Nei computational Modellermethod virausgesäit wéi Darmmikroben sech mat der Zäit veränneren

Eng nei computational Modellerungsmethod benotzt Snapshots vun deenen Aarte vu Mikroben am Darm vun enger Persoun fonnt gi fir virauszegesinn wéi d'Mikrobial Gemeinschaft mat der Zäit ännert. Den Tool, entwéckelt vum Liat Shenhav, Leah Briscoe a Mike Thompson aus dem Halperin Lab, Universitéit vu Kalifornien Los Angeles, a Kollegen am Mizrahi Labo op der Ben-Gurion Universitéit, Israel, gëtt presentéiert an PLOS Computational Biologie .

Kreditt:sbtlneet/Pixabay, CC0

D'Typen a relativ Quantitéite vu Mikroben, déi am Darm vun enger Persoun fonnt ginn, kënnen den Zoustand vun hirer Gesondheet reflektéieren an beaflossen. Wësse wéi dës mikrobiell Gemeinschaftskompositioun mat der Zäit ännert kéint Schlëssel Abléck iwwer Gesondheet a Krankheet ginn. Wéi och ëmmer, et ass net kloer a wéi engem Grad déi mikrobiell Gemeinschaftskompositioun vum Mënsch vun engem Mënsch zu engem bestëmmte Moment seng zukünfteg Zesummesetzung bestëmmt.

Fir dës Fro unzegoen, Shenhav a Kollegen entwéckelt Mikrobiell Gemeinschaft Temporal Variabilitéit Linear Mixed Model (MTV-LMM), eng nei Method fir temporär Ännerungen an der mikrobieller Zesummesetzung vum Darm ze modelléieren. Wann getest géint real-Welt Daten, dat neit Tool mécht méi korrekt Prognosen wéi aner Modeller, déi virdru fir dee selwechten Zweck entwéckelt goufen.

D'Fuerscher hunn dunn MTV-LMM benotzt fir nei Abléck an d'Mikrobiomdynamik z'erreechen. Zum Beispill, si hunn bewisen datt, souwuel bei Puppelcher wéi bei Erwuessener, Darmmikrobiom Gemeinschaftskompositioun ka wierklech präziist virausgesot ginn op Basis vu fréiere Observatioune vun der Gemeinschaft. Si hunn de Modell och op Daten vun 39 Puppelcher ugewannt an hunn eng Schlësselverschiebung ronderëm den Alter vun 9 Méint opgedeckt wéi den Darmmikrobiom sech mat der Zäit ännert.

An Erwaardung, MTV-LMM kéint ugewannt ginn fir zäitlech Dynamik vum Darmmikrobiom am Kontext vu Krankheet ze entdecken, wat kéint zu enger besserer Diagnostik a Behandlung féieren. Et kéint och nëtzlech sinn fir aner Aarte vu temporäre Mikrobiomprozesser ze verstoen, wéi déi, déi wärend der Verdauung optrieden.

Eis Approche bitt verschidde methodologesch Fortschrëtter, awer dëst ass ëmmer nach nëmmen den Tipp vum Äisbierg.

Liat Shenhav, vum Halperin Lab, Universitéit vu Kalifornien Los Angeles

An der Zukunft, si an hir Kollegen wäerte schaffen fir d'Prediktiounsgenauegkeet vum Modell weider ze verbesseren an zousätzlech Uwendungen ze entdecken. "D'Modelléiere vum temporäre Verhalen vum Mikrobiom ass eng fundamental wëssenschaftlech Fro, mat potenziellen Uwendungen an der Medizin an doriwwer eraus.

• Nei Strategie kann d'Gutt-Gehir Kommunikatioun stäerken
• Fuerscher hu méiglecherweis e Wee fonnt fir nei Zänngewebe fir Patienten ze wuessen