PLOS ONE: La réparation de l'ADN Gene APE1 T1349G Polymorphisme et risque de cancer gastrique dans une population chinoise

Résumé

Contexte

apuriniques /endonucléase apyrimidiniques 1 ( APE1
) a un rôle central dans la réparation des sites apyrimidic apuriniques à travers ses deux endonucléase et ses activités de phosphodiestérase . Une commune APE1 de la polymorphisme, T1349G (rs3136820), a déjà été démontré être associé au risque de cancer.

Objectif

Nous avons supposé que le APE1
T1349G polymorphisme est également associée à un risque de cancer de l'estomac.

Méthodes

Dans une étude cas-témoins en milieu hospitalier de 338 cas patients atteints de cancer gastrique nouvellement diagnostiqués et 362 témoins sans cancer fréquence appariés selon l'âge et le sexe, nous génotypage du polymorphisme T1349G et évalué ses associations avec le risque de cancer de l'estomac.

par rapport à la APE1
génotype TT, individus

Résultats avec la variante TG génotypes /GG avaient un risque significativement accru de cancer gastrique (odds ratio = 1,69, intervalle de confiance à 95% = 1,19 à 2,40), ce qui était plus prononcée chez les sous-groupes de âgés de ≤60 ans, de sexe masculin, déjà fumé, et toujours buveurs. D'autres analyses ont révélé que les variantes de génotypes ont été associés à un risque accru de type diffus, une faible profondeur de l'infiltration de la tumeur (T1 et T2), et le cancer gastrique des ganglions lymphatiques de la métastase.

Conclusions

Le T1349G le polymorphisme de APE1 peut être un marqueur pour le développement du cancer gastrique dans la population chinoise. Des études plus importantes sont nécessaires pour valider ces résultats dans les diverses populations

Citation:. Gu D, Wang M, Wang S, Zhang Z, Chen J (2011) La réparation de l'ADN Gene T1349G Polymorphisme
APE1 et le risque de cancer gastrique dans une population chinoise. PLoS ONE 6 (12): e28971. doi: 10.1371 /journal.pone.0028971

Editeur: Paolo Peterlongo, IFOM, Fondazione Istituto di Oncologia FIRC Molecolare, Italie

Reçu le 19 Octobre 2011; Accepté le 18 Novembre 2011; Publié: 19 Décembre, 2011

Droit d'auteur: © 2011 Gu et al. Ceci est un article en accès libre distribué sous les termes de la licence Creative Commons Attribution, qui permet une utilisation sans restriction, la distribution et la reproduction sur tout support, à condition que l'auteur et la source originelle sont crédités

Financement:. Cette étude a été en partie soutenu par la national science Foundation naturel de Chine (81071641), la Fondation des sciences naturelles de la province du Jiangsu (BK2010120), et le projet des sciences et de programme de Nanjing (201001099). Les bailleurs de fonds ont joué aucun rôle dans la conception de l'étude, la collecte et l'analyse des données, la décision de publier, ou de la préparation du manuscrit

Intérêts concurrents:.. Les auteurs ont déclaré aucun conflit d'intérêts existent

Introduction

le cancer gastrique est le quatrième cancer le plus fréquent et la deuxième cause de décès liés au cancer dans le monde entier, environ 700.000 personnes meurent de ce cancer chaque année, et environ 1,1 millions de nouveaux cas sont attendus en 2010 [1]. En Chine, il a été prédit pour se classer comme le troisième cancer le plus fréquent en 2005, avec 0,3 millions de morts et 0,4 millions de nouveaux cas de cancer gastrique [2]. Bien qu'il est bien connu que les facteurs environnementaux, les habitudes alimentaires, et l'infection de Helicobacter pylori sont associés au risque de cancer de l'estomac, l'hôte des facteurs génétiques peuvent être l'un des agents les plus critiques dans la carcinogenèse gastrique. Présentation du cancer gastrique chez les jeunes patients est souvent associée à regroupement familial [3].

lésions de l'ADN induites par des carcinogènes exogènes ou par des processus métaboliques endogènes peut être converti en mutations génétiques conduisant à une instabilité génomique et la transformation maligne [4] . Les variations génétiques dans les gènes de réparation de l'ADN peuvent moduler la capacité de réparation d'ADN et, par conséquent, de modifier le risque de cancer. Environ 150 gènes de réparation d'ADN humains ont été identifiés aux données [5]. Ils coopèrent dans des voies distinctes qui sont spécialisés dans la réparation des différents types de dommages à l'ADN [6], [7]. Parmi ces voies, la voie excision de base de réparation (BER), qui gère probablement le plus grand nombre de lésions cytotoxiques et de base mutagène, a été associée à un risque de cancers [8].

Le endonucléase apurinique /apyrimidiniques humaine ( APE), APE1
(également connu comme APE
, APEX
et REF-1
), est impliqué dans la voie de BER [9 ]. Le gène APE1 de est situé sur le chromosome 14q11.2-q12, et se compose de cinq exons couvrant 2,21 kb. Par hydrolyser 3'-blocage des fragments de l'ADN oxydé, APE1
produit des extrémités nucléotidiques 3'-hydroxyles normales qui sont nécessaires pour la synthèse de réparation d'ADN et la ligature à simple ou cassures double brin [10], [11] . Un total de 18 polymorphismes dans APE1
ont été rapportés [12], mais le polymorphisme le plus étudié est le T à G transversion (T1349G, également connu sous le nom Asp148Glu, rs3136820).

Récemment , nous avons effectué une méta-analyse sur l'ensemble des études cas-témoins admissibles pour estimer le T1349G le polymorphisme de APE1 et risque de cancers, y compris le cancer du poumon, le cancer de la vessie, le cancer colorectal, le cancer du sein, le cancer du pancréas, la tête et le cancer du col, une leucémie, un cancer de l'oesophage, le cancer du tractus biliaire, le cancer de la thyroïde, et le cancer de la prostate [13]. Nous avons constaté que les APE1
T1349G variantes génotypes ont été associés à une augmentation modérée du risque de tous les types de cancer (OR = 1,08, IC à 95% = 1,00 à 1,18 dans un modèle dominant), ce qui suggère que ce polymorphisme est faible -penetrance facteur de risque pour le développement du cancer [13]. Plus récemment, certaines études ont rapporté la T1349G le polymorphisme de APE1 a été associé à un risque gastrique de cancer et le pronostic [14], [15], [16], [17]. Cependant, ces résultats épidémiologiques demeurent contradictoires plutôt que concluante.

Dans la présente étude, pour étudier l'effet du polymorphisme T1349G
APE1 sur le risque de cancer de l'estomac, nous génotypage du polymorphisme et évalué l'association entre le T1349G le polymorphisme de APE1 et le risque de cancer de l'estomac dans notre, en milieu hospitalier, étude cas-contrôle permanent dans une population chinoise.

Ethique Déclaration

le comité d'éthique de l'Université médicale de Nanjing a approuvé le protocole de recherche. Au cours des entretiens épidémiologiques, le consentement éclairé a été donné à tous les sujets. En outre, le personnel de recherche formé administré un questionnaire standard pour obtenir des informations sur les caractéristiques démographiques.

Les sujets

Les méthodes détaillées de sujets d'étude de recrutement pour cette étude ont été décrites précédemment [18]. En bref, 338 nouvellement diagnostiqué, histopathologique a confirmé les patients atteints de cancer gastrique et 362 sujets témoins sans cancer ont été recrutés dans les villes de Yangzhong et Yixin, deux régions de forte incidence et le taux de cancer de l'estomac dans la province du Jiangsu de la Chine de mortalité entre Mars 2006 et Juillet 2008 . Les critères d'exclusion comprenaient le cancer précédent, métastasés d'origines autres ou inconnues, et la radiothérapie ou une chimiothérapie antérieure. Les contrôles ont été fréquence adaptés aux cas par âge (± 5 ans) et le sexe. Les sujets témoins sans cancer ont été recrutés parmi ceux qui cherchaient des soins de santé, vivant dans les mêmes zones résidentielles. Avant le recrutement, le consentement éclairé a été obtenu à partir de chacun des sujets éligibles. Pour chaque individu, des données démographiques ainsi que des données sur l'état et l'alcool fumer utilisation a été obtenue au moyen d'entrevues en face-à-face. Les personnes qui ont fumé une fois par jour pendant plus de 1 an ont été définis comme jamais les fumeurs. Jamais les fumeurs qui avaient cessé de fumer depuis plus de 1 an ont été définis comme les anciens fumeurs et les autres fumeurs que les fumeurs actuels. Les personnes qui ont consommé une ou plusieurs boissons alcoolisées par semaine pendant au moins 1 an ont été considérés comme jamais buveurs, et le reste ont été définis comme jamais buveurs. Après l'entretien, l'échantillon de sang veineux environ 5 ml ont été recueillies à partir de chaque participant.

génotypage

L'ADN génomique a été extrait à partir de lymphocytes du sang périphérique par digestion par la proteinase K, suivie par une extraction au phénol-chloroforme et précipitation à l'éthanol [19]. T1349G le polymorphisme
APE1 a été déterminée en utilisant la réaction en chaîne par polymérase restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP), qui a été décrit précédemment [20], [21]. Nous avons conçu l'amorce de 5'-TAATTCTGTTTCATTTCTATAGGCTA-3 '(avant) et 5'-TGCATTAGGTACATATGCTGTT-3' (inverse) pour amplifier le fragment cible de APE1
. Les échantillons ont été soumis à une dénaturation à 95 ° C pendant 5 min, suivie de 30 cycles de chauffage à 95 ° C pendant 30 s, annelage à 55 ° C pendant 40 s, puis élongation à 72 ° C pendant 45 secondes et une incubation finale à 72 ° C pendant 10 min. Les produits de PCR de 108 pb ont été digérés par le restriction I enzyme
FSPB, pour identifier les génotypes du polymorphisme T1349G. Après la digestion enzymatique, le variant allèle G a produit 2 fragments de 82 pb et 20 pb et l'allèle T de type sauvage ont donné lieu à un seul 108 pb fragment.

Les analyses génotypiques ont été réalisées par deux personnes indépendamment d'une manière aveugle. Environ 10% des échantillons ont été choisis au hasard pour la confirmation, et les résultats étaient totalement concordant.

L'analyse statistique

Les différences entre les cas et les témoins dans les variables démographiques, l'usage du tabac, la consommation d'alcool, et chaque allèle et le génotype des polymorphismes de gène APE1 de ont été évalués en utilisant le test du chi carré. test du chi carré a également été utilisé pour évaluer la différence entre le APE1
polymorphisme et caractéristiques clinico-pathologiques. Les associations entre les APE1
génotypes et le risque de cancer gastrique ont été estimés en calculant les odds ratios (RUP) et leurs intervalles de confiance à 95% (IC) à partir des analyses de régression logistique inconditionnelle univariée et multivariée. Ces analyses ont été répétées par stratifier pour le sexe (homme, femme), le tabagisme (jamais, jamais) et boire état (non, oui). Pour la stratification par âge, la limite d'âge à 60 ans a été utilisé dans cette étude car il était l'âge médian des patients et des contrôles recrutés. En outre, les risques spécifiques génotypiques ont également été estimées séparément pour le site cardia /noncardia tumorale, histotype intestinale /diffuse, la profondeur de l'infiltration de la tumeur et les métastases positif négatif /ganglionnaire T1 /T2 /T3 /T4. Hardy-Weinberg des distributions génotypiques des contrôles a été testé par un test de chi-carré bonté de l'ajustement. Deux faces tests de signification statistique ont été effectués en utilisant le logiciel SAS (version 8.2, SAS Institute, Inc., Cary, NC).

Distribution

Résultats de certaines caractéristiques entre le cancer de l'estomac les cas et les sujets témoins sont résumés dans le tableau 1. Selon les résultats de génotypage et les données du questionnaire, nous avons inclus 338 cas de cancer gastrique et 362 témoins sans cancer qui avaient toutes ces données disponibles dans cette analyse. L'âge moyen au moment du diagnostic pour les cas de cancer gastrique était de 61,7 ans (écart-type (SD) ± 12,3) et âge moyen à la constatation des contrôles était de 62,4 ans ((SD) ± 10,5). Il n'y avait pas de différences statistiquement significatives entre les cas et les témoins dans la distribution de l'âge et le sexe. Toutefois, une incidence plus élevée de fumer et de boire sont associés au cancer gastrique ( P
< 0,05). En outre, les patients atteints d'un cancer du cardia et non cardia étaient 143 (42,3%) et 195 (57,5%), respectivement. Les types histologiques étaient 192 (56,8%) pour intestinal et 146 (43,2%) pour le cancer de l'estomac diffus. La profondeur d'infiltration de la tumeur, T1, T2, T3 et T4 étaient 104 (30,8%) 64 (18,9%), 126 (37,3%) et 44 (13,0%), respectivement. Et les ganglions lymphatiques positifs ont été identifiés dans 174 (51,5%) des cas.

Les fréquences de génotype et l'allèle de la T1349G le polymorphisme de APE1 parmi les cas et les témoins, et les associations avec le risque de cancer gastrique sont indiqué dans le tableau 2. les fréquences des génotypes TT, TG, et GG ont été de 20,4%, 54,7% et 24,9% dans le groupe du cancer, contre 30,4%, 50,5% et 19,1% chez les individus sains normaux, respectivement. La fréquence de l'allèle G était de 52,2% chez les cas, ce qui était significativement plus élevé que chez les témoins (44,3% P
= 0,003). Une analyse ultérieure a révélé une association significative de hétérozygote (TG) et homozygotes (GG) variante génotype de APE1
T1349G avec le risque de cancer gastrique (OR = 1,61, IC à 95% = 1,12 à 2,32 pour TG contre TT et OR = 1,92, IC à 95% = 1,23 à 2,99 pour GG contre TT, respectivement). En outre, nous avons constaté que les individus avec les variantes de génotypes TG /GG avaient un risque significativement plus élevé de cancer de l'estomac que ceux avec le génotype TT (OR = 1,69, IC à 95% = 1,19 à 2,40). Des analyses plus stratifiées ont montré que l'augmentation du risque était plus évident dans les sous-groupes d'années aged≤60 (OR = 2,00, IC à 95% = 1,11 à 3,61), de sexe masculin (OR = 1,65, IC à 95% = 1,07 à 2,55), déjà fumé ( OR = 2,00, IC à 95% = 1,14 à 3,05), et jamais buveurs (OR = 2,18, IC à 95% = 1,18 à 4,03) (tableau 3). Cependant, en raison de la taille de l'échantillon d'étude limitée, tous les résultats des analyses stratifiées étaient préliminaires.

Association entre le T1349G le polymorphisme de APE1 et les caractéristiques clinico-pathologiques du risque de cancer de l'estomac stratifié sur le site de la tumeur, histologiques le type, la profondeur de l'infiltration de la tumeur et des métastases ganglionnaires sont présentées dans le tableau 4. l'analyse statistique a révélé une association significative de génotypes TG /GG avec le risque de tumeur du cardia et de non-cardia tumorale (OR = 1,61, IC à 95% = 1,01 à 2,56 et OR = 1,79, IC à 95% = 1,17 à 2,73, respectivement). Statistiquement, une tendance vers un risque plus élevé de cancer gastrique de type diffus a été détectée pour les génotypes TG /GG (OR = 2,09, IC à 95% = 1.29-3.42), mais il n'y avait pas de différence significative entre les cancers gastriques de type intestinal et les contrôles normaux (OR = 1,46, IC à 95% = 0,97 à 2,20). Une analyse plus poussée de la stratification de la profondeur de l'infiltration de la tumeur a montré que l'augmentation du risque a été plus prononcée entre T1 (OR = 2,73, IC à 95% = 1,50 à 4,99) et T2 (OR = 2,17, IC à 95% = 1,08 à 4,33), mais il y avait aucune différence significative entre les distributions dans les sous-groupes de T3 et de T4 (OR = 1,28, IC à 95% = 0,80 à 2,04, et OR = 1,26, IC à 95% = 0,61 à 2,60, respectivement). En outre, il y avait une augmentation significative du risque dans le cancer gastrique ganglionnaire (OR = 1,80, IC à 95% = 1,16 à 2,80), tandis que pas dans le cancer gastrique ganglionnaire (OR = 1,62, IC à 95% = 0,99 à 2,51) avec les génotypes TG /GG contre le génotype TT.

Discussion

Dans cette étude cas-témoins en milieu hospitalier, nous avons étudié l'association de T1349G le polymorphisme de APE1 et risque de cancer gastrique chez les populations chinoises. Nous avons constaté que le polymorphisme T1349G a contribué au risque de cancer de l'estomac, qui a été plus prononcée chez les sous-groupes d'années aged≤60, mâle, déjà fumé, et jamais buveurs. En outre, le polymorphisme T1349G a été associée à un risque accru de diffus de type faible profondeur de l'infiltration de la tumeur (T1 et T2), et le cancer gastrique ganglionnaire de métastases.

APE1 est une enzyme essentielle dans la voie de BER, qui est le principal mécanisme pour la réparation des dommages à l'ADN causés par l'oxydation et l'alkylation [7]. Le polymorphisme T1349G est le polymorphisme le plus commun qui se traduisent par la substitution d'un seul acide aminé a été identifié dans la population générale [12]. Il n'a pas été déterminé si le G allèle variant a un impact sur l'endonucléase et les activités de liaison à l'ADN [22]. Cependant, le génotype GG a été associée significativement prolongé du cycle cellulaire G2 retard par rapport aux génotypes TT et TG, ce qui suggère que cette substitution d'acide aminé peut contribuer à une hypersensibilité aux radiations [23] ionisants. Notre étude a révélé que le G allèle variant a été associée à une augmentation significative du risque de cancer gastrique, ce qui est cohérent avec nos résultats de la méta-analyse publiés précédemment [13]. Dans des études antérieures, Canbay et al. [15] ont trouvé des différences significatives dans les fréquences de l'allèle G de T1349G le polymorphisme de APE1 entre les patients atteints de cancer gastrique et les sujets témoins dans une population turque. Néanmoins, Palli et al. [16] n'a pas observé d'association significative de ce polymorphisme avec le cancer gastrique dans leur étude. La raison de ces différentes constatations reste incertain, ce qui pourrait en raison de petite taille des échantillons ou ethniquement diverse.

Dans l'addition, nous avons trouvé que le polymorphisme T1349G a été associée à un risque accru de cancer de l'estomac chez les sous-groupes de sujets plus jeunes ( années age≤60), mais les sujets non âgés. Faiblesse du système immunitaire et de l'exposition accumulée écrasante à des carcinogènes environnementaux chez les personnes âgées peuvent expliquer la différence d'âge, nous avons observé [24]. Les personnes âgées sont à un risque plus élevé de cancer de l'estomac, ce qui est plus probable en raison de l'effet du vieillissement plutôt que les effets génétiques directs. Par conséquent, la variation dans le gène APE1
peut avoir plus d'influence dans le cancer gastrique apparition précoce, bien que ce résultat a besoin de plus de confirmations. La fumée de tabac contient des centaines de produits chimiques, qui a été clairement établi que le principal facteur causal de cancer gastrique [25]. Nos résultats indiquent que le risque associé au polymorphisme T1349G était plus évidente chez les fumeurs. Cela peut être parce que la fumée de cigarette génère production d'espèces réactives de l'oxygène et induit adduits de l'ADN [26]. Des études ont rapporté que la consommation d'alcool augmentation peut augmenter le risque de cancer, y compris le cancer gastrique [27]. Cohérente, nos résultats ont également révélé que les sujets qui ont déjà consommé de l'alcool avec le polymorphisme T1349G présentent un risque accru de cancer de l'estomac. Cependant, notre petite taille de l'échantillon pourrait ne pas avoir une puissance suffisante pour détecter l'importante interaction gène-environnement; ainsi, les grandes études avec des données plus détaillées sur l'exposition de l'environnement sont nécessaires pour vérifier ces résultats.

types Intestinal et diffuses ont l'épidémiologie et la pathogenèse différente. L'intestin de type cancer gastrique est la variation internationale et prédomine dans les zones géographiques à haut risque, en particulier au Japon, en Corée et en Chine, alors que le cancer gastrique de type diffus a des distributions géographiques uniformes [28], [29]. Les facteurs environnementaux ont été proposés pour jouer un rôle important dans l'étiologie du cancer gastrique de type intestinal, et les facteurs de susceptibilité génétique peuvent plus contribué à type diffusé le développement du cancer gastrique. Chose intéressante, on a trouvé que l'effet du polymorphisme T1349G était associée à un cancer gastrique de type diffus mais le cancer gastrique de type intestinal non. En outre, nous avons constaté que le polymorphisme T1349G a été associée à un risque accru de faible profondeur d'infiltration de la tumeur (T1 et T2), et le cancer gastrique des ganglions lymphatiques métastatique, qui peut servir comme marqueur biologique de métastases du cancer gastrique. Cependant, parce que la taille de l'effet détectable dans notre étude était relativement faible (n = 11 pour le génotype TT dans les sous-groupes T1 et T2), l'utilité clinique de nos résultats doivent être interprétés avec précaution. En outre, le mécanisme biologique par rapport à APE1 de la variante, le APE1
expression des gènes, et le développement du cancer de l'estomac et les métastases restent à explorer.

En conclusion, notre étude suggère que T1349G le polymorphisme de la APE1 peut être associée à un risque de développement du cancer gastrique chez les populations chinoises. De grandes études prospectives basées sur la population avec des populations ethniquement diverses sont nécessaires pour vérifier ces résultats.

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