PLOS NËMMEN: A New Polymorphism uweist rs629367 Associéierten mat Geklomm Risk an Poor Iwwerliewe vun Gastric Cancer an Chinese vun Up-reegelen miRNA-loosse-7A Expression

Wat VerfÜgung

Background VerfÜgung

Variant zu pri-miRNA konnt miRNA Ausdrock an eeler Prozess oder splicing Effizienz betreffen, also der ierfgroussherzoglecher waat an hätt vun Kriibs Wou muss ech. Mir anzeschätzen miRNA-loosse-7 eenzegen Nukleotid schiefgang (SNP) mat dem Risiko an hätt vun gastric Kriibs (GC) wéi en biomarkers, an doriwwer eraus, hir méiglech Mechanismen verbonne ze bewäerten. VerfÜgung

Method VerfÜgung

a zwee-Etapp case-Kontroll Etude konzipéiert véier miRNA SNPs (pri-loosse-7A-2 rs629367 an rs1143770, pri-loosse-7A-1 rs10739971, pri-loosse-7f-2 rs17276588) an 107 GC Patienten ze Écran , 107 atrophic gastritis (AG), an 124 Kontrolle mat Hinnen alleguer-RFLP iwwereneestëmmen. Zwee villverspriechenden SNPs waren an aneren onofhängege 1949 Echantillon (dorënner 579 gastric Kriibs Patienten, 649 atrophic gastritis an 721 Kontrollen) validéiert andeems Sequenom MassARRAY Plattform an sequencing. VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

Mir hu fonnt, datt pri-loosse -7a-2 rs629367 CC Variant genotype gouf mat méi Risiken vun gastric Kriibs an atrophic gastritis vun 1.83-fantastesch an 1.86-fantastesch assoziéiert, bzw.. Fir gastric Kriibs hätt, Patienten mat rs629367 CC genotype hu vill aarmen Iwwerliewe wéi Patienten mat AA genotype (umellen-Platz P VerfÜgung = 0.004). Mir propagéieren weider der loosse-7A Ausdrock Niveauen am serum a fonnt, datt mer-7A Ausdrock lues fir rs629367 AA, CA, CC genotype an der atrophic gastritis Grupp nik ( P VerfÜgung = 0.043). Ausserdeem, bestätegt mir dëse Conclusiounen kënschtlech Etude vun overexpressing loosse-7A Droen pri-loosse-7A-2 Wildwest-Typ A oder polymorphic-Typ C allele ( P VerfÜgung &Si besteet; 0.001). VerfÜgung

Konklusiounen VerfÜgung

pri-loosse-7A-2 rs629367 CC genotype d'Risiken vun gastric Kriibs souwéi atrophic gastritis a war och verbonne mat aarmséileg Iwwerliewe vun gastric Kriibs Erhéijung hätt, déi méiglecherweis duerch den alen loosse-7A Auswierkungen Ausdrock, a wéi engem virausgesot uweist fir héich-Risiko an aarme hätt vun gastric Kriibs déngen kéinten VerfÜgung

Fro:. Xu Q, Dong Q, Hien C, Liu W, Sonn L, Liu J, et al. (2014) A New Polymorphism uweist rs629367 Associéierten mat Geklomm Risk an Poor Iwwerliewe vun Gastric Cancer an Chinese vun Up-reegelen miRNA-loosse-7A Expression. PLoS NËMMEN 9 (4): e95249. Doi: 10.1371 /journal.pone.0095249 VerfÜgung

Redakter: Qing-Yi Wei, Herzog Cancer Institut, Vereenegt Staate vun Amerika VerfÜgung

Arnaque: 26. Januar 2014; Akzeptéiert: 24. Mäerz 2014; Publizéiert: April 23, 2014 VerfÜgung

Copyright: © 2014 Xu et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung

Funding:. Dës Aarbecht déi Subventioune vun der National Key Grondakommes Research plangen vu China ënnerstëtzt gëtt (973 plangen Weir keen. 2010CB529304), d'National Natural Science Foundation of China (Refus Nr 31200968), an der Science Technology Project zu Liaoning Province (Refus Nr 2011225002) . D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

MicroRNAs (miRNAs) sinn 18-25 Nukleotid (NG) -long, Single-gekëmmert noncoding RNS [1]. All Variant zu pri-miRNA, Pré-miRNA oder eeler miRNA kënnen en Afloss déi eeler Prozess an Funktioun vun miRNA, déi weider d'Expressioun vun honnerte vu Proteinen an der Interaktioun Passerelle Afloss hätt [2]. Gewëssermoossen, hunn d'Aktioun vum miRNA en Deel als "oncogene" oder "entholl suppressor Gentherapie" indirekt [3]. VerfÜgung

loosse-7 ass den zweeten identifizéiert miRNA no der Entdeckung vum éischten miRNA, Lin -4 [4] - [6]. Déi loosse-7 Famill huet 10 Memberen, dorënner loosse-7A ze-7g loossen, loosse-7i, Mir-98 an Mir-202. Déi loosse-7 Famill spillt eng wichteg Roll an der normal physiologic Funktioun vum Mënsch ënnerhalen. Zum Beispill, d'pri-miRNA vun loosse-7 Famill mat LIN28 kombinéieren konnt an oofgesinn vun der splicing Prozedur vun Drosha an Dicer, zwee wichteg Restriktioun Enzymen am alen Prozess sensibiliséieren fir all miRNA [7]. Zousätzlech, vun Sax der Drosha Aktivitéit iwwer all d'miRNA eeler Prozess globaalt zu oofgesinn, fonnt Kumar op al dat den Haaptgrond fir d'Aktivatioun a Promotioun vun malignant Transformatioun senger Zell der downregulation vun loosse-7 Famill Ausdrock huet [8]. Obwuel vill virdrun Studien breeder der biologescher Funktiounen vun loosse-7 Famill illustréire matgehollef hun, hun puer Etude op genetesch Variatioune vun Memberen vun der Famill do. wann zwou Persounen ausgewielt goufen zoufälleg ailleurs, kënnen hir genomes 0,1% Diversitéit beweisen, vun deem déi gemeinsam Diversitéit gouf SNP [9]. Well vun der Existenz vun deenen diversities, kann d'selwecht Gentherapie zu verschiddene Gentherapie Ausdrock Produiten nodeems deen an verschiddenen Krankheet waat, ierflech phenotype an hätt vun Krankheet [10]. VerfÜgung

virdrun Etuden bewisen, dass d'pri-miRNA Resultat kéint SNPs kann wéi genetesch ze lues fir en Kriibs Risiko benotzt ginn. Zum Beispill, war pri-Mir-185 rs2008591 mam Risiko vun Broscht Kriibs verbonne [11]; pri-Mir-34b /c rs4938723 war mam Risiko vun hepatocellular Kriibs verbonne [12]. Am Moment studéieren, vun Donnéeën vun NCBI Bioinformatik Datebanke mat, opgefouert mir all SNPs an der Primärschoul Virleefer Beräich vun loosse-7 Famill (600 BP ±), an fonnt dass just 4 SNPs (pri-loosse-7A-1 rs10739971, pri -let-7A-2 rs629367 an rs1143770, pri-loosse-7f-2 rs17276588) haten Minor Allele Heefegkeet (MAF) > 5% an Chinese Bevëlkerung, a si waren alleguer tagSNPs zu Hapmap Datebank. Sou wäit, puer Studien hunn d'Relatioun tëscht de véier tagSNPs a Krankheet-Risiko Cepheid ausser schizophrenic Krankheet [13], Net-kleng Zell haett Kriibs [14] an Diabetiker nephropathy [15] ernimmt. Hir potentiell Roll Kriibs Risiko an en bleift gréisstendeels onbekannt VerfÜgung

Gastric Kriibs ass den zweete Spëtzekandidat Ursaach vum Kriibs Doud weltwäit an eng vun den heefegsten Cancers am Osten asiatesch an Chinese Populatiounsschichte [16] -. [18]. Ënnersich weisen, datt e puer miRNA SNPs mat gastric Kriibs Risiko verbonne waren [19] - [22]. Mä, ob déi genannte-ernimmt véier tagSNPs zu pri-miRNA Genen vun loosse-7 sech mat der Gefor vun gastric Kriibs an atrophic gastritis an Chinese Bevëlkerung verbonnen, ob et als predictive genetesch uweist fir gastric Kriibs benotzt kënne ginn, an der konkreter Mechanismus, wéi se d'Krankheet Risiko nach gin Souzesoen brauchen regléieren. VerfÜgung

an dëser Etude, mir d'Associatioun tëschent dëse véier Kandidat tagSNPs zu pri-loosse-7A an waat gastric Kriibs an hir Virleefer éischt évaluéieren Orchesterdirigéieren eng zwee-Etapp case-Kontroll studéieren an Chinesesch. Mëttlerweil, ze propagéieren mir ob d'Risiko-verbonne polymorphism gastric Kriibs Patienten Iwwerliewe dréit Richtung. Ausserdeem, iwwerpréift mir den Effet vun der Risiko-verbonne polymorphism op hiren alen miRNA Ausdrock vun serum an gastric Otemschwieregkeeten souwéi lant seng méiglech reglementaresche Mechanismus Regulatioun Krankheet Risiko an Iwwerliewe vun modulating. Vun der presentéieren Etude Dirigent, hoffe mir d'Potential Applikatioun Perspektiv vun der studéiert SNP als prewarning uweist fir Persounen mat héije-Risiko vun gastric Kriibs a seng precancerous Krankheet (atrophic gastritis). VerfÜgung

Produktivitéit ze proposéieren VerfÜgung

kennen a studéieren Design VerfÜgung

Dëse Projet gouf vun der ethneschen Comité vun der éischt laizistesch Spidol vun der China Medical University Accord an der Etude war ënnerdeelt an dräi onofhängeg mä Zesummenhang Deeler dorënner Risiko, hätt a Mechanismen Fuerschung . De Risiko Deel gouf zwou Etappen entworf, eent ass Duerchmusterung Etapp an déi aner ass Etapp validéiert. Fir d'Associatioun vun Kandidat SNPs mat gastric Kriibs an atrophic gastritis Risiken entschlësselen, retrospectively der Duerchmusterung Etapp rekrutéiert Echantillon dorënner 338 Fäll, aus 107 gastric Kriibs Patienten, 107 atrophic gastritis Fäll an 124 reagéiert Kontrollen vun der Éischt laizistesch Hospital vu China Medical University tëscht 2005 an 2010. an der validéiert Etapp, ze propagéieren mir eng total vun 1949 Fäll, dorënner 579 gastric Kriibs, 649 atrophic gastritis an 721 gesond Kontrollen vun engem Programm Gesondheet kontrolléieren fir Duerchmusterung gastric Kriibs zu Zhuanghe vun Liaoning Province, China oder vun de Patienten an der éischt laizistesch Hospital vu China Medical Universitéit, tëscht 2002 an 2013. All d'Themen an dëser Etude goufen endoscopically an histologically confirméiert. Der Klassifikatioun vun gastric Kriibs an intestinal-Typ an diffusen-Typ fir Ënnergrupp Analyse ënnerdeelt, déi op Lauren d'Klassifikatioun baséiert war [23], [24]. Der Klassifikatioun an senger Analyse vun gastritis op der Aktualiséiert Sydney System baséiert [25], [26]. Sujeten, déi sech endoscopically an histologically mat normal mucosa oder nëmme minimal gastritis ouni aner systemesch Krankheet oder aner Mo. Krankheeten als Kontrollen confirméiert. Schrëftlech informéiert Autorisatioune goufen aus de Patienten gesammelt, an medezinesch mat der (dorënner Alter, Geschlecht, fëmmen, an Alkohol Konsum) kritt vun Questionnaire an der records huet Kapellen wéi virdrun beschriwwen [24]. VerfÜgung

Fir weider der Associatioun ermëttelen vum Risiko-verbonne polymorphism mat clinicopathologic Parameteren an Iwwerliewe vun gastric Kriibs Patienten, mir Donnéeën vun 150 gastric Kriibs Fäll benotzt, deenen hir Informatiounen vum Doud oder Iwwerliewe war sinn. D'entholl histological Schouljoer vun Weltgesondheetsorganisatioun Critèrë bewäert huet an erhéijen sech mat der 7. Editioun vun der TNM Stadium System vun der International Union Géint Cancer (UICC) /American Gemeinsam Comité op Cancer (AJCC) (2010) baséiert op Thes pathologic Ënnersichung Darmstadt . Patienten (ech) mat fernen Metastasen preoperatively fonnt, (II) deen preoperative radiotherapy Chimiotherapie goen, oder (III) mat onkomplett agebousst Donnéeën Entréen ausgeschloss goufen aus der Iwwerliewe Analys mécht. De Suivi war 2013. Endlech vun August fäerdeg, 150 Patienten goufen an d'Iwwerliewe Analyse abegraff. VerfÜgung

Fir d'Evaluatioun vun Korrelatioun tëscht Risiko-verbonne polymorphism a seng miRNA Ausdrock vun serum, 364 Fäll dorënner 164 gastric Kriibs, 100 atrophic gastritis an 100 gesond Kontrollen goufen iwwerpréift. De Charakter vun abegraff Sujete waren am Zousätzlecht Table S1 gewisen. Ausserdeem, fir de Bilan vun Korrelatioun tëscht Risiko-verbonne polymorphism a seng miRNA Ausdrock vun gastric Otemschwieregkeeten, 97 Net-canceous uplanzen an 94 gastric kriibserreegend uplanzen sech aus 97 Patiente kritt, deen tëscht 2009 gastrectomy um Éischt Affilicated Hospital vu China Medical University mécht an 2013 VerfÜgung

Betreff d'genotyping VerfÜgung

Frankräich DNA ofgebaut gouf wéi virdrun mat e puer Ännerungen beschriwwen [27]. D'genotyping assay war vun CapitalBio (Peking, China), andeems der Sequenom MassARRAY Plattform (Sequenom, San Diego, CA, USA) standing wéi virdru beschriwwen [24]. 5% vun der ganzer Echantillon Gette genotyped, an der concordance Taux huet 100%, Beweis datt d'genotyping war richteg. Déi detailléiert Material waren am Zousätzlecht Method gewisen. VerfÜgung

der Detektioun vun serum H.pylori-IgG titer VerfÜgung

Laut der Method vun der Literatur beschriwwen [28], serum H. pylori VerfÜgung -IgG titer war vun Aktivitéit fonnt Hausnummeren immunosorbent assay (Elisa, Helicobacter pylori IgG Kit; Biohit, Helsinki, Finnland). Déi detailléiert Material waren am Zousätzlecht Method gewisen. VerfÜgung

RNS erauszéien a real-Zäit Hinnen alleguer Reaktioun fir miRNA Ausdrock vun VIVO VerfÜgung

De Quecksëlwer miRNA Method vum serum an Otemschwieregkeeten benotzt war wéi déi beschriwwen Literatur [29] mat e puer Ännerungen. De Géigendeel Transkriptiouns Reaktioun gouf One Step Premier Audiodateien miRNA cDNA (Perfect Real Time) Kit (TAKARA Déi Co., Ltd, Dalian, China) an Real-Zäit Hinnen alleguer Reaktioun benotzt miRcute miRNA qPCR erkennen Kit (SYBR) benotzt (TIANGEN Biotech Co ., Ltd, Peking, China). Déi detailléiert Material waren am Zousätzlecht Method gewisen. VerfÜgung

flüchteg transfection an real-Zäit Hinnen alleguer Reaktioun fir miRNA Ausdrock kënschtlech VerfÜgung

Déi kommerziell Ausdrock plasmid pCMV-Mir-loosse-7A-2 rs629367- C war vun Origene Company (Origene Biotech Co., Ltd, Shanghai, China) kaaft. Dëst plasmid war e Site-spezifesch mutagenesis bei -216 aus C ze A (pCMV-loosse-7A-2 rs629367-A) vun Sainuo Company (Sainuo Biotech Co., Ltd, Peking, China), a confirméiert duerch sequencing gehaal. An de Kandidat Zell Strecken der pri-loosse-7A-2 rs629367 Site ze genotype Nepgen Loescht ob all Variant vun dëser rs629367 polymorphism Site do war. Dann, d'Zell Linnen vun den Wildwest-Typ an och déi ënnescht zwee loosse-7A Ausdrock, SGC-7901 an AGS, sech fir transfection ausgewielt (Méi Detailer gesinn Zousätzlecht Method an Zousätzlecht Dorënner S2). De Mënsch gastric carcinoma Zell Linn, AGS war vun ATCC, American Type Kultur Collection, USA a SGC-7901 gouf aus der Zell Bank vun Chinese Akademie vun de Wëssenschaften, Shanghai, China kaaft kaaft. No 72 Stonnen, war de ganzen RNS vun Zellen ofgebaut a Real-Zäit Hinnen alleguer war bis nogewise loosse-7A Ausdrock nom ëmgekéierte Transkriptiouns fir déi eeler loosse-7A produzéiert vun pCMV-loosse-7A-2 rs629367-A vs. ze vergläichen benotzt pCMV-loosse-7A-2 rs629367-C. VerfÜgung

Statistics VerfÜgung

d'studéiert véier miRNA schiefgang fir Hardy-Weinberg Gläichgewiicht (HWE) ënnert der Kontrollen getest goufen. De weideren Verännerlechen sech als mengen ± normale deviation (Fils) an am Verglach zur Analyse vun Varianz gewisen, während de diskret Verännerlechen den Ofstänn an Prozentzuelen an Verglach vun χ2 Test [24] vertruede waren. Multivariate Logistikzenter Réckgang mat Ännerung vum Alter, Geschlecht a H. pylori VerfÜgung Wonn gouf benotzt der Associatioun tëscht miRNA schiefgang a Krankheet Risiken ze bewäerten. Well fëmmen an Alkohol Konsum bal een Drëttel vermësst Donnéeën hu sech als Upassung Facteuren net gëeegent, nëmmen als stratified Facteure fir Analyse vun der Associatioun tëscht der miRNA schiefgang a Krankheet Risiken. Univariate an multivariate Iwwerliewe analyséiert goufen vun der Läschlëscht-Platz Test an der proportionaler Risikoe Modell Cox duerchgefouert. D'Iwwerliewe Kéiren huet andems der Kaplan-Meier Method Ëmgéigend. Multivariate Iwwerliewe Analyse gouf vun Schan SNP zu all clinicopathological Parameter mat P VerfÜgung &Si besteet higeriicht; 0,05. Ausserdeem goufen d'Kopie vun miRNA benotzt LG Wäert fir eng normal Verdeelung, an den Effet vun miRNA schiefgang op hiren Ausdrock Niveauen sech duerch d'Analyse vun Varianz (ANOVA) Test getest. D'Korrelatioun vun loosse-7A Ausdrock vun serum an Otemschwieregkeeten war den Korrelatioun souguer gemaach ginn vun de Korrelatioun Analyse gewisen. Statistesch Analyse huet mat SPSS Versioun 16,0 Software gesuergt (SPSS, Chicago, IL, USA) an an der Duerchmusterung Etapp, p Wäerter &Si besteet; 0.10 war bedeitendst als wann all aner Analyse p Wäerter &Si besteet considéréiert gouf. 0,05 als bedeitendst VerfÜgung

Resultater VerfÜgung

Main Effet vun miRNA schiefgang op gastric Kriibs an atrophic gastritis Risiko VerfÜgung

d'genotype Ofstänn vun der studéiert SNP am Schädel Bühn waren an Table 1 an der electrophoretogram an sequencing Gestalt gewisen vun dës véier miRNA schiefgang genotypes sech zu Zousätzlecht Dorënner S1 gewisen. pri-loosse-7f-2 rs17276588 war vun weideren Analyse ausgeschloss, well et aus HWE emgeleed. Zwee SNPs sech promisingly considéréiert mat Krankheet Risike verbonnen ze ginn: d'Variant genotype Ofstänn vun pri-loosse-7A-1 rs10739971 tëscht atrophic gastritis a Kontroll Grupp zougedréckt statistesch Ënnerscheed (27.1% vs. 13,7%, P VerfÜgung = 0,018, Table 1), an d'Variant genotype Ofstänn vun pri-loosse-7A-2 rs629367 tëscht gastric Kriibs a Kontroll Grupp och zougedréckt Ënnerscheed (1,9% vs.6.5%, P VerfÜgung = 0,094, Table 1) . Mir als p Wäert &Si besteet; 0.10 als groussen a ausgewielt dës zwee villverspriechenden SNP Siten an der validéiert Etapp VerfÜgung

Fir d'Associatioun vun pri-loosse-7A-1 rs10739971 an pri-loosse-7A-2 rs629367 schiefgang confirméieren. mat gastric Kriibs an /oder atrophic gastritis Risiken, mir dës zwee SNPs zu anere 1949 Fäll vun der erweiterter validéiert Etapp du-bewäert. D'Ofstänn vun der schiefgang an all d'Echantillonen sech zu Zousätzlecht Table S2 gewisen. Gesond Kontrollen waren Frequenz reagéiert zu gastric Kriibs an zu atrophic gastritis Fäll vum Alter (± 5 Joer) an Geschlecht (1:1). No Heefegkeet passend, waren nëmmen 501 gastric Kriibs an 501 Kontrollen fir gastric Kriibs Risiko Analyse an 612 atrophic gastritis an 612 Kontrollen fir atrophic gastritis Risiko Analyse endlech abegraff. An der erweiterter validéiert Etapp, déi abezuelt genotype Ofstänn vun pri-loosse-7A-2 rs629367 tëscht gastric Kriibs a Kontroll Grupp sech statistesch verschidden (6,4% vs. 4,0%, Table 1). Wann mat der gemeinsamer AA genotype Verglach, war d'Aktioun CC genotype mat engem 1.83-fantastesch fräi Risiko vun gastric Kriibs verbonne ( P VerfÜgung = 0,048, 95% CI = 1.01-3.32, Table 1), a war och verbonne mat engem 1.86-fantastesch fräi Risiko vun atrophic gastritis ( P VerfÜgung = 0,032, 95% CI = 1.06-3.28, Table 1). Ausserdeem war d'Aktioun CC genotype mat engem 1.93-fantastesch fräi Risiko vun atrophic gastritis Verglach mat der (AA + AC) genotypes verbonne ( P VerfÜgung = 0,021, 95% CI = 1.11-3.36, Table 1) , awer, huet mir keng statistesch relevant association tëscht pri-loosse-7A-1 rs10739971 a Krankheet Risiken am validéiert Etapp fest. VerfÜgung

Stratified Analyse an interation Analyse VerfÜgung

fir weider d'Potential Afloss ermëttelen vun Alter, Geschlecht an Ëmwelt Facteure wéi Status vun H.pylori VerfÜgung Wonn, fëmmen an Alkohol drénken op genetesch Effekt, standing mir stratified Analysë fir pri-loosse-7A-1 rs10739971 an pri-loosse-7A-2 rs629367 schiefgang baséiert op deene Facteure (Table 2). Mir observéiert verschidden Effeten vun pri-loosse-7A-2 rs629367 op Krankheet Risiko vun verschidden subgroups. Statistique association tëscht CC genotype a fräi atrophic gastritis Risiko huet an Weibercher ( P VerfÜgung = 0,025, ODER [95% CI] = 2,59 [1.13-5.92]), H fonnt. pylori VerfÜgung serology-negativ Ënnergrupp ( P VerfÜgung = 0,036, ODER [95% CI] = 1,97 [1.05-3.73]), an an Net-Drénkwaasser Ënnergrupp ( P VerfÜgung = 0,023 , ODER [95% CI] = 2,44 [1.13-5.26]). Ausserdeem war de CC genotype gin verbonne mat fräi gastric Kriibs Risiko bei Patienten mat Alter ≦ 50 Joer al ( P VerfÜgung = 0,026, ODER [95% CI] = 6,02 [1.24-29.10]) fonnt a H. pylori VerfÜgung serology-negativ subpopulation ( P VerfÜgung = 0,036, ODER [95% CI] = 2,02 [1.05-3.90]). Mä, wa mer d'Interaktioun Analyse tëscht rs629367 SNP a H gesuergt. pylori VerfÜgung Wonn, fëmmen an Alkohol drénken, keen Effekt statistesch Interaktioun fonnt gouf ( P VerfÜgung _{Interaktioun = 0,786 an 0,382 bzw., gesinn Zousätzlecht Table S3). Nee groussen Veräin huet tëscht pri-loosse-7A-1 rs10739971 an gastric Kriibs oder atrophic gastritis Risiken an all stratified Analyse. VerfÜgung}

Korrelatioun tëscht pri-loosse-7A-2 rs629367 polymorphism an clinicopathologic Parameteren an Längt vun Iwwerliewe fonnt vun gastric Kriibs Patienten VerfÜgung

duerch d'Observatioun vun statistesch relevant association tëscht rs629367 an gastric Kriibs an atrophic gastritis Risiko vun der Haaptrei Effekt analyséiert a stratified gebueden, mir weider propagéieren ob de Risiko-verbonne rs629367 mat der clinicopathologic phenotype deemolegt Weltbild an prognostic Iwwerliewe vun gastric Kriibs. D'Resultater weisen, dass keen groussen Korrelatioun vun dësen SNP mat clinicopathological Parameteren dorënner entholl Gréisst, entholl Standuert, Borrmann Typ, histologic Typ, Lauren Typ, TNM Etapp, Wuesstem Muster, Déift vun Invasioun, lymphatic Metastasen fonnt gouf, H.pylori VerfÜgung Wonn Status, fëmmen, drénken, an Famill Geschicht ( P VerfÜgung > 0,05, gesinn Zousätzlecht Table S4), mee dat SNP war verbonne mat gastric Kriibs Iwwerliewe fonnt. D'CC genotype wwerreeche zougedréckt encadréiere Iwwerliewe (CC vs. AA: 22,2 Méint vs. 32,0 Méint) a fräi Stonnen fir gastric Kriibs Patienten zu univariate Analyse (CC vs. AA: P VerfÜgung = 0,011, HR [95% CI] = 3,39 [1.33-8.65]; CC vs. AA + AC: P VerfÜgung = 0,005, HR [95% CI] = 3,51 [1.45-8.49]; Table 3 an Dorënner 1-a an - B). Vun fir verschidden clinicopathological Parameteren ugepasst déi mat gastric Kriibs Iwwerliewe soll Potential confounding Facteuren huet ( zu P ≤0.0001 fir entholl Gréisst, Borrmann Typ, TNM Etapp, Déift vun Invasioun an lymphatic Metastasen, gesinn Zousätzlecht Table S5) statistesch fräi Stonnen sech och fir CC wwerreeche an der multivariate Analyse (CC vs. AA kritt: P VerfÜgung = 0,004, HR [95% CI] = 4,48 [1.60-12.60]; CC vs. AA + AC: P VerfÜgung = 0,001, HR [95% CI] = 4,69 [1.84-11.95], Table 3). VerfÜgung

Korrelatioun tëscht rs629367 an eeler loosse-7A Ausdrock vun serum an gastric Otemschwieregkeeten VerfÜgung

fir d'méiglech Mechanismus vun rs629367 polymorphism ze studéieren ze gastric Kriibs ze dinn, mir propagéieren weider déi eeler loosse-7A Ausdrock vun VIVO a kënschtlech. D'Patienten Charakteristiken fir d'Etude vun den Ausdrock vun serum an Otemschwieregkeeten ausgewielt goufen an Zousätzlecht Table S6 gewisen. An serum Niveau, duerch verschidde Krankheete stratified, hunn mer dat zu atrophic gastritis Grupp, déi eeler loosse-7A Ausdrock vun rs629367 AA, CA, CC genotype eng Tendenz vun graduell waarden gewisen, an deem Ënnerscheed haten eng statistesch Bedeitung (3.30 ± 0,56 géint . 3,52 ± 0,55 gesinn 3.76 ± 0,34, P VerfÜgung = 0,043, Table 4, Dorënner 2-A). An Otemschwieregkeeten Niveau, analyséiert mir den Effekt op loosse-7A SNP genotypes op hiren alen loosse-7A Ausdrock an Otemschwieregkeeten gastric Kriibs, an rs629367 AA fonnt, CA, CC genotype zougedréckt och eng Tendenz vun graduell waarden, obwuel dësem Ënnerscheed statistesch net erreechen Bedeitung (Table 4). VerfÜgung

den alen Ausdrock loosse-7A vun pCMV-Mir-pri-loosse-7A-2 rs629367-a an -C VerfÜgung

éischt, huet de Kandidat Zell Linnen Nepgen der pri-loosse-7A-2 rs629367 Site ze genotype an fonnt dass dës Kandidat Zell Linnen all rs629367 sech Wëllschwäin-Typ (kuckt Zousätzlecht Dorënner S3). An der kënschtlech Niveau, SGC-7901 an AGS Zell Strecken transinfected an zwee plasmids, pCMV-Mir-pri-loosse-7A-2 rs629367-A an pCMV-Mir-pri-loosse-7A-2 rs629367-C. No 72 Stonnen, eeler loosse-7A Ausdrock statistesch Bedeitung vun SGC-7901 Zell Linn ( P VerfÜgung &Si besteet; 0,001, Dorënner 2-B) hat. Abezuelt C allele ausgedréckt eng héich loosse-7A wou mat antike A allele Verglach. D'AGS Zell Linn ass kee statistesch Bedeitung an nëmmen Tendenz am Aklang mat SGC-7901 zougedréckt (kuckt Zousätzlecht Dorënner S4). VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

Baséierend op verschidden Etuden iwwer eeler miRNAs Funktiounen [30], et ass och ugeholl datt miRNA eng wichteg Roll an der Entwécklung vun Kriibs als "oncogene" oder "entholl suppressor Gentherapie" [31] spillen. Allerdéngs, brauch d'Relatioun tëscht miRNA Varianten an Kriibs Risiko souwéi hätt nach Keess ze ginn [32]. Am Moment studéieren, mir gemellt, fir d'éischte Kéier, d'Distributioun Ofstänn vu véier miRNA tagSNPs (pri-loosse-7A-1 rs10739971, pri-loosse-7A-2 rs629367 an rs1143770, pri-loosse-7f-2 rs17276588) am Nordbezierk Chinese. Mir weider an onofhängeg vum villverspriechend polymorphism Siten validéiert an Echantillon erweidert an fonnt abezuelt CC genotype vun pri-loosse-7A-2 rs629367 fräi d'Risiken vun gastric Kriibs an atrophic gastritis bis 1,83 an 1,86 fantastesch, wéi och mat schlechte Iwwerliewe assoziéiert vun gastric Kriibs Patienten. Mir lant weider den Effet vun pri-loosse-7A-2 rs629367 op hiren Ausdrock an der méiglech Mechanismen, an annoncéiert, datt de Mechanismus fir d'oofwiesselnd vun der eeler loosse-7A Ausdrock wéinst kéint, déi schlussendlech der waat an hätt fir gastric ofzeänneren vläicht Kriibs. Fir eis Wëssen, ass dat déi éischt Rapport iwwer d'Relatioun vun rs629367 SNP mat waat an hätt vun gastric Kriibs. VerfÜgung

Well mir wëssen, genetesch Variatiounen, déi zu miRNA Genen och hir pri- an Pré-miRNA Regiounen optrieden , hätt Geleeënheet puer biologic Weeër an Afloss Krankheet Heefegkeet [33] ze beaflossen. Sou, fir en Kriibs Risiko [32], [34] pri- an Pré-miRNA schiefgang wéi genetesch lues kënnt, wat méi Virdeel a Stäerkten hu wéi Gentherapie schiefgang coding um en Potential benotzt ginn well miRNAs dacks zu Kriibs-verbonne Frankräich läit Regiounen [35] an hätt bal all d'Zeechesaatz Genen [36] regléieren. Kuerzem, verschidde Studien do op de Pre-miRNA schiefgang op der Desaccord-Glück läit, wéi Pré-mir-196a2 rs11614913 [37], Pré-mir-146a rs2910164 [38], Pré-mir-499 rs3746444 [39], [40], Pré-mir-149 rs2292832 [41], rs895819 Pre-mir-27a [42]. Wéinst der Komplexitéit vun RNS Plaz Struktur, waarden Opmierksamkeet missen SNP op pri-miRNA bezuelt ginn. D'Vertrieder pri-miRNA SNPs sech pri-Mir-185 rs2008591 mat Broscht Kriibs verbonne [11], pri-Mir-34b /rs4938723 c mat hepatocellular Kriibs verbonne [12], pri-Mir-30c rs928508 [22] an pri-Mir -938 rs2505901 [43] mat gastric Kriibs assoziéiert. Loosst-7 Famillje waren déi virdrun identifizéiert miRNAs [4] an eng wichteg Roll spillen déi normal physiologic Funktioun vum Mënsch an ënnerhalen. Andeem Dir NCBI Bioinformatik Datenbanken, fonnt mir 4 SNPs an der Primärschoul Virleefer Beräich vun loosse-7 Famill (pri-loosse-7A-1 rs10739971, pri-loosse-7A-2 rs629367 an rs1143770, pri-loosse-7f-2 rs17276588) haten Minor Allele Heefegkeet (MAF) > 5% an Chinese Bevëlkerung, déi all tagSNPs mä hiren Potential en Chargen goufen bekannt waren. Am Moment studéieren, vun Schädel an ausseet zwou Etappen Etude mir fonnt éischt, datt, dorënner 4 tagSNPs, pri-loosse-7A-2 rs629367 polymorphism mat waat gastric Kriibs (abezuelt CC genotype vun pri-loosse-7A-2 verbonne war rs629367 fräi d'Risiken vun gastric Kriibs an atrophic gastritis bis 1,83 an 1,86 fantastesch). Dëst pri-loosse-7A-2 rs629367 SNP am afgerappt 3'-UTR etabléiert huet, wat den nooste SNP mat den alen miRNA Genen ënnert de véier Duerchmusterung SNPs war, an et géif eng nei uweist an en gastric Kriibs Risiko ginn.

Mir standing weider univariate an multivariate proportional Risikoe Réckgang Cox Analyse vun de Suivi Daten déi Associatiounen vun pri-loosse-7A-2 rs629367 SNP mat globale Iwwerliewe vun gastric Kriibs Patienten ze entdecken. Konsequent bedeitendst Resultater goufen aus univariate an multivariate Cox Modeller (Table 3) observéiert. D'pri-loosse-7A-2 rs629367 Variant CC genotype wwerreeche zougedréckt fräi HR mat enger P VerfÜgung -value vun 0.011 (HR = 3.39) an 0.005 (HR = 3.51) wou mat AA Wildwest-Typ an AA Verglach + AC genotype respektiv an univariate Analyse. Well e puer clinicopathological Parameteren vill ze beurtelen gastric Kriibs Iwwerliewe dréit ( P ≤0.0001 fir entholl Gréisst VerfÜgung, Borrmann Typ, TNM Etapp, Déift vun Invasioun an lymphatic Metastasen), opgeféiert mir Analyse mat Upassung fir déi potentiell confounding Facteuren an der multivariate Analyse. Kooperativ, hunn mir d' P VerfÜgung -value vun dëser rs629367 SNP war méi groussen a statistesch Stonnen waren och fräi (CC vs. AA: P VerfÜgung = 0,004, HR = 4,48; CC vs. AA + AC: P VerfÜgung = 0.001, HR = 4.69 bzw.) suggeréiert datt pri-loosse-7A-2 rs628367 vläicht eng onofhängeg Risk Faktor fir gastric Kriibs hätt ginn VerfÜgung

puer Studien. Teamchef miRNA schiefgang miRNA Veraarbechtung an Ausdrock vun alen miRNA a spillen eng wichteg Roll am carcinogenesis [12], [33] leider. Fir d'méiglech Mechanismus vun rs629367 polymorphism ze studéieren ze gastric Kriibs ze dinn, an dat studéieren, ze propagéieren mir den Effet vun pri-loosse-7A SNP op den alen loosse-7A Ausdrock souwuel VIVO a kënschtlech. Kontrollen fir d'Krankheet Faktor, mir an den serum atrophic gastritis Grupp fonnt, déi eeler loosse-7A Ausdrock vun rs629367 AA, CA, zougedréckt CC genotype e wesentleche graduell erop ( P VerfÜgung = 0,043, Table 3). Dëst kéint deelweis de Phänomen erklären, dass d'Aktioun CC genotype vun rs629367 enger Frequenz héich Verdeelung Équipe an atrophic gastritis Grupp wéi zu Kontroll Grupp (6,2% vs. 3,9%, Table 1). D'Relatioun vun rs629367 CC genotype mat fräi atrophic gastritis Risiko uginn, datt dat SNP mat atrophic gastritis an souguer gastric Kriibs méiglecherweis duerch d'oofwiesselnd vun der eeler miRNA Ausdrock, deen domadder de waat fir gastric Kriibs Afloss verbonne war. Op der Basis vun den Ausdrock Niveau vun VIVO, weider mir de ausgedréckt plasmid wouvun pri-loosse-7A-2 rs629367 Wildwest-Typ A allele an abezuelt C allele fir déi eeler loosse-7A Ausdrock vun de zwou verschidde allele ze observéieren gebaut. Mir hu fonnt, dass no transinfection, SGC-7901 Zellen mat pCMV-Mir-pri-loosse-7A-2 rs629367-C allele héich bewisen eeler loosse-7A Ausdrock wéi déi vun enger allele ( P VerfÜgung &Si besteet; 0,001, Figur 1). D'Resultat vun der kënschtlech Experimenter kritt huet mat deem vun der VIVO accordant, déi och léist datt pri-loosse-7A-2 rs629367 polymorphism den alen loosse-7A Ausdrock Afloss konnt an waat fir gastric Kriibs ofzeänneren. Puer Studien gemellt dass loosse-7A entholl suppressor war [44], [45]. Mir spekuléieren, datt d'Variant vun A bis C kéint Originalgréisst Funktioun vun entholl suppressing Verloscht, wat fir Iwwregens hätt gastric Kriibs waat an Virwaat aarmséileg Iwwerliewe ofzeänneren konnt. VerfÜgung

Gastric Kriibs enger Multi-factorial Krankheet déi genetesch predisposition ëmmer ass souwéi Ëmwelt- Faktoren [46]. Fir d'Potential Afloss vun Alter, Geschlecht an Ëmwelt Facteure wéi Status vun H.pylori VerfÜgung Wonn, fëmmen an Alkohol ermëttelen op genetesch Effekt drénken, analyséiert mer weider d'Auswierkunge vun méiglechen Afloss Faktoren op dëser pri-loosse-7A -2 rs629367 SNP, an fonnt pri-loosse-7A-2 rs629367 war nëmmen mat Krankheet Risiken am H. pylori VerfÜgung serology-negativ Patienten Grupp an Net-Drénkwaasser Grupp. An H. pylori VerfÜgung serology-negativ Patienten, déi Örs fir d'Associatioun vun rs629367 SNP an atrophic gastritis an nik gastric Kriibs Risiken 2,12 an 1,97 fantastesch ze ginn, wat méi héich wéi d'Örs am ganze Fäll war (1.83 an 1,86 fantastesch, bzw.) . Allerdéngs war et kee statistesch Bedeitung vun H. pylori VerfÜgung serology-positiv Patienten. Den Zerfall, war dëst Phänomen och an der stratified Analyse vum Drénkwaasser observéiert: an Net-Drénkwaasser Grupp, de ODER fir d'Associatioun vun rs629367 SNP an atrophic gastritis Risiko nik 2,39 fantastesch ze ginn, iwwerdeems et keng statistesch Bedeitung vun Drénkwaasser Grupp war. Dëst kann well de H.pylori VerfÜgung an drénken mat der Heefegkeet vu gastric Kriibs verbonne waren. Brenner et al. war eng néideg Ursaach fir gastric Kriibs [47], an Tramacere et al hat Hypothes, datt H.pylori VerfÜgung. fonnt, datt do eng staark association tëschent Drénkwaasser an Heefegkeet vun gastric Kriibs [48], [49]. Dofir, huet d'Entféierung vun deenen zwou Ëmwelt- Faktoren der Örs méi héich wéi de ganze Echantillonen analyséiert.

• PLOS NËMMEN: D'gewënnt-Like Receptor Material Passerelle an Helicobacter pylori Wonn an Contenu Gastric Cancer: Eng Case-Control Sécuritéit an Gene Expression Analyses
• PLOS NËMMEN: Laparoscopic Mëlz-erhalen Splenic Hilar Lymphadenectomy Leeschtung vun der Perigastric Fascias No an der Intrafascial Space fir Détailléiert Uewerstad-Drëtte Gastric Cancer