Les saccharibactéries au sein d'un hôte mammifère sont plus diversifiées que jamais prévu,

montre l'étude Dans ta bouche en ce moment, il existe un groupe de bactéries dont les plus proches parents peuvent également être trouvés dans le ventre d'un orignal, chez les chiens, chats, et les dauphins, et dans les eaux souterraines profondément sous la surface de la Terre. Dans une découverte étonnante, les scientifiques ont découvert que ces organismes se sont adaptés à ces environnements incroyablement diversifiés, sans changer radicalement leur génome.

Les organismes sont membres du TM7, ou Sacchraribactéries, phylum. Ce sont des ultra-petits, bactéries parasitaires avec de petits génomes qui appartiennent à un groupe plus large appelé le Candidate Phyla Radiation (CPR).

Ces bactéries CPR sont de mystérieuses « matières noires » qui représentent plus de 25 % de toute la diversité bactérienne, pourtant nous en savons très peu sur eux puisque la grande majorité reste inculte.

Dans la recherche publiée pour la première fois en tant que pré-impression en 2018, et maintenant officiellement dans le journal Rapports de cellule , les scientifiques décrivent leurs découvertes selon lesquelles les saccharibactéries au sein d'un hôte mammifère sont plus diversifiées que jamais prévu.

Les chercheurs ont également découvert que certains membres de la bactérie se trouvent dans la cavité buccale des humains, les entrailles des autres mammifères, et dans les eaux souterraines.

Bien que ces environnements soient tous très différents, les minuscules génomes de la bactérie restent peu modifiés entre les humains et les eaux souterraines. Cela indique que les humains ont acquis la bactérie plus récemment, sur une échelle de temps évolutive.

"C'est la seule bactérie que nous connaissons qui n'a pratiquement pas changé lorsqu'elle s'est adaptée à l'homme, " a déclaré le Dr Jeffrey Scott McLean, microbiologiste et professeur agrégé de parodontie à la faculté de médecine dentaire de l'Université de Washington, et auteur principal de l'article.

La bactérie TM7 était un mystère complet pour les scientifiques jusqu'à ce que le Dr Xuesong He, Membre associé du personnel du Forsyth Institute et co-auteur de l'article, a d'abord isolé la bactérie TM7x, membre du CPR, en 2014.

Depuis, les chercheurs ont appris que la RCR comprend un grand nombre de bactéries différentes, tous avec de petits génomes. Ces bactéries ont besoin d'un hôte pour survivre et sont uniques en ce sens qu'elles ne peuvent pas fabriquer leurs propres acides aminés et nucléotides, qui sont des éléments essentiels à la vie.

Je vois cela comme une énorme découverte. Cette créature survit à la fois dans les humains et dans les eaux souterraines, ce qui indique qu'il existe des similitudes qui permettent à ces bactéries de s'adapter à l'homme."

Wenyuan Shi, Co-auteur de l'étude, PDG, et directeur scientifique, Institut Forsyth

Recherches antérieures du Dr Batbileg Bor, Membre adjoint du personnel de l'Institut Forsyth et co-auteur de l'article, ont montré que TM7 peut facilement passer d'un hôte bactérien à un autre. Cela pourrait expliquer comment ils se sont retrouvés chez les mammifères, puisque les mammifères boivent les eaux souterraines.

"La raison la plus probable pour laquelle nous voyons une grande diversité de ces bactéries chez l'homme, pourtant, un groupe de bactéries reste presque identique à ceux des eaux souterraines, est que certains groupes ont été acquis chez d'anciens mammifères apparentés et qu'ils se sont étendus au fil du temps à travers les mammifères, alors que ce groupe très similaire a plus récemment sauté directement dans les humains, " a déclaré McLean.

TM7 et autres ultra-petits, les bactéries parasitaires au sein de la RCR peuvent jouer des rôles importants dans la santé et les maladies que nous n'avons pas encore découvert. Puisqu'ils agissent comme des parasites - vivant avec et tuant d'autres bactéries - TM7 pourrait changer le microbiome global en modulant l'abondance des bactéries, dit McLean.

Les scientifiques ne font qu'effleurer la surface pour comprendre à quel point notre microbiome a un impact sur notre santé globale.

Une autre contribution majeure de cette recherche a été de développer un moyen systématique de nommer ces bactéries nouvellement découvertes, jeter les bases de la classification future d'autres souches isolées.

Le fait que les humains aient acquis TM7 récemment est une découverte qui a des implications plus larges pour comprendre nos voies de co-évolution avec les microbes qui vivent sur et en nous.

"Il n'y a que quelques centaines de gènes qui diffèrent dans ces ultra-petites bactéries entre ce qui vit profondément dans l'environnement souterrain et ceux qui sont devenus des bactéries courantes dans notre bouche, " a déclaré McLean. " C'est un exploit remarquable pour les bactéries manquant tant de gènes. "

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