Исследование:Острая инфекция SARS-CoV-2 связана с распространением болезнетворных бактерий в носу, включая Pseudomonas Aeruginosa. Кредит изображения:Кристоф Бургштедт / Shutterstock Коронавирус 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2) распространяется в основном при вдыхании вирусных частиц, переносимых по воздуху. Считается, что основным местом первоначальной репликации вируса является нос, а не рот, из-за более высокой экспрессии рецептора ангиотензин-превращающего фермента 2 (ACE2) в носу.
Быстрая репликация вируса в верхних дыхательных путях может привести к инфекции нижних дыхательных путей и тяжелому заболеванию. Тем не мение, многие исследования не показали корреляции между тяжестью заболевания и вирусной нагрузкой в носу, предполагая, что могут быть другие факторы, которые влияют на тяжесть заболевания.
Несколько исследований показали, что микробиом в носу и горле может играть роль в вирусных инфекциях. Вирусная инфекция может нарушить микробиоту и привести к коинфекции, которые могут усугубить воспаление и нарушить иммунный ответ. Тяжелая инфекция также может привести к потере запаха и вкуса. Тем не мение, Существует всего несколько исследований, посвященных изучению респираторного микробиома у пациентов с COVID-19.
В новом исследовании, опубликованном на bioRxiv * сервер препринтов, Исследователи из Калифорнийского университета в Ирвине исследовали влияние инфекции SARS-CoV-2 на носовой микробиом.
Команда исследователей использовала секвенирование ампликона гена рибосомальной рибонуклеиновой кислоты (рРНК) 16S, чтобы определить, привела ли инфекция SARS-CoV-2 к изменению состава носового микробиома. Этот эксперимент показал, что носовой микробиом пациентов с COVID-19 был:по факту, отличается от тех, кто не болел, а также то, что было в носу у медработников. Носовой микробиом пациентов с COVID-19 и медицинских работников был богаче, чем у других пациентов; тем не мение, В микробиомах всех трех типов образцов доминировали несколько избранных микробов.
Микробиом носа здорового человека в основном состоит из Коринебактерии, Стафилококк, Стрептококк, Долосигранулум, а также Моракселла. Авторы обнаружили, что многие болезнетворные бактерии, Такие как Ротия , Acinetobacter , а также Псевдомонады, были обычным явлением у пациентов с COVID-19, с особенно высоким уровнем Синегнойная палочка сообщили у этих пациентов.
Исследования показали, что острые вирусные инфекции могут изменять микробиом носа и способствовать увеличению количества патогенных бактерий. Увеличение Псевдомонады также сообщалось о случаях гриппа, что предполагает, что его присутствие не может быть специфическим для COVID-19, а скорее является общей реакцией на воспалительные процессы.
Микробиом носа у пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, отличается. (A) Схема исследования исследования. (B) Анализ основных координат носовых микробных сообществ, невзвешенное расстояние UniFrac, окрашенное статусом хозяина. Вклад статуса хозяина в общую дисперсию невзвешенных матриц несходства UniFrac был измерен с помощью PERMANOVA (Адонис с 10, 000 перестановок). (C, D, E) График скрипки, иллюстрирующий (D) средние невзвешенные расстояния UniFrac (C) количество наблюдаемых вариантов секвенирования ампликона и (D) разнообразие Шеннона (E), разделенное по статусу хозяина. Значимость для панелей C-E определялась с использованием непараметрического дисперсионного анализа Краскела Уоллиса (значения p вставлены в нижней части каждой панели). с множественным сравнением Данна * =p <0,05, ** =p <0,01, *** =p <0,001, **** =p <0,0001. (F) Пузырьковые графики бактериальных родов, обнаруженных при средней численности более 1% по всей исследуемой популяции, упорядоченные слева направо в порядке убывания средней численности. Размер каждого кружка указывает среднюю относительную численность для каждого таксона в обозначенной группе, а цвет каждого кружка указывает, к какому бактериальному типу принадлежит каждый род. Эти результаты соответствуют данным о вторичных бактериальных инфекциях у пациентов с COVID-19. Таким образом, состав носового микробиома может выступать в качестве основного типа образца для оценки риска вторичных инфекций у человека после выздоровления от определенных вирусных инфекций.
Кроме того, Калифорнийская исследовательская группа также обнаружила, что вирусная нагрузка в носу не влияет на разнообразие носового микробиома. Было обнаружено, что пациенты с COVID-19 с низкой вирусной нагрузкой имеют более значительное количество Стрептококк в их носовом микробиоме , тогда как пациенты с COVID-19 с умеренной вирусной нагрузкой имели большее количество Коринебактерии . В-третьих, Было обнаружено, что пациенты с COVID-19 с высокой вирусной нагрузкой имеют более высокий уровень Кутибактерии, Нейссерия, и псевдомонады виды присутствуют в их носовых микробиомах.
Затем авторы сравнили носовые транскриптомы испытуемых и обнаружили, что 692 гена по-разному экспрессируются у пациентов с COVID-19 и медицинских работников. Активированные гены у COVID-19-позитивных людей были связаны с механизмами защиты хозяина. Гены, связанные с гибелью клеток, а также те, которые кодируют ингибирующие рецепторы, также были активированы у пациентов с COVID-19.
Сравнительно, Некоторые из генов COVID-19, которые были обнаружены с пониженной регуляцией, включали те, которые связаны с поддержанием постоянных внутренних условий, клеточная организация, и обработка нервной ткани. Более того, гены, отвечающие за выработку муцина в носовых ходах, а также те, которые влияют на органы чувств, также были обнаружены подавляемые. Взяты вместе, Эти результаты могут объяснить потерю запаха и вкуса, о которой часто сообщалось у пациентов с COVID-19.
Внутрибольничные инфекции остаются серьезной проблемой в клинических условиях. Эти инфекции часто возникают из-за загрязненной больничной среды и медицинских работников. Из-за их длительного воздействия в больницах, работники здравоохранения являются распространенными переносчиками патогенных микробов.
Авторы обнаружили более высокий уровень патогенов, таких как Эскерихия, Клебсиелла, а также Burkholderia в носовом микробиоме медицинских работников. Обилие Acinetobacter было обнаружено, что он выше как у пациентов с COVID-19, так и у медицинских работников, что может быть связано с возможной передачей между ними.
Результаты настоящего исследования указывают на изменение микробиома носа у людей, инфицированных SARS-CoV-2, с увеличением таких патогенов, как Синегнойная палочка . Одним из ограничений этого исследования был тот факт, что оценивалась только временная точка; следовательно, будущие исследования, сравнивающие состав носового микробиома пациентов с COVID-19, здоровые люди, и больница со временем может улучшить понимание того, как меняется носовой микробиом.
bioRxiv публикует предварительные научные отчеты, не прошедшие рецензирование, и, следовательно, не следует рассматривать как окончательный, руководить клинической практикой / поведением, связанным со здоровьем, или рассматриваться как установленная информация.
Смесь на основе козьего молока полезна для здоровья кишечника младенцев
Как справиться с синдромом раздраженного кишечника
Ученые превращают кровь группы A в универсальную кровь типа O,
Потеря микробиома в результате использования антибиотиков влияет на реакцию на вакцину против гриппа
Новый инструмент для расшифровки микробиома кишечника
Электронная таблетка для обнаружения газов для диагностики желудочно-кишечных заболеваний
Коронавирус распространяется через фекалии?
Поразительное исследование из Китая, опубликовано в журнале Гастроэнтерология в марте 2020 г., сообщает, что новый коронавирус SARS-CoV-2 может распространяться через фекалии, а также более привычны
Новое испытание показывает улучшение выживаемости пациентов с распространенным колоректальным мутантным раком BRAF
Результаты нового клинического исследования опубликованы сегодня в Медицинский журнал Новой Англии показывают, что использование комбинации трех препаратов, нацеленных на конкретную мутацию гена BRA
Бактериальные изменения кишечника влияют на результаты лечения волчанки во время беременности
Течение беременности, как настоящая любовь, не всегда проходит гладко, когда у вас волчанка, правильно называется системной красной волчанкой (СКВ). Это аутоиммунное заболевание иногда бывает сильным,