V štúdii publikovanej tento mesiac v Annals of Reumatic Disease , vedci pod vedením tímu z Univerzity v Osake zistili, že črevný metagenóm japonskej populácie RA mal zaujímavé vlastnosti a prepojenie dráhy špecifické pre populáciu s hostiteľským genómom.
Reumatoidná artritída je bežná autoimunitná porucha, ktorá spôsobuje bolestivý zápal a poškodenie kĺbov postihnutých pacientov. Vedci doteraz spájali celý rad genetických a environmentálnych faktorov s nástupom reumatoidnej artritídy, pričom mikrobiota sa nedávno objavuje ako možný prispievajúci faktor. Avšak, zatiaľ čo nadmerná stimulácia imunitnej odpovede špecifickými baktériami sa podieľa na vzniku reumatoidnej artritídy, spôsob, akým mikrobiota ako celok prispieva k patogenéze reumatoidnej artritídy, zostáva predmetom mnohých diskusií.
Vykonali sme genetický skríning pomocou sekvenovania brokovnice celého genómu celej črevnej mikrobiálnej komunity u pacientov s reumatoidnou artritídou a porovnali sme ho so zdravými kontrolami, aby sme získali lepšiu predstavu o tom, ktoré bakteriálne druhy, gény, a cesty môžu prispieť k nástupu reumatoidnej artritídy u japonských pacientov. “
Toshihiro Kishikawa, vedúci autor štúdie
Táto obrazovka, nazýva sa asociačná štúdia zameraná na metagenóm (MWAS), ukázali množstvo rôznych baktérií patriacich do rodu Prevotella v črevnej mikroflóre pacientov s reumatoidnou artritídou, čo naznačuje, že do etiológie chorôb môže byť zapojených viac druhov, ako sa pôvodne predpokladalo. Navyše, štúdia identifikovala niekoľko génov a biologických dráh, ktoré boli významne obohatené o metagenóm reumatoidnej artritídy.
„Potom sme porovnali obohatené cesty v bakteriálnom metagenome s tými, ktoré sa ukázali byť obohatené v genómoch východoázijských a európskych pacientov s reumatoidnou artritídou, "hovorí hlavný autor štúdie Yukinori Okada." Je zaujímavé, že zatiaľ čo medzi metagenómom a hostiteľským genómom bolo identifikovaných niekoľko prekrývajúcich sa dráh, korelácia bola významná iba pre východoázijskú populáciu, čo naznačuje populačne špecifické spojenie medzi hostiteľským genómom a metagenómom v patológii reumatoidnej artritídy. “
„Dúfame, že vytvorením tohto nového odkazu naša práca bude podporovať rozvoj liečebných stratégií na boj proti reumatickým chorobám. “