Pozadina pregled
genetske varijante nukleotid-vezujući oligomerizacije domene koje sadrže protein (NOD) može utjecati na ishod Helicobacter pylori pregled ( H Metode pregled TagSNPs NOD1 pregled i NOD2 pregled genotipizirane by Sequenom MASS niz u 132 GCS i 1.198 ispitanika s prekanceroznih oštećenja probavnog sustava, te su u korelaciji s evolucijom želuca lezije u 766 predmeta s follow-up podataka. pregled Rezultati pregled Među sedam tagSNPs, NOD1 pregled rs2709800 i NOD2 Zaključci pregled NOD1 pregled rs2709800, NOD2 pregled rs718226, rs2111235, rs7205423 i interakciju između rs718226 i H pregled. pylori pregled infekcija može biti povezana s rizikom od oštećenja probavnog pregled Izvor:. Li Z-X, Wang Y-M, Tang F-B, Zhang L, Zhang Y, Ma J-L, i sur. (2015) NOD1 pregled i NOD2 pregled genetske varijante u suradnji s rizikom od raka želuca i njegovih prethodnika u kineskoj populaciji. PLoS ONE 10 (5): e0124949. doi: 10,1371 /journal.pone.0124949 pregled Akademska Urednik: Yifeng Zhou, Medicinski fakultet Sveučilišta Soochow, Kina pregled Primljeno: 11. siječnja 2015. godine; Prihvaćeno: 19. ožujak 2015; Objavljeno: 1. svibnja 2015 pregled Copyright: © 2015 Li i sur. Ovo je otvoreno pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan pregled Podaci Dostupnost: sve relevantne podatke su u radu i njegove popratne podatke datoteka pregled Financiranje:. Ovaj rad je podržan od strane potpore iz Ministarstva znanosti i tehnologije, Kina [2010DFB30310], Nacionalni Basic Research programa Kine [973 programa 2010CB529303] i Nacionalni Prirodni Science Foundation of China [81171989] pregled u konkurenciji interese.. autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled Uvod pregled Gotovo milijun novih želučani karcinom (GCS) dogodila u svijetu, 42% ih je u Kini [1, 2]. Uporni Helicobacter pylori pregled ( H pregled. pylori pregled) Infekcija uzrokuje želučane kronične upale, što je rezultiralo u tranziciji od normalne sluznice kronični atrofični gastritis (CAG), nakon čega slijedi intestinalne metaplazije (IM) i displazija (DYS), a potom i povećava rizik od GC [3-5]. Naše dosadašnje interventne studije u Linqu županije, ruralnom području s visokom stopom smrtnosti od GC u provinciji Shandong u Kini [6], pokazala je da H nukleotida koji vežu oligomerizacije domenu (NOD) -kao receptore (NLRs) pripadaju evolucije-očuvan receptora raspoznavanje uzoraka (PRRS) obitelji locirati u citoplazmi. Potaknuti egzogenih patogena povezane molekularne obrazaca (PAMPs) ili endogenim oštećenjem povezane molekularne obrazaca (prigušuje) [13], NLRs mogu izazvati NF-kB i MAPK aktivacija signalnih putova i izražavanje imunološkog odgovora citokina i kemokina [14]. Aktivacija NLRs mogu voziti urođeni imuni odgovor, reguliraju imunološki odgovor, a također može sudjelovati u procesu karcinogeneze putem reguliranja apoptoza [15, 16]. Pregled Dva člana NLRs, naime NOD1 i NOD2, su izvijestili da je ključni regulatori kroničnog infiammation izazvanog H Netlogu. pylori pregled infekcija [17, 18] i da se odnose na klinički ishod H Netlogu. pylori pregled infekcija [18]. Iako je u jednom nukleotidu gena (SNP-ova) u NOD1 pregled i NOD2 pregled kao što rs2066842 (P268S), rs2066844 (R702W), rs2066845 (G908R) i rs2066847 (L1007insC) je utvrđeno da se povezana s rizikom od GC i prekanceroznih lezija bijele populacije [19-21], većina tih SNP bili monomorfni u kineskom populacijom. Dokazi o povezanosti između SNP-u NOD1 Netlogu i NOD2 pregled s rizikom od GC ili prekanceroznih lezija u kineskoj populaciji su ograničene. Iako Wang et al. korelirao osam tagSNPs NOD1 pregled i NOD2 pregled s rizikom od GC u case-control studija u bolnici na bazi [22], odnos genetskih varijanti u NOD1 Netlogu i NOD2 pregled, prekancerozne lezije želudca i njihov razvoj u procesu karcinogeneze želučanog još nejasna. Dakle, studije udruga genoma širom ili tagSNP studije koje pokrivaju SNP-ova u cijeloj kodiranja regiji NOD1 pregled i NOD2 pregled u kineskoj populaciji su potrebne, osobito u populaciji visokog rizika za GC . pregled Godine 1994. i 2002. godine, pokrenuli smo dva randomizirana, interventne studije inhibirati progresiju oštećenja probavnog sustava i GC u Linqu županije [7, 8]. Osnovni podaci, kao i praćenje podataka o populaciji iz placebo ruke i neobrađenih skupina tih dviju skupina iz dali nam jedinstvenu priliku da istražite povezanost između genetskih polimorfizama NOD1 pregled i NOD2 pregled i evolucija oštećenja probavnog sustava, a moguće interakcije s H Netlogu. pylori pregled infekcija. dizajn studija i stanovništvo pregled Dva neovisna randomizirana interventne studije u Linqu županiji pokrenuta su u 1994. godini (skupina I, upisana u SAD National Cancer Institute PDQ baza podataka sa suđenja broj NCI-OH-95-C-N029, dostupno na http://www.cancer.gov/clinicaltrials/) i 2002 (skupina II, registrirana kao HARECCTR0500053 u skladu s WHO ICTRP zahtjevi ), respektivno [7, 8]. Svi sudionici podvrgnuti endoskopskom probir i pod uvjetom uzoraka krvi na početku, i ponovio endoskopskog pregleda s istim postupkom na kraju suđenja. Detaljnije informacije o ispitivanoj populaciji, endoskopskim postupcima i kriterijima želučane patologije je prethodno opisano [7, 8]. Ukratko, za svaki predmet, biopsija se uzima od standardnih lokacija želucu i tireoidektomija otkrića su ocijenjeni od strane trojice visokih patologa iz Pekinškog Sveučilišne bolnice za rak samostalno, u skladu s Obnovljeno Sydney sustava [23] i Padovo Međunarodne klasifikacije [24]. Svaka biopsija se klasificiraju prema prisutnosti ili odsutnosti površne gastritis (SG), CAG (blaga ili teška), IM, neodređeni displazija (IndDYS), DYS ili GC. Svaki predmet je dodijeljen globalnu dijagnozu na temelju najtežom dijagnozom među bilo kojim od biopsije. Osnovni podaci o dobi, spolu, cigareta povijesti pušenja, itd za svakog sudionika dobiven je standardno strukturiranih upitnika. Pregled Za trenutnoj studiji, ispitanici s različitim prekanceroznih lezija želučane na početku uključujući SG, CAG, IM, IndDYS i DYS su izabrani nasumce iz svake patologije slojevima. Za standardizirati oba ispitivanja, ispitanici s prekanceroznih lezija i dalje su klasificirani u SG (311), CAG (306), IM (300), a DYS (303). Osim toga, ukupno 139 GCS bilo identificirani iz osnovnog pregleda ili tijekom perioda praćenja su upisani. Nakon genotipiziran u odabranim 1.359 ispitanika, 29 od njih su isključeni zbog niske koncentracije DNA, kasnije je ukupno 1.330 predmeta na kraju su analizirane u ovom istraživanju. Među njima, 766 subjekti završavaju follow-up u placebo rukama dvije kohorte su odabrani procijeniti povezanost genetičkih polimorfizama NOD1 pregled ili NOD2 pregled i evolucija H uzimanje uzoraka krvi i DNA priprema pregled 5 ml uzorka krvi prikupljeni iz svakog predmeta se ostavi da se zgruša tijekom 30 do 40 minuta na sobnoj temperaturi, a tada je centrifugirana na 965 g tijekom 15 minuta. Dobivena serum se odvoji u ampule. Ugrušak i serum su odmah zamrznuti na -20 ° C i uskladišten na -70 ° C ledenicu na. Velike molekularne mase genomska DNA je izolirana iz krvnog ugruška standardnim proteinaze-K digestije i fenol-kloroform ekstrakcijom iz uzorka krvi. Pregled Helicobacter pylori pregled određivanje pregled H pregled. pylori pregled status određuje imunoenzimski testom (ELISA) na početku liječenja i 13C-urea dah Test ( 13C UBT) nakon anti H Za ispitanika u skupinu II, H TagSNPs odabir i genotipizacija pregled TagSNPs za NOD1 pregled i NOD2 pregled, geni su odabrani iz designable setu zajedničkih SNP s manje frekvencije alela (MPŠ) više 0,05 genotipiziran u uzorcima iz HapMap Projekta stanovništva Han Kinezi (kroničnog hepatitisa B) (Hapmap Podaci rel 27 ispitivanje faze II + III, Feb09 na NCBI B36 sklopa, dbSNP B126). Primjena Haploview verziju softvera 4.2 (dostupan na: http://www.broadinstitute.org/scientific-community/science/programs/medical-and-population-genetics/haploview/) s parnom spojnici neravnoteže (LD) r 2 ≥ 0,80, 16 tagSNPs (7 tagSNPs za NOD1 pregled i 9 tagSNPs za NOD2 pregled) u početku su bili upisani u pilot istraživanju, koje pokriven cijeli gen i 5k bp proširenje 5'-bok i 3'-bok. za projektiranje i Hardy-Weinberg ravnoteže razloge, 2 tagSPNs (rs2709800 i rs2907749) hvatanje 28 od 47 (59,5%), SNP-ova NOD1 genotipovi su provedena od strane KPS Biotechnology Co., Ltd (Peking, Kina) od strane Sequenom MassARRAY sustava (Sequenom, San Diego, CA, USA). A ukupno 10 ng genomske DNA je izolirana iz limfocita periferne krvi svake ispitanici se koristi za genotipizacija. Duplicirani ispitivanja su provedena u 5% uzoraka dobivanjem stopu podudarnost 100%. genotipizacija početnica svih sedam SNP u su prikazani u tablici S2. pregled Statističke metode pregled Pearson je χ pregled 2 test primijenjen je za usporedbu distribuciju spol, pušenje status, H omjere (ORS ) i 95% intervali pouzdanosti (cIS) su izračunate bezuvjetne logističke regresije za procjenu rizika od oštećenja probavnog sustava ili evolucije povezanih sa SNP, kao i generiraju H Netlogu. pylori pregled zajedničkih učinaka prilagodbe za potencijalne Ëimbenike. Multiplikativni generiraju H pregled. pylori Rezultati Ukupno 1.330 ispitanika (727 muškaraca i 603 žena) sa srednjom starost 48.54 ± 8.69 godina na početku su bili upisani u ovoj studiji, uključujući 297 osoba s SG, 299 s CAG, 300 IM, 302 s DYS i 132 sa GC, respektivno. Od 766 ispitanika s follow-up podataka, 240 su progresija, 194 su regresija i 332 ostala bez promjene. Raspodjela dob, spol, pušenje i H Netlogu. pylori pregled stanja infekcije bile značajno različite u želučanom lezije grupa ( P pregled < 0,01). Srednja dob GC slučajeva je stariji od kontrole SG (53.83 ± 9.89 vs. 47.56 ± 8,32), a proporcije muških (76,52% vs. 58,25%), pušenje (62,12% prema 44,44%) i H pregled. pylori pregled infekcija (76,52% vs. 32,66%) bili su veći u GCS za razliku od SGS. Za dizajn skupine, samo H povezanost između sedam tagSNPs od NOD1 pregled (rs2709800 i rs2907749) i NOD2 pregled (rs718226, rs1077861, rs2111235 , rs3135500 i rs7205423) sa rizicima GC i njegovih prethodnika su ocijenjeni od strane bezuvjetno logističke regresije prilagodbe za dob, spol, pušenje, i H Netlogu. pylori pregled statusa infekcije. Uzimajući SG grupe kao referencu, rizici za prekanceroznih lezija i GC negativno su korelaciji s NOD1 pregled rs2709800 G alela, ali samo TG genotip u IM predmeta dosegla statističku značajnost (OR: 0,53; 95% CI: 0,31 - 0,92) , Za NOD2 pregled, rs718226 AG genotip (ILI: 2,50; 95% CI: 1,28-4,88) ili u kombinaciji AG + GG genotipa bio povezan s rizikom od GC (OR: 2,35; 95% CI: 1,24-4,46) , G alela od rs718226 također bio povezan s rizikom od prekanceroznih lezija želuca, međutim, statistička značajnost je promatrana samo u DYS grupi. Subjekti koji nose AG genotip doživjela 2,79 puta veći rizik od DYS (OR: 2,79; 95% CI: 1,71-4,55), a za subjekte s GG genotipom ili G alela prijevoznika, rizik od DYS bio 3,33 (ILI: 4,33; 95 % CI: 1,38 - 13,60) ili 1,96 (iLI: 2,96; 95% CI: 1,86-4,17) puta veća od kontrole respektivno. (Tablica 2) pregled Mi i dalje ocjenjuju potencijalne zajedničke učinke ili interakcije između NOD1 pregled rs2709800 ili NOD2 relativna. rizik od progresije ili regresije sa sedam tagSNPs samostalno u odnosu bez progresije (bez promjene i regresije) ili bez regresije su otkrivene (bez promjene i napretka) ispitanika. Kao što je prikazano u tablici 4, prilagodbe za dob, spol, pušenje, H pregled. pylori pregled stanja i osnovna patologija, NOD2 Rizici napredovanja u vezi s dva SNP dodatno su ispitani Stratifikacija po osnovnim patologije ili H Netlogu. pylori pregled statusa infekcije. Budući da je nekoliko Ispitanici su bili SG (N = 55) u ovoj skupini studije, a samo 6 od 144 DYS subjekti s vremenom napredovao, istražili smo korelaciju između tagSNPs i rizika progresije u CAG i IM slojevima. U CAG skupini, u usporedbi s NOD2 pregled rs2111235 TT genotip, rizik od progresije bio je oko pola smanjena u ispitanika s TC genotipa (ILI: 0,51; 95% CI: 0,30-0,89) ili C alela (ILI: 0,58 95% CI: 0,35 do 0,90). Rizik od progresije je upućena samo u H Netlogu. pylori pregled pozitivno skupina. U H Netlogu. pylori pregled pozitivnih ispitanika, NOD2 pregled rs2111235 C alela (TC + CC) i NOD2 pregled rs7205423 G alela (CG + GG) bili su povezani sa smanjenim rizikom od progresije, su ORS su 0,52 (95% CI: 0,32-0,83) za rs2111235 i 0,56 (95% CI: ,35-,89). za rs7205423, odnosno (tablica 5) pregled Rasprava pregled U ovom stanovništvo na bazi studije, istražili smo povezanost između panela sedam tagSNPs u NOD1 Netlogu i NOD2 pregled gene s rizicima GC i prekancerozne lezije želuca, kao i njihove evolucije. Prema našem najboljem saznanju, ovo je prva studija istražuje utjecaj genetskih polimorfizama NLR gena na rizik od oštećenja probavnog sustava i evolucijom želučanih lezija u kineskoj populaciji na visokim rizikom od GC. Pregled NOD1 i NOD2 izrazio u epitelnim i antigen-prisutnih stanica prepoznavanje peptidoglikanski-izvedeni peptidi posebno [29, 30], može biti presudna u H Netlogu. pylori pregled povezane procese upale i karcinogeneze [15, 18, 31-33]. Preko izražavanja NOD1 i NOD2 nađeni su u ljudskim staničnim linijama izazvan s H Netlogu. pylori U ovoj studiji, introna varijanta rs2709800 NOD1 pregled je pokazao kako se umjereno povezana s rizikom od oštećenja probavnog sustava. Ispitanici s TG genotipa bila na niskom riziku od IM odnosu na TT genotip. Iako nema funkcionalne studije na ovom polimorfizma su prijavili prije, to je predvidio da je G alela varijanta može biti povezano s gluposti posredovane mRNA propadanja (NMD) koji može uzrokovati nisku ekspresiju NOD1. Stoga, G alela nosači mogu biti češće na niskom statusu NOD1 izražavanja nakon zaraženo H Netlogu. pylori pregled, što može dovesti do niske aktivacije posredovanog upale NF-kB u želučanom sluznicom, a time se može odnositi na nižim rizikom od oštećenja probavnog sustava od alela T nosača. Međutim, udruge zahtijeva da se validirati u funkcionalnim ispitivanjima. A nonsynonymous varijanta pod nazivom rs2075820 (E266K) u NOD1 pregled gena je prvotno otkriven u našem pilot studije. Međutim, kako se više ne primjećuje statistička značajnost, to je bio isključen za daljnja istraživanja u ovom radu. Pregled Iako je nekoliko funkcionalnih varijante u NOD2 pregled, kao što rs2066842 (P268S), rs2066844 (R702W), rs2066845 (G908R) i rs2066847 (L1007insC) ispitivani su u bijele populacije [19-21], ovi SNP su prijavili monomorfni u japanskom stanovništva u HapMap bazi podataka. U našoj studiji, koja se primjenjuje smo tagSNP strategiju koja pokriva cijeli slijed NOD2 Netlogu i našao rs718226 AG ili GG genotip povezan s povećanim rizikom od GC ili DYS. Rs718226 nalazi u 3 'u neposrednoj blizini regije NOD2 pregled, vjerojatno sudjelovao u regulaciji nakon transkripcije. Daljnje istraživanje treba provesti da bi se otkrilo funkcionalnu važnost. Pregled S obzirom na potencijalno funkcionalni značaj među NOD1 Netlogu ili NOD2 Netlogu i H Netlogu. pylori pregled infekcija [29], bili smo također zainteresirani za mogućoj interakciji i zajedničkom učinku između NOD1 Netlogu ili NOD2 pregled polimorfizma i H Netlogu. pylori pregled infekcija. Uočili smo značajne zajedničke učinke H Netlogu. pylori pregled infekcija i NOD1 Crijevna tip GC Vjeruje se kao krajnji rezultat višestupanjske tranzicije želučane sluznice tijekom godina pod kronične upale stresa i CAG je relativno česta H pregled. pylori pregled -associated upalnih stanja, a može biti važno u želučanoj karcinogeneze [38]. U ovom istraživanju, NOD2 pregled rs2111235 TC genotipa pronađen smanjuje rizik od progresije u CAG subjekata i H pregled. pylori pregled zaraženih predmeta. Rs2111235 je introna varijanta i C alel predvidio povezana s NMD, što bi moglo smanjiti ekspresiju NOD2 pregled i lučenje proupalnih citokina putem NF-kB puta nakon H Netlogu. pylori pregled infekcija. Dakle, CAG ispitanika s rs2111235 C alela može imati manju jačinu upale nakon H Netlogu. pylori pregled infekcije i manji rizik od progresije. Pregled SNP u NOD2 pregled rs7205423 nalazi se u medugenskim području između NOD2 Netlogu i CYLD pregled gen, de-ubiquitinating enzima inhibirati aktivaciju NF-kB [39, 40]. Naša studija je primijetio da NOD2 pregled rs7205423 G alela negativno korelira s rizikom od progresije u H Netlogu. pylori pregled om, što je u skladu s drugom istraživanje koje je uspoređivalo GC slučajeve s kontrolama u kineskoj populaciji [22]. G alela od rs7205423 može biti na Mjesto spoja [22], potrebne su međutim i dalje funkcionalna studija. Dva SNP-a pod nazivom rs2907749 i rs3135500 su također utvrđeno da je povezan s rizikom od GC ranije [22], ali ova dva SNP nije steći statističku razliku između GCS i kontrola u ovom istraživanju. Istraživanjem su odabrani od kohortnog istraživanja u području s visokim rizikom od GC može doprinijeti razlici. Osim toga, razlike u patogenezi difuznih i crijevnih vrste GC može biti i moguće objašnjenje na nedosljednosti. Povezanost između rs2907749 i rizik od GC je upućena samo u slučajevima raspršenih tipa u Wang studiji [22] dok je većina GC slučajeva pronađena su crijevnu tip u našim ranijim studijama u Linqu županije [41]. Prema tome, potrebno je još jedna provjera valjanosti studija pokriva više GC slučajeve. Pregled Iskorištavanje dugoročnog praćenja skupine, sustavno analizirao SNP u NOD1 pregled i NOD2 pregled povezan s rizikom GC. Ova populacija se temelji dizajn studija nam je omogućilo da istraži SNP-ova u spektru prekanceroznih lezija želuca te istražiti odnos između SNP-ova i razvoj želučanih lezija u procesu razvoja GC. Međutim, naše istraživanje ima neka ograničenja. Budući da je bilo vrlo malo ispitanika s normalnom želučane sluznice u populaciji, samo smo odabrali predmete sa SG kao kontrola koji može uzrokovati podcijenjena povezanost SNP i rizik od oštećenja probavnog sustava. Osim toga, ograničava na 132 GC slučajeva otkrivenih iz naših prethodnih skupinama u području s visokim rizikom od GC povećao homogenost ispitivane populacije. Međutim, relativna mali uzorak, GC u ovoj studiji naziva za neovisnu case-control studija, uključujući više odgovarajuće kontrolne skupine, kao i više GC slučajevima. Isto tako, ispitanici s follow-up podataka u ovom istraživanju samo su odabrani od placebo ruku, bez intervencije, što je ona nedostupna analizirati potencijalne interakcije između tretmana, kao što su češnjak nosa i SNP-ova na progresiju oštećenja probavnog sustava. Štoviše, kao što smo uzeli označavanje SNP-ova strategija, funkcionalni značaj novo identificiranih polimorfizama uključujući NOD2 pregled rs718226, rs2111235 i rs7205423 na H Netlogu. pylori pregled -associated želuca karcinogeneze je ograničeno i treba dodatno pojasniti. Pregled Ukratko, u ovom istraživanju populacije na bazi smo našli NOD1 pregled rs2709800 i NOD2 popratne podatke
. pylori pregled) infekcije i želuca karcinogeneze. Kako bi istražili genetske varijante NOD1
i NOD2 pregled u suradnji s rakom želuca (GC) i njegovih prethodnika, radna populacija bazi je provedeno u Linqu županije, Kina. Pregled
rs718226 su bili povezani s želučane lezije. NOD1 pregled rs2709800 TG genotip prijevoznici imali smanjen rizik od crijevnih metaplazije (IM, ILI: 0,53; 95% CI: 0,31 do 0,92), dok je NOD2 pregled rs718226 G alela (AG /GG) pokazala je povećani rizik od displazije (DYS ILI: 2,96; 95% CI: 1,86-4,71) i GC (ILI: 2,35; 95% CI: 1,24-4,46). Štoviše, interakcija aditiv između rs718226 i H Netlogu. pylori pregled pronađen je u DYS ili GC s indeksom sinergijom 3,08 (95% CI: 1.38-6.87) ili 3,99 (95% CI: 1.55-10.22), respektivno. Podaci praćenja naznačeno da NOD2 pregled rs2111235 C alela (ILI: 0,52; 95% CI: 0,32-0,83) i rs7205423 G alela (ILI: 0,56; 95% CI: 0,35-0,89) bili su povezani s Smanjenje rizika od progresije u H Netlogu. pylori pregled -infected subjekti. Pregled
. pylori pregled iskorjenjivanje može značajno smanjiti rizik od GC i njegovih prethodnika [7-9]. Unatoč visokoj prevalenciji H Netlogu. pylori pregled infekcije, samo mali postotak zaraženih predmeta na kraju razviti GC [10], što upućuje da domaćin genetskih polimorfizama, osobito u genima povezanih s upalama može igrati ključnu ulogu u želučanoj karcinogeneze [11, 12]. Pregled
Metode
. pylori pregled -associated oštećenja probavnog sustava (slika 1). Istraživanje je odobreno od strane Institutional Review Board of Peking University Cancer Hospital i svi subjekti dala pismeni informirani pristanak. Pregled
, pylori pregled tretman za skupinu I i cijele skupine II. Detalji o H Netlogu. pylori pregled test antitijela su prethodno opisano [25]. Ukratko, serum anti H pregled. pylori pregled IgG i IgA u serumu je mjerena odvojeno u dva primjerka s ELISA postupkom. kontrolnih uzoraka bio je analiziran na Vanderbilt University, Nashville, TN. Pojedinac se smatra pozitivnim za H Netlogu. pylori pregled infekcije ako srednja optička gustoća bilo za IgG ili IgA i 1,0, cut-off vrijednosti na temelju H Netlogu. pylori pregled negativne osobe i referentnih seruma. Pregled
. pylori pregled status je određen 13C-UBT na početku 2002. godine Detalji 13C-UBT su opisani u prethodnim publikacijama [26]. Ukratko, nakon početnih uzoraka izdahnutog CO 2 zbirka, sudionik je potom zatražio da pije 20 ml vode uz tabletu od 80 mg 13C-uree (min. 99% atoma 13C). Izdahnutog CO 2 se prikupi u epruvete za uzorkovanje 30 min. 13CO 2 vrijednosti određene su pomoću masenog spektrometra omjera plin izotopni, i bilo koncentracije 13CO 2 na 30 minuta da premašila bazične koncentracije više od četiri dijela na 1000 (> 0.4 %) bio je smatran pozitivnim rezultatom. pregled
i 5 tagSNPs (rs718226, rs1077861, rs2111235, rs3135500 i rs7205423) hvatanje 18 od 24 (75,0%) SNP-u NOD2 pregled su upisani u konačnoj analizi (S1 tablici).
. pylori pregled infekcije među različitim oštećenja probavnog sustava ili evolucija grupe, dok je Kruskal-Wallis ili Wilcoxon test je korišten za testiranje dobnih razlika. Hardy-Weinberg ravnoteže u raspodjeli genotipova testirana je dobrote-of-fit χ pregled 2 test u referentnoj skupini (SG subjekata). Evolucija status želučanih lezija za svaki predmet je svrstana u progresiji grupe, bez promjena grupe ili regresije skupine kao što je opisano ranije u skladu sa svojim globalnim histopatološke dijagnoze promjena tijekom referentnog i krajnje točke [27].
interakcije mjerene su uključujući i glavni efekt varijable i njihove uvjete proizvoda u modelu logističke regresije s omjerom vjerojatnosti testovima. I aditiv generiraju H pregled. pylori
interakcije su ocijenjeni od strane približnom varijance procjene s indeksom sinergije i 95% CI [28]. Vrijednost P izvoznici < 0,05 smatrana je statistički značajna. Sve statističke analize provedene su pomoću softvera Statistička analiza sustava (verzija 9.2; SAS Institute, Cary, NC). Pregled
. pylori pregled statusa infekcije su pokazali statističku razliku između evolucije skupina. Detaljne informacije o temama je naveden u tablici 1. pregled
rs718226 i H Netlogu. pylori pregled infekcije na rizik od oštećenja probavnog sustava (Tablica 3). Budući da je pronađen NOD1 pregled rs2709800 G alela povezana sa smanjenim rizicima želučanih lezija, uzeli smo H
. pylori pregled negativne SG subjekti koji nose TG ili GG genotipa kao referencu. Rizici želuca lezije su značajno povišene u bolesnika s TT genotipa i H Netlogu. pylori pregled infekcije, ORS su 2,71 (95% CI: 1,27-5,78) za CAG, 11.06 (95% CI: 5,31 - 23,06) za IM, 8,16 (95% CI: 3,92 - 16,96) za DYS i dosegao 11,38 (95% CI: 4.04-32.06) za GC, respektivno. Isto tako, u usporedbi s NOD2 pregled rs718226 AA genotipa i H Netlogu. pylori pregled negativne predmeti, H pregled. pylori pregled zaraženo G alela nositelji doživjela više od 20 nabora veće rizike za DYS (OR: 25.23; 95% CI: 11.37-55.59) i GC (ILI: 29.66; 95% CI: 11.18-78.69). Interakcija aditiva između NOD2 pregled rs718226 G alela i H Netlogu. pylori pregled infekcija utvrđena je za DYS ili GC, s indeksom sinergije od 3,08 (95% CI: 1,38-6,87) ili 3,99 (95% CI: 1,55 - 10,22), odnosno pregled
rs2111235 i rs7205423 bili povezani s rizikom od progresije. Subjekti koji nose rs2111235 TC genotipa (ili: 0,64; 95% CI: 0,44 - 0,92) ili C alela (ILI: 0,71; 95% CI: 0,50 do 0,99), i objekata s rs7205423 CG genotipa (OR: 0,69; 95% CI: 0,48-0,98) pao je rizik od progresije. Međutim, utvrđeno je povezanost između tih tagSNPs s regresijom. Pregled
CAG PAI-pozitivni sojevi [34, 35]. Aktivacija NOD1 bi moglo biti bitno za induciranje obje NF-kB i AP-1 aktivacije tijekom H Netlogu. pylori pregled infekcija uključuje u izgon NF-kB i AP-1 kompleksa u jezgru [18], dok NOD2 je potreban za izazivanje upale citokina pro-IL-1 u H Netlogu. pylori-
zaražene stanice [36]. Dakle, polimorfizmi u ova dva gena može utjecati na posljedice H Netlogu. pylori pregled inducirana kronična upala i dalje se odnose na rizike od oštećenja probavnog sustava. Pregled
rs2709800 ili NOD2 pregled rs718226 o riziku od oštećenja probavnog sustava i interakcije aditiva između NOD2
rs718226 i H pregled. pylori pregled infekcija. Iako precizan mehanizam na H Netlogu. pylori pregled -associated karcinogeneze je nejasno, to može biti razumno da ti polimorfizmi mogli utjecati nakon regulaciji transkripcije NOD2, prepoznavanje ligand ili aktivaciju imunog odgovora [29, 37]. Zbog toga pojačano lučenje proupalnih citokina, zbog upornog H Netlogu. pylori pregled infekcije, pojačava kronične upale i na kraju doprinijela razvoju GC. Pregled
rs718226 bili su povezani s rizikom prekanceroznih želučane lezija ili GC. Osim toga, značajna interakcija aditiv između NOD2
rs718226 i H Netlogu. pylori pregled infekcija, što upućuje da je genetski i okolišni čimbenici doprinose nastanku GC zajedno. Naše istraživanje je također pokazalo dva SNP u NOD2 pregled (rs2111235 i rs7205423) su u korelaciji s progresijom rizik od oštećenja probavnog sustava, osobito u H Netlogu. pylori pregled zaražene populacije, što znači ovih SNP-ova može poslužiti kao potencijalni markeri rizika u praksi prevencije GC. Daljnja istraživanja u većoj veličini uzorka zajedno s funkcionalnim ispitivanjima imaju jamstvo za potvrdu ovih nalaza. Pregled
S1 tablicu. Tag i zarobljene SNP u NOD1 i NOD2 gena pregled doi:. 10,1371 /journal.pone.0124949.s001 pregled (docx) pregled S2 stol. Genotipizacija primeri za SNP u NOD1 i NOD2 gena pregled doi:. 10,1371 /journal.pone.0124949.s002 pregled (docx) pregled
Istraživanja se bave aerobiomima,
Zapadnjačka prehrana može povećati rizik od "smrtonosne sepse",
Gubitak mikrobioma korištenjem antibiotika utječe na odgovor na cjepivo protiv gripe
Krvni test za mikrobnu DNK mogao bi upozoriti na rak
Prisutnost određene crijevne bakterije u majki mogla bi zaštititi bebe od alergija na hranu
Kako čimbenici domaćini poput plućnog mikrobioma pomažu u infekciji SARS -CoV -2?
Funkcija jetre može biti važna u riziku od Alzheimerove bolesti
Nova studija pokazuje snažnu vezu između promijenjene funkcije jetre i razvoja Alzheimerove bolesti (AD). To je u korelaciji s nedavnim podacima o ulozi bolesti koje utječu na sistemski metabolizam, p
Inhibitori GSK-3 obećavaju u liječenju infekcija koronavirusom
Istraživači u Sjedinjenim Državama predložili su novi pristup liječenju infekcije koronavirusom, poput teškog akutnog respiratornog sindroma koronavirusa 2 (SARS-CoV-2)-agensa koji uzrokuje koronaviru
Istraživači se nadaju da bi krvni test koji točno dijagnosticira fibromialgiju mogao biti dostupan u roku od pet godina
Istraživači Sveučilišta Ohio State imaju dokaze da uzorci krvi mogu pouzdano otkriti fibromijalgiju, bolest koja se često pogrešno dijagnosticira zbog svojih općih simptoma koji karakteriziraju niz dr