Les patients qui suivent un traitement antibiotique sont particulièrement sensibles car les micro-organismes qui maintiennent un intestin sain sont fortement endommagés par les antibiotiques.
Le traitement de la rCDI implique l'arrêt des antibiotiques en cause et l'instauration d'une antibiothérapie, bien que cela puisse être très difficile. La greffe de microbiote fécal (FMT) est considérée comme une thérapie alternative efficace car elle résout le problème de fond en comble en remplaçant la microflore endommagée par une microflore saine grâce à une greffe de selles.
Cependant, deux décès causés par des infections bactériennes résistantes aux antibiotiques après FMT ont été signalés en 2019, suggérant qu'une modification de la FMT ou des alternatives sont nécessaires pour résoudre les problèmes de sécurité entourant le traitement.
Chercheurs de l'Université de la ville d'Osaka et de l'Institut des sciences médicales, L'Université de Tokyo a relevé ce défi de front dans une grande étude maintenant publiée en gastro-entérologie.
En utilisant leur pipeline d'analyse d'origine signalé en 2020, les chercheurs ont obtenu des informations sur le métagénome bactérien et viral intestinal à partir d'échantillons fécaux de neuf patients atteints de rCDI du Brigham and Women's Hospital de Boston qui ont subi avec succès une FMT. Ils ont révélé les bactéries et les phages impliqués dans la pathogenèse du rCDI et les voies remarquables importantes pour la récupération de la fonction de la flore intestinale.
En révélant comment le bactériome et le virome dans l'intestin fonctionnent ensemble comme un organe, l'équipe de recherche a pu montrer comment la FMT peut être aussi sûre que de remplacer un mauvais organe par un bon.
Le microbiote intestinal doit absolument être traité comme un « organe ». FMT a radicalement changé le bactériome et le virome intestinaux et est sûr de restaurer les fonctions bactériennes et virales intestinales. »
Satoshi Uematsu, Professeur et chercheur principal, Université de la ville d'Osaka
Dans le monde post-COVID-19, La rCDI deviendra l'une des maladies internationales les plus urgentes. Il ne fait aucun doute que la FMT est une stratégie thérapeutique importante pour le rCDI. "En plus d'une variété d'enquêtes cliniques, une analyse métagénomique complète est très importante pour considérer la sécurité de la FMT. " déclarent le Dr Kosuke Fujimoto et le professeur Seiya Imoto.