PLoS One: A azonosítása és jellemzése Novel N¹glikán alapú biomarkerek gyomorrákban

absztrakt katalógusa

Háttér és célkitűzések katalógusa

azonosítása és validálása N¹glikán biomarkerek gyomorrák (GC) és a kiváltó mögöttes molekuláris hatásmechanizmusa. Katalógusa

módszerei

összesen 347 egyének, beleértve azokat a betegeket a GC (gyomor rák), vagy atrófiás gastritis és egészséges kontrollok, véletlenszerűen osztottuk képzési csoport (n = 287) és egy retrospektív érvényesítési csoport (n = 60). A szérum N¹glikán profilalkotás volt elérhető DNS-szekvenáló támogatott /fluorophore-segített szénhidrát elektroforézissel (DSA-FACE). Két diagnosztikai modellek épültek alapján az N-glikán profilok logisztikus lépésenkénti regresszió. A diagnosztikai teljesítménye az egyes modellek értékelték retrospektív, prospektív (n = 60), és a nyomon követés (n = 40) korosztályok. Lektin-blot vizsgálatot végeztünk annak meghatározására, mag teljes-fucosylation, és a részt vevő gének expresszióját a mag-fucosylation GC analizáltuk reverz transzkriptáz-polimeráz láncreakció.

Eredmények

azonosított legalább 9 N-glikán struktúrák (csúcsok) és a szintek a mag fukóz maradványok és fukozil-transzferáz szignifikánsan csökkent a GC. Két diagnosztikai modellek, kijelölt GCglycoA és GCglycoB, épültek különbséget GC kontroll és sorvadásos gyomorhurut. A területek a vevő működési karakterisztika (ROC) görbék (AUC) mindkét GCglycoA és GCglycoB voltak magasabbak, mint a CEA, CA19-9, CA 125 és CA72-4. Összehasonlítva a CEA, CA19-9, CA 125 és CA72-4, érzékenységét GCglycoA nőtt 29.66%, 37.28%, 56,78% és 61,86% -kal, és a pontosság növekedett 10,62%, 16,82%, 25,67% és 28,76% volt . Mert GCglycoB, az érzékenység fokozott 27,97%, 35,59%, 55,09% és 60,17%, a pontosság nőtt 21,26%, 24,64%, 31,40% és 34,30%, szemben a CEA, CA19-9, CA125 és CA72-4, ill. Miután kuratív műtét, a mag fukoziiált csúcsát (3) és a mag teljes fukoziiált N-glikánok (sumfuc) fordított. Katalógusa

Következtetések katalógusa

Az eredmények azt mutatták, hogy a diagnosztikai alapuló modellek N- glikán markerek értékes és nem invazív alternatíva azonosítására GC. Arra a következtetésre jutottunk, hogy a csökkent mag-fucosylation mindkét szövetben és a szérumban GC betegek eredhet a csökkent expressziója fukozil-transzferáz.

bevezető hivatkozás: Liu L, Yan B., Huang J., Gu Q, Wang L, Fang M, et al. (2013) A azonosítása és jellemzése Novel N¹glikán alapú biomarkerek gyomorrákban. PLoS ONE 8 (10): e77821. doi: 10,1371 /journal.pone.0077821 katalógusa

Szerkesztő: Rakesh K. Srivastava, The University of Kansas Medical Center, Amerikai Egyesült Államok katalógusa

Beérkezett: May 14, 2013; Elfogadva: szeptember 4, 2013; Megjelent: október 17, 2013 katalógusa

Copyright: © 2013 Liu et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a munka támogatta a Nemzeti Természettudományi Alapítvány Kína (Grants 81102693 és 81102565). A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

a gyomorrák (GC) a negyedik leggyakoribb rák és a harmadik vezető oka a rák okozta halál előfordulási gyakorisággal mintegy 930.000; Évente ez felelős a több mint 700.000 halnak meg világszerte, és az ötéves túlélési arány 20-30% volt [1]. Azoknál a betegeknél, a GC, túlélés által diktált patológiai a betegség stádiumától, a diagnózis idején. Sajnos, a közös tünetei a GC nem specifikusak a betegségre, és a korai szakaszban a GC nem okozhat észrevehető tüneteket. Annak ellenére, hogy egyre növekvő ismerete a molekuláris mechanizmusok, amelyek szabályozzák a malignus transzformáció és metasztázis, a teljes túlélési aránya betegek GC nem javult jelentősen. Számos molekulát ajánlott GC biomarkerek, beleértve karcinoembrionális antigén (CEA) a posztoperatív megfigyelés, szénhidrát antigén 19-9 (CA19-9), szénhidrát antigén 125 (CA 125) és szénhidrát antigén 72-4 (CA72-4) [2- 6]. Azonban ezek egyike sem tumormarkerek bebizonyította elég érzékeny és specifikus diagnosztizálására GC korai szakaszában. Alternatív gasztroszkópia sebessége növelhető végleges diagnózist, de diagnosztikus értéke gasztroszkópia korlátozza költségek, kockázatok és kellemetlenségek. Ezért van sürgős szükség a fejlesztés nem invazív biomarkerek, amelyek lehetővé teszik a korai felismerés a GC. Katalógusa

Egyre több bizonyíték utal, a megváltoztatásához az N-kapcsolt glikán lehet tekinteni, mint egy potenciális biomarkerek diagnosztizálására rák. Korábbi tanulmányok figyelték meg jelentős változásokat az N-kapcsolt glikán különböző rákos megbetegedések és rákos sejtvonalakban, amely magában foglalja a hasnyálmirigyrák, emlőrák, prosztatarák, petefészekrák és a májrák [7-11]. További analízis GC is felfedte, hogy a szabad komplex típusú N-glikánok felhalmozódott MKN7 és MKN45 sejtvonalak [12]. Azonban a fluktuáció és a variáció az N-kapcsolt glikán GC betegek még jórészt ismeretlen. Katalógusa

A korábbi vizsgálatok során DNS-szekvenáló támogatott /fluorophore támogatott kapilláris elektroforézis (DSA-FACE), azt bizonyította, hogy a elágazó α-1,3 fukoziiált háromantennás glikán és kétantennás glikán voltak nagyon specifikus és érzékeny jelölt HCC biomarkerek [13]. A jelenlegi vizsgálat során alkalmaztunk, DSA-FACE visszamenőleg profil szérum N-glikánok betegektől származó mintákban GC vagy sorvadásos gyomorhurut és egészséges egyének. Mi jellemzi az azonosított GC N¹glikán markerek vevő működési karakterisztika (ROC) görbék és ellenőrizte a markerek leendő és a nyomon követés korosztályok. Célunk az volt, hogy azonosítsa ígéretes biomarker előrejelzésére és felderítésére GC jobb specificitás és szenzitivitás. Katalógusa

Anyagok és módszerek katalógusa

1.1: Retrospektív kohorsz katalógusa

A vizsgálati protokollt jóváhagyta a kínai Etikai Bizottság az emberi erőforrások a második katonai Orvostudományi Egyetem. Írásos beleegyezését adta a betegek és az egészséges kontrollok. Katalógusa

Összesen 247 beteg GC (n = 138), vagy atrófiás gastritis (n = 109) vettek fel 2010 és 2012 között a diagnózis minden a betegeket mindhárom szövettanilag is megerősítették 2 patológusok Changhai Kórház, második Katonai Orvosi Egyetem (Shanghai, Kína). A kontroll csoportban, 128 korban és nemben illeszkedő egészséges önkéntes (betegségtől mentes) vontunk be ugyanebben az időszakban. Az átlagos életkor, és a nemi megoszlása ​​egyezett a 3 csoport. Egy összefoglaló a beteg adatait az 1. táblázat tartalmazza GC kapó betegek preoperatív sugárkezelés, kemoterápia, vagy sugárkezeléssel kizárták a vizsgálatból. Matton átlag ± SD vagy Nem (%) hotelben Jellemző
Control (n = 128) hotelben sorvadásos gyomorhurut (n = 109) hotelben GC (n = 138) hotelben Age, y50.10 ± 5.9552.11 ± 6.2951.01 ± 6.01Men75 (58.59) 60 ( 55,05) 70 (50,72) CEA-pozitív 5 (3,91) 23 (21,10) 62 (44,93) CA19-9-pozitív 11 (8,59) 20 (18,35) 53 (38,41) CA125-pozitív 7 (5,47) 10 (9,17) 28 (20.29) CA72-4-pozitív 8 (6,25) 12 (11,01) 22 (15,94) TNM stageI22 (15.94) II28 (20.29) III63 (45,65) IV25 (18.12) 1. táblázat jellemzői képzési csoport. katalógusa rövidítések : GC, gyomorrák; SD, szórás. CSV letöltése CSV

Összesen 60 beteg (20 mindegyik csoportban) véletlenszerűen kiválasztott 3 csoport a fentiekben ismertetett utólagos ellenőrzése; A többi beteg (n = 315) vontak be a képzési állítva össze a diagnosztikai modell. A 2 éves vizsgálat, 40 138 beteg GC a képzési csoport követtük előtt és után kuratív műtét, a rendelkezésre állás alapján. A képzés csoportban 118 beteg GC, 89 beteg sorvadásos gyomorhurut, és 108 egészséges kontroll. Katalógusa

Laboratóriumi és klinikai adatok az összes résztvevő nyert klinikai orvosi feljegyzések, patológia jelentések, valamint a személyes interjúk. Az összegyűjtött adatok szerepelnek, nem, életkor és a gyomorrák funkciók (például a tumor helye, a szövettani grade, mélysége invázió, és a nyirokcsomó metasztázis). A szérum mintákat vettünk előtt sebészi reszekció; ezeket a mintákat gyűjtöttünk a teljes vér egy standard protokoll, centrifugáltuk 10,000xg 20 percig, és -80 ° C-on. A betegség progressziója a GC betegek besorolása szerint a hetedik kiadása az amerikai vegyes bizottság [14]: 20 beteg (16,95%) volt I. stádiumú, 25 (21,17%) volt színpadi II betegség, 54 (45,76%) stádiumú volt III-betegség, és 19 (16,10%) stádiumú volt IV betegség. katalógusa

1.2: prospektív kohorsz katalógusa

Hogy értékelje a prediktív értéke a modellek létrehozott retrospektív fent leírt prospektív vizsgálatot folytatott további kohorsz (n = 60) betegek GC (n = 20) vagy sorvadásos gyomorhurut (n = 20) és egészséges egyének (n = 20) a 2012. május november 2012 ugyanabban a kórházban. Az eljárások és stratégiák ugyanaz volt, mint a fent leírt.

1,3: szövetmintákat

szövetmintákat nyertünk 20 138 GC beteg; 2 szelet, egy tumoros és egy szomszédos szövet minta vettünk. A szövetmintákat (körülbelül 1 cm ^{3) azonnal lefagyasztottuk -80 ° C-on, és alávetni reverz transzkriptáz-polimeráz láncreakció (RT-PCR) és lektin-blot. Minden szöveteket használtunk összhangban Intézményi Review Board szabályzata a második katonai Orvostudományi Egyetem. Katalógusa}

1.4: Rutin kimutatása tumormarkerek

A rutin tumormarker vizsgálatot végeztünk standard eljárások és reagensek . CEA és CA19-9 szinteket határoztuk meg egy Abbott i2000, és CA72-4 és CA125 szinteket mértük Roche Cobas E601. A cut-off szint a gyártó által ajánlott CEA, CA19-9, CA 125 és CA72-4 volt 5,0 mg /l, 39 U /L, 40 U /ml és 9,8 U /ml, ill. A vizsgálatokat végeztünk a Laboratóriumi Medicina Intézet, Changhai Kórház, a második katonai Orvostudományi Egyetem, Shanghai. Katalógusa

1.5: A szérum fehérje N¹glikán profilalkotás katalógusa

A szérum fehérje N¹glikán analíziseket a korábban leírtak [13]. Röviden, az N-glikánok 2

• PLoS One: rossz prognózis a foszfatáz májszövetéből 3 Expression gyomorrákban: A Meta-Analysis
• PLoS One: VEZT, a Novel feltételezett tumor szupresszor, meggátolja a növekedési és tumorgenézisre Gyomorsav Cancer