PLoS ONE: een meta-analyse van interleukine-10 -592 Promoter polymorfisme geassocieerd met maagkanker Risk

Abstract

We gericht op de rol van IL-10 -592 A /C SNP in de vatbaarheid om te verkennen maagkanker door middel van een systematische review en meta-analyse. Elke eerste instantie opgenomen artikel werd gescoord voor de kwaliteit van de beoordeling. 17 studies in aanmerking kwamen voor de meta-analyse. Wij keurden de meest waarschijnlijk geschikte genetische model (recessief model). Potentiële bronnen van heterogeniteit werden gezocht via subgroep en gevoeligheidsanalyses, en publicatie vooroordelen werden geschat. IL-10-592 AA genotype geassocieerd met verminderde risico op maagkanker bij Aziaten en door aanzien waargenomen bij Aziaten hoge kwaliteit subgroep suggereert IL-10-592 AA genotype lijkt méér bescherming tegen algemene maagkanker Aziatische populaties te . IL-10-592 AA genotype wordt ook geassocieerd met de algemene daling van maagkanker gevoeligheid bij personen met H. pylori
infectie in vergelijking met de controlegroep zonder H. pylori
infectie, wat suggereert dat IL-10-592 AA genotype lijkt misschien méér bescherming tegen algemene maagkanker gevoeligheid bij personen die besmet zijn met H te zijn. pylori
. IL-10-592 AA-genotype is niet geassocieerd met ofwel pathologische subtypes (darm of diffuus) of anatomische subtypes (non-cardia of cardia) van maagkanker gevoeligheid. Genotypering methoden zoals directe sequentiebepaling moet sterk worden bepleit in de toekomst goed opgezette studies kwaliteit hoog te worden uitgevoerd tussen de verschillende etnische groepen of populaties

Visum:. Xue H, Wang YC, Lin B, An J, Chen L, Chen J, et al. (2012) een meta-analyse van interleukine-10 -592 Promoter polymorfisme geassocieerd met Gastric Cancer Risk. PLoS ONE 7 (7): e39868. doi: 10.1371 /journal.pone.0039868

Editor: Anthony W. I. Lo, De Chinese Universiteit van Hong Kong, Hong Kong

Ontvangen: 30 maart 2012; Geaccepteerd: 28 mei 2012; Gepubliceerd: 31 juli 2012

Copyright: © Xue et al. Dit is een open-access artikel gedistribueerd onder de voorwaarden van de Creative Commons Attribution License, die onbeperkt gebruik, distributie en reproductie maakt in elk medium, op voorwaarde dat de oorspronkelijke auteur en de bron worden gecrediteerd

Financiering:. Dit werk werd gesteund door de Nationale Basic Research Program van China 973-programma (2010CB5293), het National High Technology Research en Development Program van China (863 Program) (2006AA02A402), en Wetenschap en Technologie Commissie van Shanghai gemeente (09DZ1950101) naar FJY. De financiers hadden geen rol in de studie design, het verzamelen van gegevens en analyse, besluit te publiceren, of de voorbereiding van het manuscript

Competing belangen:.. De auteurs hebben verklaard dat er geen tegenstrijdige belangen bestaan ​​

Introductie

Nederland maagkanker incidentie is afgenomen, maar de mortaliteit gelederen nog steeds seconde [1] - [3]. In Azië [4], met name China [5], maagkanker vormt het hoogtepunt dodelijke maligniteit. Zoals algemeen bekend is, zijn besmettelijk, de voeding, milieu- en genetische factoren betrokken bij de maag carcinogenese, maar slechts een minderheid van de personen die zijn blootgesteld aan risicofactoren zoals Helicobacter pylori
( H. Pylori
) infectie uiteindelijk uitgroeien maagkanker [6], hetgeen inhoudt dat gastheer genetische gevoeligheid een belangrijke rol bij de ontwikkeling maagkanker speelt [7] - [9]. Dergelijke verschillende gevoeligheden kan gedeeltelijk worden verklaard door de single nucleotide polymorphisms (SNPs) van vatbare genen [7] - [9]. Tijdens de pathogenese van chronische gastritis maagkanker voortgebracht door H.
pylori infectie, gastheer geactiveerde neutrofielen en mononucleaire cellen niet alleen proinflammatoire cytokinen zoals interleukine (IL) -1β, IL-6, IL-8 en tumor necrose factor (TNF) -αbut ook anti-inflammatoire cytokines zoals IL -10. Rivetingly, het niveau van IL-10 naast die van IL-1 en TNF-α kan ook worden verhoogd in maagslijmvlies geïnfecteerd met H. pylori
.

IL-10, een krachtige pleiotrope cytokine, heeft het dubbele vermogen immunosuppress of immunostimulate eigenschappen tegen kanker [10]. Interleukine-10 remt de productie van pro-inflammatoire cytokinen door inhibitie van T-helper 1 (Th1) lymfocyten en stimulatie van B-lymfocyten en Th2 lymfocyten en dus downregulates de ontstekingsreactie [10] - [12]. De menselijke IL-10-gen, gelokaliseerd op chromosoom 1q31-32 bestaat uit vijf exons en vier introns en een van polymorfismen is gerapporteerd in de 5 'flankerende regio op positie -592 A /C SNP [13].

In 2003, El-Omar EM et al. [14] en Wu et al MS. [15] bijna gelijktijdig hun eigen onderzoek op IL-10-592 A /C SNP gepubliceerd. Sindsdien hebben onderzoekers gemeld achtereenvolgens verenigingen van IL-10-592 A /C SNP met de gevoeligheid voor maagkanker, maar met gemengde of tegenstrijdige resultaten [16] - [30]. Tot nu toe zijn er twee relevante gepubliceerde meta-analyse artikelen over IL-10-592 A /C SNP [31], [32], maar die twee meta-analyseert niet de meest waarschijnlijke geschikte genesemodel nemen, en dus de authentieke waarden van de statistische resultaten kunnen worden aangetast.

daarom was het doel van onze meta-analyse om meer licht te werpen, met behulp van de meest geschikte genetische model, over de rol van IL-10-592 A /C SNP van het risico op het ontwikkelen van maagkanker en mogelijke bronnen van heterogeniteit te identificeren onder de in aanmerking komende studies.

Materialen en methoden

zoekstrategie

Een systematisch literatuuronderzoek werd uitgevoerd artikelen over IL-10-592 A /C SNP geassocieerd met het risico op maagkanker. De MEDLINE, EMBASE databases, Chinese National Knowledge Infrastructure (CNKI), Web of Science en databases BIOSIS gelijktijdig gebruikt met de combinatie van termen "Interleukin 10", "IL-10", "interleukine" of "cytokine"; "gen"; "Polymorfisme", "variant" of "SNP"; en "maagkanker", "maagcarcinoom", "diffuse maagkanker" of "maagkanker" van januari 2000 tot september 2011. Het onderzoek werd uitgevoerd zonder enige beperking van de taal. De reikwijdte van geautomatiseerde literatuuronderzoek werd uitgebreid volgens de literatuurlijsten van artikelen opgehaald. De desbetreffende originele artikelen werden ook handmatig gezocht.

Study Selection

Onderzoek naar de associatie van IL-10-592 A /C SNP met het risico op het ontwikkelen van maagkanker werden opgenomen als de volgende voorwaarden werd voldaan: (i) een studie beschreef de associatie van IL-10-592 A /C SNP met maagkanker; (Ii) elke studie rapporteerde de nummers van beide regelaars en maagkanker cases; (Iii) de resultaten werden uitgedrukt als odds ratio (OR) met 95% betrouwbaarheidsintervallen (CI); en (iv) studies waren case-control of geneste case-control degenen.

methodologische kwaliteit Beoordeling

Om kwalitatief hoogwaardige studies te identificeren, we voornamelijk aangenomen vooraf gedefinieerde criteria voor Quality Beoordeling [33], [34], [7] - [9]. De criteria hebben betrekking op de geloofwaardigheid van de controles, de representativiteit van de gevallen, de consolidatie van maagkanker, genotypering onderzoek en vereniging evaluatie [7] - [9]. Methodologische kwaliteit werd onafhankelijk beoordeeld door twee onderzoekers (Y. Wang en B. LIN). Meningsverschillen werden opgelost door middel van discussie. Scores variëren van nul de laagste naar de hoogste tien. Artikelen met de score lager dan 6,5 werden beschouwd als "lage of matige kwaliteit" enen, terwijl die niet lager dan 6,5 werden beschouwd als "hoge kwaliteit" degenen.

Data Extraction

De volgende data van elk artikel werden geëxtraheerd: auteurs, jaar van uitgave, land, etniciteit van de deelnemers (gecategoriseerd als blanken, Aziaten, Latino's, enz.), studie ontwerp, de bron van de controles, het aantal controles en van de gevallen, genotyperingsmethode, de verdeling van leeftijd en geslacht, classificatie Lauren's (darm, diffuus, of gemengd), en anatomische classificatie (cardia of non-cardia kanker).

De gegevens werden geëxtraheerd en onafhankelijk van elkaar door twee onderzoekers (Y. Wang in twee databases geregistreerd en B. Lin), die blind tijdschrift namen, instellingen of het fonds subsidies waren. Enige discrepantie tussen deze twee onderzoekers werd opgelost door de derde onderzoeker (H. Xue), die in de discussie deelgenomen met hen en maakte een uiteindelijke beslissing.

Statistische analyse

Alle statistische analyses werden uitgevoerd met behulp van STATA statistische software (versie 10.1, STATA Corp, College Station, TX). Twee-zijdige P < 0,05 werden statistisch significant beschouwd. HWE controles werd opnieuw berekend meta-analyse. De chi-kwadraat goodness of fit werd gebruikt om afwijking van HWE (significant op het niveau van 0,05) te testen. Odds ratio (OR) en 95% betrouwbaarheidsintervallen (95% BI) werden gebruikt om de sterkte van associaties tussen IL-10-592 A /C SNP met maag kankerrisico beoordelen. OF _{1, OF 2, en OR 3 met betrekking tot IL-10-592 A /C SNP werden berekend voor genotypen AA versus CC, CA versus CC en AA versus CA, respectievelijk.}

de bovenstaande paarsgewijze verschillen werden gebruikt om de meest geschikte genetische model te bepalen. Als OR _{1 = OR 3 ≠ 1 en OR 2 = 1, dan is een recessief model wordt voorgesteld. Als OR 1 = OR 2 ≠ 1 en OR 3 = 1, dan is een dominante model wordt geïmpliceerd. Als OR 2 = 1 /OF 3 ≠ 1 en OR 1 = 1, dan is een compleet overdominant model wordt voorgesteld. Als OR 1 > OF 2 > 1 en OR 1 > OF 3 > 1, of OR 1 < OF 2 < 1 en OR 1 < OF 3 < 1, dan is een codominant model wordt aangegeven [35]. Als een dominant model werd aangegeven, werd de oorspronkelijke groep samengevouwen en de nieuwe groep A dragers (AA + CA) vergeleken met CC genotype; als een recessief model werd gesuggereerd werd AA vergeleken met de groep CC plus CA; als een complete overdominant model werd geïmpliceerd, werd de groep van AA plus CC vergeleken met CA; of als een co-dominante model insinueerde, AA vergeleken met CA en CC resp.}

De Q statistiek werd gebruikt voor het testen heterogeniteit tussen de studies in de meta-analyse. Een vaste effecten model behulp Mantel-Haenszel (M-H) methode werd toegepast om de gepoolde UPR berekenen wanneer homogeniteit bestond op basis van Q-proef p-waarde niet minder dan 0,1. Daarentegen kan een random-effects model behulp DerSimonian en Laird werkwijze (D + L), werd gebruikt als er heterogeniteit gebruik makend van Q-proef p-waarde lager dan 0,1. De betekenis van samengevoegde UPR werd getest door Z-test (P < 0,05 werd als significant beschouwd)

gevoeligheidsanalyse uitgevoerd, waarbij de meta-analyse schattingen werden berekend na elk onderzoek wordt weggelaten elke beurt <.. br>

Tot slot, publicatiebias werd bepaald door het uitvoeren van de trechter percelen kwalitatief en geschat door Begg en testen Egger's kwantitatief.

Resultaten

Literature Search en Selection Study

na uitgebreid zoeken, werden in totaal 236 artikelen in het Engels en 6 in het Chinees opgehaald. In onze meta-analyse werden in eerste instantie helemaal opgenomen 17 studies [14] - [30], die verzorgd aan de criteria voor opname. Die 17 studies waren voorlopig afgestemd op de meta-analyse van de associaties met maagkanker met betrekking tot IL-10-592 A /C SNP.

Vier studies [24], [25], [28], [29 ] waren afgeweken HWE. In het algemeen, elke studie die afweek van Hardy-Weinberg evenwicht via onze berekening had moeten worden verwijderd; Aangezien echter het aantal deelnemers vooral in de studie [24] was groot en aangezien sensitiviteitsanalyses zouden worden uitgevoerd, blijven we deze vier studies in meta-analyse. Aldus 17 studies [14] - [30] met een totaal van 5730 en 2999 controles gevallen waren uiteindelijk in aanmerking voor de meta-analyse van IL-10-592 A /C SNP. De bijbehorende eigenschappen werden gezien in tabel 1. De stroomschema van literatuuronderzoek en studie selectie werd belicht in Figuur 1.

Algemeen Meta-analyse tussen de verschillende etnische afkomst Populaties

of _{1 ( p-waarde), OR 2 (p-waarde) en OR 3 (p-waarde) van IL-10-592 A /C SNP voor de algemene etniciteiten waren 0,91 (p = 0,437), 1,00 (p = 0,950 ) en 0,87 (p = 0,030), respectievelijk, mogelijk insinuerende een recessieve genetische model effect van vermeende beschermende allel (OR 1 = OR 3 < 1 en OR 2 = 1). Ondertussen, na etniciteit subgroepanalyse, OR 1 (p-waarde), OR 2 (p-waarde) en OR 3 (p-waarde) van IL-10-592 A /C SNP onder Aziaten waren 0,82 (p = 0,080), 1,04 (p = 0,699) en 0,83 (p = 0,011), respectievelijk verder suggereert een recessief erfelijke model effect van de vermeende beschermende a-allel (OR 1 = OR 3 < 1 en OR 2 = 1). Aldus werd het genotype AA vergeleken met de gecombineerde genotype CA-plus-CC. Zoals in figuur 2, voor de algehele maagkanker geen statistisch significante bevinding kon worden waargenomen tussen de blanken en latino's, respectievelijk, terwijl een statistisch significante bevinding kan worden vastgesteld tussen Aziaten uit het feit dat de gepoolde OR's (95% BI, p-waarde) waren 1,03 (0,64-1,65, p = 0,913) en 1,10 (0,53-2,26, p = 0,802) voor het voormalige, respectievelijk maar 0,81 (0,68-0,97, p = 0,019) voor het laatste.}

Meer subgroepanalyse

Specifieke gegevens voor IL-10-592 A /C SNP werden geclassificeerd volgens de kwaliteitsbeoordeling scores, tot hoogwaardige (scores liefst 6,5) en mediaan en lage kwaliteit (score minder dan 6,5 ) subgroepen tussen verschillende etnische groepen. Een statistisch significante bevinding werd alleen gezien in Aziaten hoogwaardige subgroep, maar niet in Aziaten mediaan-en-lage kwaliteit subgroep, Kaukasiërs hoge kwaliteit subgroep, Kaukasiërs mediaan-en-lage kwaliteit subgroep of Latinos mediaan-en-lage kwaliteit subgroep, gezien het feit dat de gepoolde OR's (95% CI, p-waarde) was 0,77 (0,61-0,96, p = 0,022), 0,90 (0,69-1,18, p = 0,437), 0,91 (0,54-1,53, p = 0,724), 1,29 (0,41 -4,11, p = 0,664) of 1,10 (0,53-2,26, p = 0,802), respectievelijk (figuur 3).

Bij maagkanker werd ingedeeld in niet-cardia (en distale) en cardia subtypes, geen statistisch significante resultaten werden gevonden onder niet-cardia subtype of tussen cardia subtype op grond van het feit dat de gepoolde OR's (95% CI, p-waarde) was 1,09 (0,57-2,11, p = 0,787) onder niet-cardia subtype en 0,78 (0.42- 1,45, p = 0,432) tussen cardia subtype. In termen van de pathologie, kon maagkanker worden ingedeeld in de darm, diffuus, of gemengde subtypes, en geen statistisch significante bevinding werd waargenomen in de darm-subtype kanker of diffuse-subtype van kanker, voor de samengevoegde ultraperifere regio's (95% CI, p-waarde) waren 0,82 (0,64-1,06, p = 0,127) in de voormalige en 0,89 (0,62-1,29, p = 0,546) in de laatste.

in termen van de H. pylori
infectiestatus, een statistisch significante bevinding werd gevonden bij de H. pylori
positieve kankerpatiënten in tegenstelling als H. pylori
negatieve controles, maar er is geen statistisch significante bevinding werd gevonden bij de H. pylori
positieve kankerpatiënten in tegenstelling als H. pylori
positieve controles voor samengevoegde OR's (95% CI, p waarde) was 0,67 (0,46-0,98, p = 0,041) in de eerste en 1,00 (0,75-1,32, p = 0,978) in de laatste (figuur 4) .

als genotyperingstechnieken werden beschouwd, werd een statistisch significante bevinding opgemerkt directe sequentiebepaling subgroep maar niet in andere genotypering techniek subgroep. In de directe sequencing, TaqMan, ABI Genetic Analyzer, Pyrosequencing, RFLP, ASP, ABI real-time PCR en snapshot genotypering techniek subgroepen samengevoegd OR's (95% CI, p waarde) was 0,55 (0,40-0,75, p = 0,000) , 1,25 (0,74-2,13, p = 0,406), 0,83 (0,39-1,75, p = 0,618), 0,80 (0,53-1,20, p = 0,273), 1,00 (0,84-1,19, p = 0,997), 0,63 (0,39-1,03 , p = 0,067), 0,61 (0,32-1,16, p = 0,132) en 0,84 (0,52-1,36, p = 0,475), respectievelijk (figuur 5).

gevoeligheidsanalyse

Meta -analyse werden keer op keer worden uitgevoerd als ieder afzonderlijk onderzoek was verwijderd. De resultaten gaven aan dat vaste effecten schattingen en /of random-effecten Schattingen voor en na de verwijdering van elk onderzoek waren vergelijkbaar in het algemeen, suggereert een hoge stabiliteit van de resultaten meta-analyse. Zoals getoond in figuur 6, het meest beïnvloeden één studie van het gepoolde schattingen leek de studie van Wu et al. [15] De gevoeligheidsanalyse echter aangegeven hoge stabiliteit van de resultaten uit de feiten dat de UPR ( 95% BI, p-waarde) was 0,88 (0,74-1,05, p = 0,152) voor de verwijdering van die studie en 0,92 (0,79-1,08, p = 0,332) na de verwijdering van die studie. Gezien de studie [24] uitgevoerd door Crusius JB e.a.. dat wordt afgeweken van HWE, de ultraperifere regio's (95% BI, p-waarde) was 0,86 (0,74-0,99, p = 0,037) voor de verwijdering van die studie en 0,87 (0,75-1,01, p = 0,063) na de verwijdering van deze studie voor de all etniciteit, met vermelding van matige tot hoge stabiliteit van de resultaten. Ook voor de andere drie studies afwijking van HWE [25], [28], [29], verwijdering van de drie studies een voor een veranderde OR's (95% BI, p-waarde) van 0,86 (0,74-1,00, p = 0,050), 0,86 (0,74-1,00, p = 0,050) en 0,86 (0,74-1,00, p = 0,050) 0,86 (0,74-1,00, p = 0,050), 0,86 (0,74-1,00, p = 0,050) en 0,86 (0,74-1,00, p = 0,050), hetgeen wijst hoge stabiliteit van de resultaten. (De illustreren figuren zijn weggelaten vanwege de lengte van het papier).

Cumulatieve Meta-analyse

Cumulatieve meta-analyse van IL-10-592 A /C SNP associaties werden ook uitgevoerd bij Aziaten (figuur 7 deel A) en onder blanken (figuur 7 deel B) via het assortiment van het totale aantal steekproefomvang. Zoals getoond in figuur 7 deel A, de neiging tot significante omgekeerde associaties met algemene maagkanker, hoewel enigszins gegolfd, werd duidelijk gezien bij Aziaten, terwijl in figuur 7 deel B, werd het tegenovergestelde trend waargenomen bij blanken.

Publication Bias Analyse

publicatie vooringenomenheid werd voorlopig onderzocht door trechter percelen kwalitatief en geschat door Begg en testen Egger's kwantitatief. De trechter plot (Figuur 8) toonden aan dat puntjes bijna symmetrisch verdeeld, voornamelijk binnen pseudo 95% betrouwbaarheidsgrenzen. P-waarden waren 0,902 in de test Begg en 0,914 in de test Egger's, afzonderlijk, ook suggereert geen bekendmaking vooringenomenheid.

Discussie

In onze meta-analyse, een statistisch significante bevinding kan worden opgemerkt met de algehele verminderd risico op maagkanker bij Aziaten, maar niet tussen blanken en latino's (AA vs CA-plus-CC); tegengestelde neiging tot het risico op maagkanker kan ook worden waargenomen tussen blanken en Aziaten via cumulatieve meta-analyse gesorteerd door plaatsing en het aantal van alle monsters. Aldus kan IL-10-592 AA genotype lijken méér bescherming tegen algemene maagkanker vatbaarheid onder Aziaten zijn. Om zeker te zijn, de verschillende of zelfs tegenstrijdige risico verenigingen, zo ja, tussen de verschillende etnische groepen moet verder worden zorgvuldig onderzocht en bevestigd in de toekomst.

Onze verdere subgroepanalyses ook aangeven dat een statistisch significante bevinding werd alleen gezien in Aziaten hoogwaardige subgroep, maar niet in Aziaten gemiddelde en lage kwaliteit subgroep, Kaukasiërs hoge kwaliteit subgroep, Kaukasiërs gemiddelde en lage kwaliteit subgroep of Latinos mediaan en lage kwaliteit subgroep (AA vs CA-plus-CC). Het is natuurlijk dat van hoge kwaliteit studies in de toekomst moet worden ontworpen om zo nauwkeurig de echte associaties tussen IL-10-592 AA-genotype en maagkanker gevoeligheid tussen de verschillende etnische groepen.

Bovendien, 5 [14] verkennen [18], [20], [23], [24] van de 17 in aanmerking komende studies werden behandeld noncardia-subtype maagkanker en 3 [14], [23], [24] met cardia-subtype maagkanker. Geen statistisch significante bevindingen kunnen worden vastgesteld met hetzij subtype (AA vs CA-plus-CC). 5 studies [20] - [22], [23], [26] in onze meta-analyse zijn behandeld pathologisch intestinale-subtype maagkanker en 4 [21] - [23], [26] van de 17 studies werden behandeld met pathologisch diffuse-subtype maagkanker. Geen statistisch significante bevinding kan worden opgemerkt in zowel de darm-subtype of diffuse- subtype kanker (AA vs CA-plus-CC). Zoals bekend, cardia-subtype maagkanker verschilt van noncardia-subtype maagkanker etiologie, pathologie, carcinogenese en /of prognose [36] - [38], dus darm-kanker subtype versus diffuse-subtype kanker. Men zou kunnen zeggen dat de willekeurige combinatie van cardia-subtype en noncardia-subtype gevallen of darm-subtype en diffuse-subtype gevallen in de meeste aanmerking komende studies kan maskeren of althans onderschatten de sterkte van de werkelijke associaties [7] - [ ,,,0],9].

Verder werd gemeld dat maagkanker ontwikkelt bij patiënten met H. pylori
infectie in plaats van bij niet-geïnfecteerde degenen [39]. In onze meta-analyse, een statistisch significante omgekeerde associatie met maagkanker werd gevonden bij H. pylori
positieve kankerpatiënten in tegenstelling als H. pylori
negatieve controles, maar er is geen statistisch significante bevinding werd gevonden bij de H. pylori
positieve kankerpatiënten in tegenstelling als H. pylori
positieve controles (AA vs CA-plus-CC), wat aangeeft dat IL-10-592 AA genotype lijkt misschien méér bescherming tegen algemene maagkanker gevoeligheid bij personen die besmet zijn met H te zijn. pylori
. Zeker, de echte associatie tussen H pylori
infectie en IL-10-592 AA-genotype en maagkanker gevoeligheid moet verder zorgvuldig worden onderzocht in de toekomst.

Met de komst van nieuwe technologieën zoals genotypering seminested polymerasekettingreactie TaqMan allelische discriminatietoets, directe sequencing, de allelspecifieke primer-polymerasekettingreactie, pyrosequentiebepaling, snapshot of real-time PCR, kunnen we een explosie van associatiestudies in de toekomst verwacht. In onze meta-analyse, een statistisch significante omgekeerde associatie met maagkanker gevoeligheid werd opgemerkt in directe sequentiebepaling genotypering techniek subgroep maar in een andere subgroep. We hebben eerder vermeld dat de meest statistisch significant resultaat gezien in directe sequencing technologie meta-analyse is aangetoond dat andere technieken kunnen niet worden gebruikt. Toch is de genotypering resultaten door middel van een nieuwe genotypering techniek beter worden bevestigd middels directe sequentiebepaling. Onder deze omstandigheden kunnen de nieuwe genotyperingstechnologie worden beschouwd als geldige directe sequentiebepaling [40]. Sterker nog, de gevoeligheid en specificiteit van de genotypering technieken moeten verder worden onderzocht om zo te zoeken naar de optimale benaderingen die de genotypering fouten kunnen minimaliseren [7] - [9]. Wij pleiten ervoor dat directe sequentiebepaling verder in toekomstige studies moeten worden uitgevoerd.

Tot slot, de kracht van onze meta-analyse kunnen als volgt worden samengevat. We getracht zoveel publicaties konden we via verschillende methoden te zoeken. We legden meer nadruk op de beoordeling van vooroordelen over studies en het peilen van de mogelijke bronnen van heterogeniteit via subgroepanalyses en gevoeligheidsanalyses. Wij hebben de publicatie vooroordelen via Begg en proeven Egger evenals trechter plot proeven. Zo overtuigen we dat de resultaten van onze meta-analyse, in essentie, zijn gezond en betrouwbaar zijn.

Zeker, onvermijdelijk beperkingen kon nog steeds terug te vinden in onze meta-analyse. Ten eerste, de geëxtraheerd uit de opgenomen studies informatie is overwegend over genotypes in verband met de algemene maagkanker gevoeligheid, terwijl minder toegankelijk is meer belangrijke informatie met betrekking tot pathologische subtypes of anatomische subtypes van maagkanker of ten aanzien van H. pylori
infectiestatus. Dus de resultaten van analyses van subgroepen in overeenstemming met specifieke subtypen of H. pylori
infectie status moet worden beschouwd met uiterste voorzichtigheid. Ten tweede aangezien slechts gepubliceerde studies in meta-analyse kon publicatiebias potentieel optreden, hoewel geen statistisch significante vertekening publicatie is opgemerkt in meta-analyse. Ten derde, matige tot ernstige heterogeniteit kon worden gezien over de opgenomen studies. Niettemin, in een poging om de potentiële vertekening te minimaliseren, hebben we een strenge protocol voor het uitvoeren van meta-analyse, en gebruikt expliciete methoden voor het literatuuronderzoek, studie selectie, extractie van gegevens, statistische analyse, genetische model adoptie en gevoeligheidsanalyse [40], [ ,,,0],41].

tot slot, kan IL-10-592 AA genotype lijken méér bescherming tegen algemene maagkanker vatbaarheid onder Aziaten te zijn en kunnen ook lijkt méér bescherming tegen algemene maagkanker gevoeligheid te zijn bij personen die besmet zijn met H. pylori
. IL-10-592 AA genotype wordt niet geassocieerd met de pathologische subtypes (intestinale of diffuus) of anatomische subtypen (niet-cardia of cardia) van maagkanker gevoeligheid in meta-analyse. Dergelijke genotyperingsmethoden als directe sequentiebepaling moet sterk worden bepleit in de toekomst goed ontworpen hoge kwaliteit studies tussen de verschillende etnische groepen of populaties te worden uitgevoerd.

• PLoS ONE: Sociaal-economische en Nutritional factoren verantwoordelijk zijn voor de Vereniging van maagkanker met Indiaanse Voorouders in een Latijns-Amerikaans gemengd Bevolking
• PLoS ONE: Plasma microRNAs, miR-223, miR-21 en miR-218, als nieuwe potentiële Biomarkers voor maagkanker Opsporing