Syöpien tiedetään syntyneen pitkään ympäristölle altistumisen, kuten epäterveellisen ruokavalion tai tupakoinnin, vuoksi. Viime aikoina, kehossamme ja kehossamme elävät mikrobit ovat tulleet lavalle avaintoimijoina. Mutta suoliston mikrobien rooli paksusuolen syövän - kolmanneksi yleisimmän syövän maailmassa - kehittymisessä on epäselvä. Niiden vaikutuksen määrittämiseksi yhdistystutkimusten tarkoituksena on kartoittaa, kuinka paksusuolen syöpäpotilaiden suolistossa asuvat mikrobit eroavat terveistä koehenkilöistä.
Nyt, tutkijat Kööpenhaminan yliopistosta, EMBL, Trenton yliopisto, ja heidän kansainväliset yhteistyökumppaninsa ovat analysoineet useita olemassa olevia kolorektaalisyövän mikrobiomiyhdistystutkimuksia yhdessä uusien tietojen kanssa. Niiden meta-analyysit vahvistavat sairausspesifiset mikrobiomimuutokset, jotka ovat maailmanlaajuisesti kestäviä - yhdenmukaisia seitsemässä maassa kolmella mantereella - huolimatta ympäristöeroista, ruokavalio ja elämäntapa.
"Taudin aikana mikrobiomimme voi muuttua. Jos nämä muutokset ovat johdonmukaisia jokaisella saman sairauden sairastavalla henkilöllä, se on merkki sairaudesta. Tutkimuksessamme osoitamme, että suoliston mikrobiomien allekirjoitukset kolorektaalisyövässä näyttävät olevan yleismaailmallisia. Tämä on maantieteestä huolimatta, kulttuuria ja elämäntapaa. Toivomme tulevaisuudessa, että voimme käyttää näitä allekirjoituksia biomarkkereina ja diagnostisena työkaluna peräsuolen syöpään, "sanoo Manimozhiyan Arumugam, Apulaisprofessori Novo Nordiskin säätiön perusmetabolisen tutkimuksen keskuksessa.
Uudet tutkimustulokset on julkaistu tieteellisessä lehdessä Luonnon lääketiede . Tämä on ensimmäinen kerta, kun tällä asteikolla on tehty kolorektaalisyövän meta-analyysit. Tutkimuksessa, tutkijat ovat analysoineet ja käyttäneet tietoja seitsemästä kohortista Kiinasta, Itävalta, Ranska, Saksa, Yhdysvallat, Italia ja Japani.
"Käytimme tarkkaa koneoppimisanalyysiä mikrobien allekirjoitusten tunnistamiseksi kolorektaalisyövästä. Vahvistimme nämä allekirjoitukset syövän alkuvaiheessa ja useissa tutkimuksissa, jotta ne voivat toimia perustana tulevalle ei-invasiiviselle syöpäseulonnalle, "selittää Georg Zeller Heidelbergin Euroopan molekyylibiologian laboratoriosta (EMBL), Saksa.
Kaksi tutkimusta samaan johtopäätökseen
UCPH:n ja EMBL:n tutkijoiden johtamassa tutkimuksessa keskitytään prosessiin, jossa tietyt suolistobakteerit muuttavat ruoansulatusmehuumme kuuluvat sappihapot metaboliiteiksi, jotka voivat olla syöpää aiheuttavia. Asiaan liittyvä tutkimus Trenton yliopistosta osoittaa, kuinka tietyt bakteeriluokat hajottavat koliinia, olennainen ravintoaine lihassa ja muissa elintarvikkeissa, ja muuttaa sen mahdollisesti vaaralliseksi metaboliitiksi. Tämän metaboliitin on aiemmin osoitettu lisäävän sydän- ja verisuonisairauksien riskiä, ja nyt se voidaan yhdistää myös peräsuolen syöpään.
Yksi metagenomisten tutkimusten haasteista, jotka perustuvat ympäristönäytteiden, kuten ulosteen, mikrobien geneettiseen materiaaliin, on yhdistää geneettiset palaset erilaisiin mikrobi -organismeihin, joihin ne kuuluvat. Tämän niin kutsutun taksonomisen profilointitehtävän tavoitteena on tunnistaa ja kvantifioida näytteessä olevat bakteerilajit.
"Huolimatta erilaisista lähestymistavoista taksonomisessa profiloinnissa ja tilastollisessa analyysissä, tutkimuksemme johtivat hyvin samanlaisiin johtopäätöksiin, mikä tekee tästä yhden lupaavimmista tapauksista mikrobiomipohjaiseen diagnostiikkaan toistaiseksi, "sanoo EMBL -ryhmän johtaja Peer Bork.
Suoliston mikrobien rooli peräsuolen syövässä on vielä selvitettävä. Jos mikrobiomin muutokset vaikuttavat syövän kehittymiseen, ne voivat olla myös terapeuttinen kohde. Siksi, Manimozhiyan Arumugam toivoo, että keskitytään enemmän mikrobiomin rooliin sairauksissa ja että tutkijat tunnistavat mikrobiominäytteiden keräämisen edut, esimerkiksi, suurissa kohorteissa.
"Tanskassa, meillä on suuria biopankkeja, joissa on arvokkaita näytteitä vapaaehtoisilta ihmisiltä, ja vielä tärkeämpää, runsaasti terveyteen liittyviä tietoja kansallisista terveysrekistereistä. Koska meillä on ainutlaatuinen etu, mikrobiominäytteiden lisäämisen priorisointi näihin biopankkeihin vaikuttaa merkittävästi mikrobiomin roolin tunnistamiseen sairauksissa, "sanoo Manimozhiyan Arumugam.