Questi sono chiamati batteriofagi, e un gruppo di loro che prende il nome dal villaggio di Colney, nel Norfolk, potrebbe aiutare a combattere C. difficile infezioni.
Clostridioides difficile, conosciuto anche come C. diff , è una specie di batterio che infetta l'intestino umano. Può diventare un grosso problema quando i nostri normali microbi intestinali sono compromessi, più comunemente durante un ciclo di antibiotici. Questo porta ad una crescita eccessiva di C. difficile , con le tossine che produce causando diarrea e grave infiammazione.
Il trattamento prevede ulteriori cicli di antibiotici, ma le ricadute e le infezioni ricorrenti sono comuni. I ceppi stanno diventando più resistenti agli antibiotici e più capaci di causare malattie gravi, quindi c'è una chiara necessità di altri trattamenti.
Questo ha spinto i ricercatori di Norwich a cercare il nemico naturale dei batteri, batteriofagi. Ne hanno proiettati 27 diversi C. diff ceppi per eventuali batteriofagi, trovarne uno, che chiamarono ΦCD27 (phiCD27). Il sequenziamento del genoma ha confermato che questo fago non era stato scoperto prima. Infatti, i membri dell'International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) decisero che era geneticamente abbastanza distinto da formare un nuovo gruppo, o genere di fagi.
L'ICTV ha deciso di nominare il nuovo genere Colneyvirus , dopo il discorso in Colney Lane dell'Institute of Food Research (IFR) nel Norwich Research Park, dove è stato scoperto per la prima volta. Da allora IFR è passato al Quadram Institute e si è trasferito in un nuovo edificio, anche all'interno della parrocchia civile di Colney. Sebbene la parrocchia di Colney abbia una popolazione di sole 120 persone, è ancora "sede" di quattro istituti di ricerca leader a livello mondiale, uno dei più grandi ospedali universitari del Regno Unito, più una squadra di calcio della Premier League.
Da allora sono state identificate altre quattro specie di colneyvirus e a giugno l'ICTV ha annunciato la creazione ufficiale del virus Colney genere.
Ma cosa C. diff armi da sparo ha il primo Colneyvirus nel suo arsenale?
I fagi esistono e si riproducono iniettando il loro materiale genetico nei batteri, e utilizzando il macchinario dell'ospite per costruire nuovi virus all'interno della cellula. Quindi rilasciano enzimi chiamati endolisine che distruggono la parete cellulare batterica, liberando i nuovi virus.
I ricercatori hanno trovato il gene per l'endolisina di ΦCD27 nella sequenza del genoma e lo hanno inserito in un altro batterio, E. coli in modo che potessero produrre e purificare l'endolysin. Hanno scoperto che era attivo contro 30 diversi C. diff tensioni, compresi i ceppi ipervirulenti dietro l'attuale epidemia. È importante sottolineare che l'endolisina non ha influenzato altre specie batteriche che comunemente compongono il microbioma intestinale umano.
''Questo fago e l'endolisina codificata dal suo genoma possono fornire un approccio mirato per combattere le infezioni da C. diff, in contrasto con l'uso di antibiotici ad ampio spettro che causano danni collaterali inibendo altri membri della popolazione batterica intestinale'', ha affermato il professor Arjan Narbad, Capogruppo presso l'Istituto Quadram.
Però, per essere efficaci le endolisine devono essere somministrate nell'intestino, quindi il team ha anche inserito il gene in un ceppo di batteri dell'acido lattico che è stato precedentemente utilizzato per fornire proteine e vaccini nell'intestino.
Il team di ricerca ritiene che ciò fornisca una piattaforma per futuri nuovi trattamenti da combattere C. diff . C'è ancora molto da fare per perfezionare il sistema, ma nella battaglia contro questa pandemia batterica, il Colneyvirus potrebbe essere un alleato vitale.
Dott.ssa Evelien Adriaenssens, Presidente della sottocommissione sui virus batterici, ha proposto il nome colneyvirus con altri membri dell'ICTV. Non è stata coinvolta nella scoperta iniziale dei fagi del Colneyvirus, ma in seguito spostò le sue ricerche sulla stessa Colney, creando il suo gruppo di ricerca nel Quadram Institute.
Come tassonomisti dei batteriofagi, responsabile della classificazione e della denominazione di nuovi taxa, cerchiamo sempre di onorare le persone, luoghi o istituti coinvolti nella prima descrizione di un nuovo gruppo di fagi. In questo caso, Ho avuto l'opportunità di aiutare a creare e nominare un nuovo genere di fagi basato su una scoperta dei miei colleghi, fatto molto prima che entrassi a far parte del Quadram Institute. È appropriato nominare il genere come Colney, dove si fa tanta scienza eccellente ."
Dott.ssa Evelien Adriaenssens, Presidente della sottocommissione sui virus batterici, Istituto Quadram