A publikált eredmények megjelennek a tudományos folyóiratban mBio .
A Translational Genomics Research Institute (TGen) kar, a Hope City társvállalata, Észak -Arizonai Egyetem (NAU), Arizonai Egyetem (UArizona), és az Arizona State University (ASU) áprilisban elindította az ACGU-t azzal a kifejezett céllal, hogy nyomon kövesse a COVID-19 kórokozóját, SARS-CoV-2:hogyan fejlődik és hogyan terjed át, Arizonán belül és azon kívül.
Az ACGU a SARS-CoV-2 genomot szekvenálta a lehető legtöbb vírus-pozitív betegmintában Arizonában, és együtt dolgozni Arizona közegészségügyi tisztviselőivel, az eredményeket a betegek tesztelésére és nyomon követésére irányuló, országos erőfeszítésekhez alkalmazta, valamint útmutatást nyújtanak az arizonai közpolitikai döntéshozóknak.
Az ASU és a Maricopa megyei közegészségügyi tisztviselők gyors intézkedései, Az ACGU tudósai egyetértenek abban, valószínűleg megtartotta az első azonosított COVID-19 beteget Arizonában-egy diákot, aki nemrég tért vissza Hubei-ból, a kínai tartomány, ahonnan a betegség ered - kitörés gyújtása miatt, és megakadályozta, hogy Arizona korai epicentruma legyen a fertőzésnek.
"Ez egy nagyszerű példa arra, hogy a gyors és alapos közegészségügyi válasz hogyan lehet sikeres a betegség terjedésének megakadályozásában, - mondta Dr. Paul Keim, az ACGU igazgatója, Regents biológiai tudományok professzora és Cowden mikrobiológiai katedra a NAU -ban, valamint a NAU Patogén és Mikrobiómi Intézetének ügyvezető igazgatója.
"Hasonló lépések tehetők a vállalkozások és iskolák újbóli megnyitására irányuló jövőbeni erőfeszítések kialakításakor, annak ellenére, hogy a vírus tovább terjed, és az emberek továbbra is fogékonyak, - tette hozzá Keim, aki a TGen Kórokozó és Mikrobiom osztályának kiváló professzora és társigazgatója is.
Dr. Michael Worobey, az ACGU társalapítója és az Arizonai Egyetem Ökológiai és Evolúciós Biológiai Tanszékének vezetője, egyetért.
"Ez a kombináció, hogy a beteg helyesen cselekszik, hogy elszigetelje magát, és tisztában legyen azzal, hogy esetleg volt ilyen betegsége, és a közegészségügyi tisztviselők minden helyes dolgot megtesznek. A COVID-19 betörésének leállítása Arizona állam győzelme volt, - mondta Worobey doktor.
Ez értékes időt adott Arizonának a felkészülési erőfeszítésekhez. Az első bejelentett "közösségi" átviteli eset Arizonában történt március elején, a februárban felfedezett washingtoni államjárványból.
Az arizonai COVID-19 esetek SARS-CoV-2 genomszekvenciáinak több mint 80% -a legalább 11 különálló nemzetségből származik, amelyek kezdetben széles körben terjedtek Európában, és azóta az utazások uralják a járványt az Egyesült Államokban. A megfigyelt átviteli csoportok egyike sem járványügyi kapcsolatban az eredeti utazással kapcsolatos esettel Arizonában, sikeres korai elszigeteltségre és karanténra utal.
Az ACGU a legmodernebb szekvenátorokat használja, egyéni számítási elemzési munkafolyamatok, és szuperszámítógépek a vírus RNS genomjának szekvenciájának meghatározására, ami alig 30 alatt van, 000 bázis hosszú. Ellentétben, közel 3 milliárd bázis található az emberi genomban, amelyek olyan egyszerű tulajdonságokat határoznak meg, mint a szem és a hajszín, és olyan bonyolult, mint az egyén rákra és más betegségekre való hajlama.
A TGen eddig közel 3 szekvenálta a SARS-CoV-2 genomot 000 COVID-19 pozitív minta az ACGU számára, és további szekvenálást végeztek az ASU -ban és az UArizonában, a több mint 200 közül, 000 pozitív eset Arizonában, így ez az egyik legerősebb ilyen erőfeszítés a nemzetben. Az ACGU megkapja az állam által gyűjtött arizonai mintákat, megye, törzsi és magán egészségügyi rendszerek.
Az ACGU tudósai kihasználják a vírus genomjának apró változásait vagy mutációit, amelyek természetesen a vírus szaporodásával idővel előfordulnak, nyomon követni a vírus terjedését. Összehasonlítva az Arizonában megfigyelt mutációkat a világon keringő törzsekben jelenlévőkkel, meg tudják határozni, hogy mikor és honnan vitték be a vírust Arizonába.
A molekuláris óraelemzés segítségével a kutatók azt találták, hogy az arizonai szekvenciák többségét két vonal-és több alvonal-képviseli, amelyek nagy része valószínűleg belföldi utazások útján került bevezetésre, de némi bizonyítékkal a nemzetközi behozatalra.
"Az ACGU -n keresztül, kamatoztatjuk a virológiai szakértelmet, genomika, az evolúció és a bioinformatika az egész Arizonából annak érdekében, hogy ezeket a genomiális adatokat gyorsan cselekvő betekintéssé lehessen alakítani, amelyek kiegészíthetik az állam közegészségügyi válaszát, "Dr. Keim azt mondta." Ezek az eredmények bizonyítják a népegészségügyi kapcsolatok nyomon követésének és az önszigetelés erejét, miután pozitív tesztet végeztek a fertőzések előrehaladásának megakadályozására. "
Dr. David Engelthaler, A Flagstaff -i TGen North igazgatója, amely magában foglalja az intézet fertőző betegségek ágát, az ACGU kezdeti megállapításai azt mutatják, hogy az egyes közösségek hogyan minden állam saját történetet ír arról, hogy mi történik a COVID-19 világjárványban.
"Meg kell értenünk mindazokat a cselekményvonalakat, amelyek odáig vezettek, ahol most vagyunk, - mondta Dr. Engelthaler, az ACGU másik társalapítója. "Amikor ezt a betegséget január 26 -án észlelték Arizonában, a közegészségügy azonnal belevágott, hogy megbizonyosodjon arról, hogy minden kapcsolatot azonosítottak, mintákat gyűjtöttek, és a beteget nagyon figyelmesen figyelték a következő hetekben, hogy megbizonyosodjanak arról, hogy nincs több eset. "
A következő hónapokban, ő mondta, szükség lesz a COVID-19 kitörések nyomon követésére és járványügyi falak építésére minden eset körül, különösen a leginkább veszélyeztetettek számára:65 évnél idősebb személyek, tartós ápolási intézményekben tartózkodók, börtönök, és azok, akiknek már vannak egészségügyi problémáik.
"Amikor nincs szemed erre, ha nincs kapcsolatkövetés, akkor valóban könnyen tud személyről emberre mozogni, "Engelthaler doktor azt mondta." Nagyon hasznos, ha a közpolitikai döntéshozók helyben megalapozott döntéseket hoznak. "
Dr. Efrem Lim, virológus, aki az ASU csapatát vezeti, szerint a SARS-CoV-2 genomszekvencia-adatok előnyt jelenthetnek az egészségügyi szolgáltatóknak és az állami döntéshozóknak a járvány elleni küzdelemben.
A vírus és mutációinak átvitelének nyomon követése biztosítja, hogy a kifejlesztett terápiák és vakcinák a helyes irányba menjenek. Most már tudjuk, hogyan néz ki közösségeinkben a SARS-CoV-2 vírus a szekvencia szintjén. "
Dr. Efrem Lim, Virológus és adjunktus, Biodesign Intézet, Arizona Állami Egyetem
A nyers állateledel veszélyezteti az embereket és az állatokat
A tanulmány feltárja a kurkumin vírusellenes hatásait
Szivárgó bél és űrrepülés - derült ki a mechanizmusból
A matematikai modell feltárja a SARS-CoV-2 fertőzés kockázatát a széklet mikrobiota transzplantációja után
A szívrohamhoz kapcsolódó mikrobák tanulmányt találnak
A tudósok az A típusú vért univerzális O -típusúvá változtatják,
A mikrobák előre jelezhetik a halálos kimenetelű szellőztetett COVID-19 betegeknél
Jelenléte Mycoplasma salivarium a COVID-19 fertőzésben szenvedő, szellőztetett betegek alsó légútjaiban fokozott halálozási valószínűséggel jár. Az eredmény egy molekuláris vizsgálat része volt, ame
A szájhigiénia és a COVID-19 súlyossága-a kapcsolat
Brit kutatók összefüggést találtak a rossz szájhigiénia és a súlyos akut légúti szindróma koronavírus 2 (SARS-CoV-2) fertőzés okozta COVID-19 betegség súlyossága között. Victoria Sampson kutatók tanul
Az ősi főemlősök mikrobiomái több információt adhatnak az emberi fejlődésről
Az ősi emberi mikrobiomák a mikroszkóp alatt vannak, amit a tudósoknak mondanak a régen élő emberekről. Új tanulmány jelent meg a folyóiratban Határok az ökológiában és az evolúcióban 2020 februárjá