline) voltak használt ásni az érdekes fehérjéket manuálisan. Ezek a gélrészecskék mostuk 100 ul 25 mmol-os ammónium-hidrogén-karbonát 50% -os acetonitril 15 percen keresztül, majd mossuk 200 ul 25 mmol-os ammónium-hidrogén-karbonát ionmentesített vízben 15 percig kétszer, és ezt követően, ahhoz, acetonitrilt adunk hozzá, hogy összezsugorodik a gél részecskéket. Szárítás után le, az egyes gél particleswereincubated 3 pl 20 ng /jil tripszin 25 mM ammónium-hidrogén-karbonát, 4 ° C-on 1 órán át és ezt követően 3 ul 25 mM ammónium-hidrogén-karbonátot adunk megemészteni a fehérjéket 56 ° C-on 1 óra. Miután In-gél emésztést, 2 ul 100% acetonitril, amely 1% trifluor-ecetsavat adunk az oldatok, majd a mintákat 10 percig ultrahanggal kezeltük, hogy kiadja peptidek gél részecskéket. Valamennyi protein oldat tripszinnel emésztjük kevertünk 1:01 10 mg /mlof α-ciano-4-hidroxi-fahéjsav feloldunk 50% acetonitril /0,1% trifluor-ecetsav, és cseppentünk AnchorChip MALDI cél (Bruker Daltonics GmbH , Bréma, Németország), amíg száraz. A peptideket MALDI-TOF /TOF UltraflexIII (Bruker Daltonics) 20 év alatti KV pozitív modellt, és a csúcs átkerültek FlexAnalysis ™ 3.0 szoftver (Bruker Daltonics) fejlett számítási és kalibrálás. MASCOT 2.2 (Mátrix Science) arra használták, hogy megfeleljen a peptidek NCBI vagy Swiss-Prot adatbázis fehérje azonosítása. A beállítás volt korlátozva emberi taxonómia parameters.Meanwhile, carbamidomethyl cisztein használták, mint a fix módosítás, és oxidált metionint, ami egy változó módosítással. Annak a valószínűsége, (P) alapult mowse pontszámától -10 × Log (P). Fehérje pontszám nagyobb, mint 56 volt szignifikáns ( p A párok a szöveti mintákat homogenizáltunk (Pro 200, Bertec) a lízis pufferben (10 mM nátrium-foszfát, 0,9% nátrium-klorid, 1% Triton-X100, pH = 7,4), és inkubáltuk rázatás mellett 4 ° C-on 1 órán át. Miután megszabadulni a kicsapódott pelletek által nagy sebességű centrifugálással (10000 rpm, 5 perc), a pipettázott felülúszókat adunk mintapufferben (10 mM nátrium-foszfát, 0,9% nátrium-klorid, 8 M karbamid, 30% glicerin, 2 % -os nátrium-dodecil-szulfát, 0,1% β-merkapto-etanol és 0,1% brómfenolkék) által 1: 1 arányban és a főtt át 100 ° C-on 5 percig fehérje denature.Approximately 20 ug az egyes minták protein vittünk fel az egyes rács 4- 12% -os nátrium-dodecil-szulfát-poliakrilamid gél elektroforézissel (SDS-PAGE, Invitrogen). A iblot száraz blot rendszer (Invitrogen) használtuk átalakítják a fehérjék polivinilidén-fluorid (PVDF) membránon alapuló ion mentén áramló egy réz elektróda. Miután a 0,5% -os tej blot a PVDF membránra, 30 percig, theindividual primer antitestet (2 ng /ml) adtunk inkubálást 2 órát rázás. A következetes másodlagos antitestekkel konjugált torma-peroxidáz (HRP) (2 ng /ml) 1 órán keresztül inkubáltuk a rázás egymás után. Között inkubáljuk folyamatok repeatedlywashings által PBS pufferrel (10 mM nátrium-foszfát, pH = 7,4 és 0,9% nátrium-klorid) weredone. Az ECL kimutatási rendszert (Millipore) végeztük, és a képek által megszerzett Imaging System (Gel Doc XR rendszer, Bio-Rad), attól függően mérsékelt feltárása időben. Katalógusa Az immunhisztokémiai katalógusa immunhisztokémiai performedusing egy szabványos peroxidáz-alapú festési eljárással. A szöveti mintákat vágott egy kriosztát (HM525, mikrom) .Fresh szöveti szakaszok (10 um) a lizinnel bevont lemezeket driedon egy fűtőberendezés 37 ° C hőmérsékleten, és egymás után merítjük szekvenciális 75%, 95% és 100% -os etanolban 1 perc fehérje rögzítést. Röviden, az endogén peroxidáz aktivitást leállítottuk 3% -os hidrogén-peroxid 10 percig. Az antigént epizód volt téve merítve a szövetet dia 10 mM citrát-sav belül forrásban lévő vízben 25 percig. Az egymást követő inkubáció az egyes primer antibodyandthe HRP-konjugált másodlagos antitestekkel végeztük az egyes 1 óra rázás. Az AEC készlet (Sigma) használtunk a folt a szöveteket, és a művelet követ a csatolt kézikönyvben. Röviden, themixed oldatot 2,5 M acetát puffert AEC kromogén (3-amino-9ethylcarbazole) és 3% hidrogén-peroxidot wasperformed azonnal és egymás után inkubáltuk szövet slides.The kép festődés tárgylemezeket figyeltek meg, és keretében szerzett mikroszkópiával (BX51, Olympus) . Statisztikai elemzés katalógusa a statisztika szoftver SPSS végeztünk kiszámításához a szignifikancia Student t katalógusa próba és korreláció között GRP78, GSTpi, A1AT, Apo és GKN- 1. A significantdifference ( p katalógusa érték) volt elfogadható, mivel kevesebb, mint 0,5. Katalógusa Eredmények katalógusa A biomarkerek felfedezése alapján 2D-DIGE katalógusa A gyomorrák szöveteket vizsgáltak 2D-DIGE és összehasonlítva párosított normál szövetekben keresni a feltételezett biomarkerek gyomorrák. Különbségek proteinexpressions nagyobb, mint 1,2-szeres volt vélt jelöltek. A gélt kép volt bemutatása fehérjék helyen jelzett CY-színezékek (ábra. 1). Tizenöt fehérjék lehetett azonosítani, beleértve a glükóz-szabályozott fehérje 78 (GRP78), hősokk rokon 71 kD-os protein (HSC70), a protein diszulfid-izomeráz A3 (PDIA3), mitokondriális ATP-szintáz-alegység a béta (ATPB), a protein diszulfid izomeráz-rokon fehérje 5 (PDIRP5), gastricsin, glutation-s-transzferáz PI (GSTpi), az apolipoprotein AI (ApoAI), alfa-1 antitripszin (A1AT) és gastrokine-1 (GKN-1) .A 3 duplikált ismétlődik, néhány azonos fehérjéket találtak különböző helyeken gél és zárva a gyanúja poszt-transzlációs módosítás. Végül öt proteinek, köztük GRP78, GSTpi ApoAI, A1AT és GKN-1-et és megerősített érvényesíteni, feltételezett markereket gyomorrák. A részletes összehasonlítást által stereopicture és kibővített gél imageswere a 2. ábrán látható Western blot és a statisztikai elemzést Twelvepairs származó szövetek gyomor rákos betegek használtunk érvényesítés csoport. Négy beteg I. stádiumú volt, 3 betegnél volt szakasz II 2 beteg stádiumú, 3 beteg volt színpadi IV. A klinikai információt táblázatban felsorolt 1.five a fehérjék (grp78 GSTpi ApoAI, A1AT és GKN-1) is megerősítette Western blotting.Amongthe eredményeket, GRP78 és GSTpiwere significantlyup szabályozott míg A1AT szignifikánsan down-szabályozott gyomor- rákos szövet a normális szövetekhez képest (3.) .A GSTpi, nineout 12 betegnél (75%) volt up-szabályozott fehérje kifejezések tumortissues; Másrészről, 10 12 betegnél (83%) leszabályozó A1AT fehérje expression.Regarding közötti kapcsolat fehérjék expressziója és a klinikai szakaszban, GRP78 van egy tendencia, hogy emelkedik az I. szakaszban a színpadi IValthough statisztikai szignifikancia nem találtak. A kifejezés a GSTpi és A1 AT nem korrelált a klinikai szakaszában (4. ábra). Érdekes, hogy a fehérje kifejezésére GRP78 ezekben pár szövetek megfelelt hogy az Apo Al (R 2: -0,61, p katalógusa < 0,01) és A1 AT (r 2: -0,49, p katalógusa < 0,05) (ábra. 5). Eközben a fehérje kifejeződését Apo korrelált hogy A1AT (r 2: 0,62, p katalógusa < 0,01, Fig. 4). Az eredmények azt mutatták, hogy ezek a három feltételezett biomarkerek, GRP78 ApoAI és A1AT, társultak egymással a fehérje expresszióját. A kontraszt, GSTpi és GKN-1 függetlennek tűnt a fehérje expresszió. DespiteGRP78, GSTpi és A1AT lét statisticallydifferent jelentősen, az expressziós trend más fehérjék ugyanaz volt, mint a megfigyelés a 2D-DIGE kísérlet. Az immunhisztokémiai használták, hogy érvényesítse a megszerzett eredmények a Western blot kísérletben. Grp78 GSTpi ApoAI, GKN-1, és A1AT validálták a gyomorrák szövetek és nem-rákos szövetekből ábra 6.A fehérje kifejezések párban a szövetek összhangban voltak a megfigyelés Western-blottal. Különösen, a fel-szabályozott fehérjéket, GRP78 és GSTpi, specifikusan található a gyomor adenokarcinóma sejtekben. Másrészt, a lefelé szabályozott proteinek, köztük Apo Al és A1AT volt jelen a normál gyomor mirigyek. Egy másik leszabályozott fehérje, GKN-1-ben jelenik meg, ami megjelent a nyálkahártya a gyomor szöveteit. Katalógusa Vita katalógusa Fontos, hogy biomarkerek diagnosztizálására és nyomon követése gyomor cancer.However, karcinoembrionális antigén (CEA), szénhidrát antigén (CA19-9) és CA72-4 nem általánosan használt klinikai practices.The jelen tanulmány célja, hogy hozzák nyilvánosságra vélt biomarkerek összehasonlításával eltérés fehérjék között párosított rákos és normál szövetekben. Ezután ezeket a feltételezett biomarkerek vizsgáltuk érvényesítés group.Five feltételezett proteineket, beleértve a grp78 GSTpi ApoAI, A1AT és GKN-1, azonosítottuk két-dimensiondifference gél elektroforézissel (2D-DIGE), andmatrix-segített lézer deszorpciós /ionization- képalkotó tömegspektrometria (MALDI-IMS) és fatherlyvalidated 12 klinikai patients.Among öt feltételezett proteineket, GRP78 és GSTpi szignifikánsan serkentő szabályozás és különösen fokozott a rákos sejtek western blot és immunohistochemistry.In szemben A1AT wassignificantlydown szabályozott és pozitív és negatív korrelációt a kifejezés a Apo Al és GRP78. Számos feltételezett biomarkerek gyomorrák javasoltak már a korábbi studies.High szintek GSTpi a gyomor-karcinómák kimutatták [14] .A kifejezései GSTpi is korrelált gyomor rák stagewhere emelkedett GSTpi werefound 50% szakaszokban I vagy II, és 80% -os szakaszokban a III vagy a IV gyomorrákos betegek [15] .A korábbi tanulmány kimutatta, hogy a GSTpi-pozitív betegek kevesebb ötéves betegségmentes túlélés aránya (49,0%), mint a GSTpi-negatív betegeknél (75,0%), a megadott GSTpi volt marker prognosztikai jelentősége [16] .A jelen tanulmány túlzott kifejeződése GSTpi 75% gyomorrákos betegek is demonstrated.However, mértékét túlzott expressziójának GSTpi nem korrelált a klinikai szakaszban (ábra. 4). Katalógusa Túlzott expressionof GRP78 fehérjét is jelentették a feltételezett biomarker gasztrointesztinális cancers.GRP78 túlzott kifejezéseket lehet kimutatni, és kapcsolódik a színpad és a prognózis a nyelőcső adenocarcinoma [17], és a vastagbélrák [ ,,,0],18]. Ez az egyik a celluláris stressz fehérjék fontos szerepet játszanak a tumor biológia, mint például apoptózis szabályozása és fenntartása az intracelluláris kalcium egyensúly [19], [20]. Azt is jelentették, hogy a túlzott megnyilvánulásai GRP78 immunhisztokémiai gyomorrák példányok és áttétes nyirokcsomókat fordítottan arányos a betegek túlélését [21]. Ugyanakkor az alkalmazott módszerek a jelen vizsgálatban eltér Zhang jelentését. Mi feltárt jelölt fehérjék 2D-DIGE elválasztásához eltérés fehérjék és MALDI-TOF /TOF azonosítani peptidek párosított rákos és normál tissues.In Vizsgálatunkban a overexpressziója GRP78 növeltük, és volt egy tendencia az összefüggést a klinikai szakaszban, bár nincsenek statisztikai jelentősége van, mivel a korlátozás a esetszám. katalógusa down-regulációja fehérjék fontos szerepet játszanak a kialakulásában. A jelen vizsgálatban, három fehérje ApoAI, A1AT, és GKN-1, arra alulszabályozott a szokásos gyomor szövetek képest gyomorrák tissues.The kapcsolat Az Apo Al és a gyomorrák még nem számoltak be. Apo Al egyike a fő protein összetevői nagy sűrűségű lipoprotein koleszterin (HDL-C) és játszik elsődleges szerepet játszik a koleszterin transzportban és atheroprotektív hatása a HDL-C [22] .Apolipoproteins mint például Apo Al modulálhatja lipopoliszacharid-inducedinflammatory válasz szepszis [23]. A jelen vizsgálatban, lehetséges, hogy a csökkent Apo Al tükrözi krónikus gyulladás, amely egy oka a karcinogenezis. További vizsgálatok szükségesek annak bizonyítására közötti kapcsolat csökkenése Apo és disz-rendeletre gyulladás. Katalógusa Bár nőtt A1AT kezdeti szakaszában, és összefüggést a haladás gyomorrák szakaszában volt megfigyelhető Bernacka K. et al. [ ,,,0],24], korlátozott adatok is megvilágítani fokozott A1AT, mint egy tumormarker a gyomorrák. Ehelyett csökkent A1AT gyomorrákban találtak a vizsgálatba. A1AT rendelkezik gyulladásgátló hatással, in vitro, és hozzájárul a elnyomása proinflammatorikus citokin szintézis, például az interleukin-8, TNF-alfa, az interleukin-1 béta [25]. Leírták, hogy a befogadó genetikai tényezők, amelyek befolyásolják az interleukin-1-béta meghatározhatja a betegség fenotípusát H. pylori fertőzés [26]. Lehetséges, hogy a csökkent A1AT gátolja proinflammatorikus citokin elnyomás hatása. [25]. Tanulmányunkban a korreláció csökkent A1AT és ApoA1 feltételezték, jelzi a krónikus gyulladás. Katalógusa Gastrokine-1 (GKN-1), amelyek bizonyos mitogén hatással bélhámsejtek (IEC-6), csökkent -regulated a gyomorrák szövet képest kiegyenlített normál gyomornyálkahártya a vizsgálatba. Gyomornyálkahártya helyreállítás sérülés után akadályozhatja, ha GKN-1 alulszabályozott [27], [28] .Ez Leírták, hogy GKN1 kapcsolódik apoptotikus jeleket, amelyek fontosak a szövet-helyreállítás során a neoplasztikus transzformáció [29]. Az adatokat a jelen tanulmány azt is sugallja, csökkent GKN-1 megtalálható a gyomorrák szövetekben. Proteomika-alapú módszer azonosítására apoptózissal kapcsolatos fehérjék gyomorrák korábban jelentett Bai Z. és munkatársai [ ,,,0],30] .Nevertheless, differenciális expressziója fehérjék a jelen tanulmány nem voltak azonosak a Bai jelentése arra utal, ENO1, grp78 GRP94, PPIA, PRDX1 és PTEN mint potenciális gyomorrák biomarkers.Regarding fejlődésének gyomorrák, ez egy bonyolult folyamat, és a kiállítási közötti kölcsönhatások fogadó, a környezet, és a baktériumok, mint a Helicobacter pylori katalógusa .A egyetlen tényező vagy fehérje nem tudja megjósolni előfordulása és progressziója gyomorrák. A jelen vizsgálatban, öt feltételezett fehérjéket találták, hogy differenciálisán kifejezve párosított szövetekben (a tumor és a szomszédos normális szövetekben). Ketten (GRP78 és GSTpi) volt akár szabályozott, és a többiek (Apo, A1AT, és GKN-1) leszabályozott. További vizsgálatok szükségesek, hogy tisztázzák theseproteins asbiomarkers detektálására gyomorrák. Katalógusa
-gel tripszines emésztés
tömegspektrometriás elemzés fehérje azonosítása
< 0,05). Sőt, az egyik fő peptid csúcsokat megjelenő spektrum arra használták, hogy erősítse meg a azonos eredményt azonosításával az aminosavszekvenciát, amely az úgynevezett peptid-fragmens-ujjlenyomat eljárással.
Western blot
Immunhisztokémia