Sažetak pregled
Helicobacter pylori pregled ( H pregled pylori Izvor. Zhou J, Wang W, Y Xie, Zhao Y, Chen X, Xu W, et al. (2016) Proteomika-Based Identifikacija i analiza proteine povezane s Helicobacter pylori pregled u rak želuca. PLoS ONE 11 (1): e0146521. doi: 10,1371 /journal.pone.0146521 pregled Urednik: Hiromu Suzuki, Sapporo Medicinski fakultet, JAPAN pregled Primljeno: 15. rujna 2015. godine; Prihvaćeno: 19. prosinca 2015. godine; Objavljeno: 8 siječanj 2016 pregled Copyright: © 2016 Zhou i sur. Ovo je otvoreno pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan pregled dostupnost podataka. Sve relevantne podaci u radu pregled Financiranje:. rad je podržan od strane Nacionalne zaklade prirodoslovni Kine (81260303, 31560326), pokrajini Guizhou temelja (QianJiaoHe [2014] 06) i Projekt ključ znanosti i tehnologije Guizhou Provincija (QianKeHe SY [2011] 3067, QianKeHe J [2012] 2039). U izvornoj verziji, rad je podržan od strane Nacionalne zaklade prirodoslovni Kine (81260303, 31560326) i ključni projekt znanosti i tehnologije provinciji Guizhou (QianKeHe SY (2011) 3067) suprotstavljenih interesa. autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi. pregled Uvod pregled Helicobacter pylori pregled ( H pregled. pylori pregled) uzrokuje najviše učestala kronična infekcija želuca kod ljudi širom svijeta. Otprilike polovica svjetske populacije zaraženo H Netlogu. pylori pregled, a većina koloniziranih osoba razvije asimptomatska gastritis. Među zaraženih osoba, oko 10% -20% osoba razvije peptički bolesti čirom i 1% -3% razvije rak želuca [1,2]. Godine 1994. H pregled. pylori pregled je klasificiran kao tip I kancerogen za rak želuca od strane Svjetske zdravstvene organizacije Međunarodne agencije za istraživanje raka. Pregled Rak želuca je jedna od najčešćih vrsta raka, a više od 70% novih slučajeva i smrtnih slučajeva javlja se u zemljama u razvoju. [3] Iako je globalna stopa incidencije je u padu već nekoliko desetljeća, raka želuca i dalje prevladava u većini zemalja u razvoju, uključujući Japan, Koreja i Kina [4-6]. U 2012. godini, kineski registar za rak, Godišnje izvješće pokazuje da rak želuca morbiditet i mortalitet su drugo i treće mjesto među svim zloćudnim tumorima, respektivno. Pregled Većina H Netlogu. pylori pregled sojevi nose CAG Proteomika je nastao kao obećavajući tehnološke platforme za racionalno utvrđivanje biomarkera i novih terapijskih ciljeva za bolesti i određivanje temeljnih mehanizama karcinogeneze [10]. Međutim, većina od važnih proteina otkrivenih proteomike in vitro nisu potvrditi in vivo u kliničkim uzorcima. Pregled DNA metiliranje i demetilacija igra važnu ulogu u razvoju i napredovanju raka blokiranjem vezanja transkripcijskih faktora DNA i javlja se skoro isključivo u promoter gen CpG otocima [11-13]. Među organe, želudac pokazuje najveću učestalost abnormalnog otoku CpG metilacije, možda i H U ovom radu željeli smo utvrditi određene proteine koji se odnose na H Netlogu. pylori pregled infekcije koristeći komparativne proteomika i karakterizirati ekspresiju gena i CpG otok metilacije tih proteina u želučanog tkiva raka i stanica. Pregled Materijali i metode ljudskim tkivima pregled ljudska tkiva dobiveni su iz kirurgije uzoraka iz 30 pacijenata s rakom želuca i uskladiti susjedna tkiva raka i metastatskih limfnih čvorova na Medicinskom bolnici Guiyang, Guiyang Kini, u razdoblju od siječnja 2009. do lipnja 2010. dijagnoze su potvrđene od strane dva patologa. Među pacijentima, 23 su bili muškarci, a sedam su žene. Pacijenti su u dobi od 38 do 77 godina. Dvadeset i dva bolesnika imalo intestinalni tipa adenokarcinom i 8 imale difuzno tipa adenokarcinom. Protokol istraživanja je odobren od strane Etičkog povjerenstva o Guiyang Medicinskog bolnice, te su svi sudionici pod uvjetom pismeni informirani pristanak. Pregled Kultura stanica pregled stanične linije ljudskog karcinoma želuca AGS (ATCC CRL-1739TM) i SGC-7901 stanice su kupljeni izravno od American Type Culture Collection (ATCC) i stanične banke Type Culture Collection kineske akademije znanosti (Shanghai, Kina), odnosno, i pasaža manje od 3 mjeseca u našem laboratoriju nakon primitka. Stanice su kultivirane u Roswell Memorial Institute Park (RPMI) 1640 mediju uz 10% fetalnog goveđeg seruma inaktiviranog toplinom, 100 U /ml penicilina i 100 ug /ml streptomicina (Gibco, Grand Island, NY, USA) na 37 ° C u vlažnom inkubatoru s 5% CO 2. pregled H pregled. pylori pregled kultura pregled H pregled. pylori pregled soj NCTC11637 (ATCC 43504, dar iz kineskog Centra za Helicobacter pylori pregled soj upravljanje i čuvanje, Peking, Kina), što je CagA pregled pozitivna, je uzgojene u selektivnom mediju na Columbia agar ploče koje sadrže 10% fetalnog telećeg seruma i H Cell infekcija s H Netlogu. pylori AGS i SGC-7901 stanice (5 × 10 5) nasađene u 6 jažica 24 sata, a zaraženi H Netlogu. pylori pregled 6 sati i 12 sati na jedan mnogostrukosti infekcije (mjeseci) od 1: 100, 1: 500 i 1: 1000, respektivno. Stanice su zaražene 12 sati na moi od 1: 1000 s H Netlogu. pylori pregled kuha se 15 minuta kao kontrole. Pregled Izgradnja vektor ekspresije pcDNA3.1 / CagA DNK izolirana je iz H pregled. pylori pregled, a full-length CagA pregled slijed sintetizira pomoću PCR i klonira u pMD18-T plazmida za izgradnju pMD18-T / CagA stanica s pcDNA3.1 / CAGA SGC-7901 stanice su inkubirane 12 h u 6 jažica ploče se dobije 80% konfluentne stanice. Stanice su zatim transficirane u skladu s uputama proizvođača. Nakon 48 sati, stanice su podijeljeni u omjeru 1:10 u nove 6-jažične ploče i inkubirano je još 24 sata, zatim održava u selektivnom sadržavao zeocin (250 ug /ml), standardnom mediju za 2 tjedna do formiranja klona. Stanice transfektirane s praznim vektorom pCDNA3.1 /Zeo - Kao kontrole korišteni su pregled ekstrakciju proteina i western blot pregled Proteinski ekstrakt se dobije suspendiranjem staničnih peleta u RIPA puferom i homogeniziranje 200 (). mg tkiva u RIPA puferom. Ukupno 30-50 ug proteinskog ekstrakta je podvrgnut SDS-PAGE gel elektroforeze, prenese u polivinilidenfluorid (PVDF) membranu (Millipore, Billerica, MA, USA) i mrlja preko noći s mišjim monoklonskim anti-CagA antitijelo (1: 800, sC-28.368), mišje monoklonsko anti-fosfotirozin protutijela (PY99, 1: 300, sC-7020), zečje poliklonalno anti-beta aktin antitijelo (1: 500, ab189073) zečjeg poliklonskog anti-LDH antitijela (1: 350 , ab125683) mišjeg monoklonskog anti-DLD (1: 800, sC-376,89 tisuće) zečjeg poliklonskog anti-PRPF19 (1: 400, ab27692) mišjeg monoklonskog anti-ATP antitijela (1: 300, ab54880) zečjeg poliklonskog anti -calmodulin anbody (1: 250, ab208911) zečjeg poliklonalnog anti-RanGAP protutijelom (1: 200, ab92360) zečjeg poliklonalnog anti-p64CLCP protutijelom (1: 300, ab28722) zečjim poliklonskim anti-kalretikulin protutijelom (1: 350, AB4) i mišje monoklonsko anti-gliceraldehid-3-fosfat -dehydrogenase antitijela (GAPDH, 1: 8000) iz Santa Cruz (CA, USA), Abcam (Cambridge, UK) i CangChen (Shanghai, Kina), odnosno, u 5% BSA u Tris-pufer u fiziološkoj otopini i 0,01% Tween-20. Peroksidaze-konjugiranih sekundarnih antitijela (1: 5000, SC-2371, Santa Cruz, CA, USA) su korišteni i razvijene s ECL Plus reagensa kemiluminiscencija koristeći Hyperfilm (Amersham Biosciences, Buckinghamshire, UK). Kvantifikacija Western blot analize provedena je pomoću Količina jednom softvera. Svaki eksperiment izveden 3 puta, a prikazan je reprezentativni rezultati. Pregled ekstrakcije proteina i dvodimenzionalni gel elektroforeza pregled Stanična zrnca su otopljena u puferu za lizu stanica preko noći na 4 ° C, a protein se istaloži s tri volumena ledenog acetona inkubacijom na 4 ° C tijekom 2 sata. Uzorci su zatim centrifugirani na 20,000 rpm kroz 30 minuta, a talog se resuspendira u puferu za lizu stanica i pohranjeni na 4 ° C preko noći. Pregled ukupno 800 ug proteina je podešena na volumen od 250 uL s rehidracije otopine, izoelektrično fokusiranje (IEF) se izvodi pomoću sustava fokusiranje Ettan IPGphor II izoelektričnim (Amersham Biosciences) u skladu s uputama proizvođača. Protokol za IEF bila 300 V for1 h, 500 V tijekom 2,5 h, 1.000 V tijekom 2 sata; 8.000 V 8 h, 60 KVH (ukupni), pregled Nakon završetka IEF, na IPG trake (Amersham Biosciences) se uravnoteži u puferu za ujednačavanje 15 minuta i stavi se na 12% SDS-PAGE gelu za dvostrukom dimenzionalni elektroforeza na 30 mA /gela. Dobiveni SDS-PAGE gel je fiksiran u 20% TCA tokom 30 minuta i zatim oboje s Coomassie koloidni G-250 [5]. Pregled Proteinske mjesta na gelu su skenirani i analizirani automatski. Različito izražena proteinske mrlje su potvrđeni s Imaging Master 2D 5.0 analitičkog softvera (Amersham Biosciences). Studentov t-test je proveden za kvantitativnu analizu 2D gelova. Diferencijalne ekspresije određenog proteina definiran kao ≥2 puta promjene licu optičke gustoće između dvije jednake postavlja u duplikatima. Diferencijalne Mrlje su potom izrezani iz SDS-PAGE gelovima za daljnje identifikacije LC-MS /MS. Pregled ekstrakcija RNA i kvantitativna RT-PCR pregled Ukupna RNA ekstrahirana je iz 50 mg tkiva i pomiješa s DNase i (posudu bez RNaze). Geni su amplificirani kod SYBR Green (Applied Biosystems, Australija). Hipoksantin-gvanin fosforibosiltransferaza ( HPRT pregled) je korišten kao kontrola normalizacije i relativne razine mRNA su izračunate komparativnom C T metoda pomoću korak-jedan softver (Applied Biosystems, Australija) [8]. Svaki uzorak je analiziran u triplikatu, a rezultati su izraženi kao srednja vrijednost ± SD. Primeri korišteni su prikazani u Tablici 1. pregled ekstrakcija DNA i analiza metiliranje CpG otoka DNA je izolirana iz stanica i promjene s natrijevim bisulfitom korištenjem EZ metilacije DNA-zlato Kit ™ (Zymo Research, CA, USA) prema uputama proizvođača. Promotorski CpG otoci se predvidjeti pomoću metil Primer Express softvera i pojačan od bisulfita modificirani DNA pomoću PCR korištenjem sljedeće postupke: denaturiranje na 96 ° C tijekom 10 minuta, nakon čega slijedi 40 ciklusa denaturacije na 94 ° C tijekom 40 sekundi, sljepljivanje pri 60 ° C ° C tijekom 40 sekundi, i istezanja pri 72 ° C tijekom 40 sekundi, uz konačno proširenje pri 72 ° C tijekom 10 minuta. Amplificirani PCR produkti su klonirani u pMD19-T vektora i sekvencionirani. Osim toga, DNA je izolirana iz tumorskog tkiva se koriste za otkrivanje H Statistička analiza pregled Rezultati su izraženi kao prosjek ± SD. Statističke analize su provedene korištenjem SPSS 15,0 softvera. Jednosmjerna analiza varijance (ANOVA) i t-test se koristi za analizu podataka. P pregled. ≪ 0,05 (dvostrani) smatra se značajnim pregled Rezultati Uvođenje CagA u želučanih stanica raka pregled Zbog CagA H pregled. pylori pregled je kritični čimbenik virulencije u razvoju i progresiji karcinoma želuca, CagA je otkriven u želučanim staničnim linijama karcinoma pomoću RT-PCR i Western blot nakon infekcije SGC-7901 i AGS stanica s H pregled. pylori pregled i transfekcija SGC-7901 stanica s CagA Identifikacija diferencijalnih proteina u želučanih stanica raka pregled Nakon što su stanice inficirane s H pregled. pylori pregled 6h na moi od 1: 1000 ili transfecirane CagA pregled -vector, proteomic tehnika je korištena za stvaranje šest dvodimenzionalne elektroforeze (2-DE) karata od tri otkrivene su stanične linije i njihove kontrole (Slika 2), te 135 diferencijalne mjesta, od kojih su 73 bili regulira prema gore i 62 dolje su regulirana. vidio zajedničko Deset diferencijal za sva tri stanične linije su identificirane prema LC-MS /MS i ovjeren od strane western blot, uključujući i 6 up-regulirana proteina: P-aktin, LDH, DLD, PRPF19, ATP i kalmodulin (CAM), i 4 dolje regulirane proteine kao što su RanGAP, p64 CLCP, P43 i kalretikulin (tablica 3 i 3A). pregled H pregled. pylori pregled infekcija potiče ekspresiju diferencijalnih proteina u želučanog tkiva raka pregled Budući da H H pregled. pylori pregled kolonizacija u želučanim tkiva raka mjerena je otkrivanje 16S rRNA pregled gena i CagA pregled gen H Netlogu. pylori pregled pomoću PCR. H pregled. pylori pregled je bio prisutan u 20 od 30 uzoraka (pozitivna stopa 67%), a sve u H Netlogu. pylori H pregled. pylori pregled uzrokuje neprirodni DNA metilacije na želučane stanice raka U tri stanične linije, PCR produkti CpG otoka navedenih gena uspješno su stekli slijedeće bisulfita liječenje i sekvencirani. U tim genima, LDH pregled, DLD pregled i CAM pregled, geni su memetilirani na promotora -2325, -1885 i -276 mjesta, odnosno, i RanGAP pregled gena je vrlo metilirani na promotora -570 i -170 stranice (Slika 4). pregled Rasprava pregled kumulativnih dokaza ukazuje na to da H Proteomika se koristi za proučavanje odnosa između H Netlogu. pylori pregled infekcija i želučanih bolesti, a mnogi različito izražena proteini su identificirani [19-22]. Međutim, povezanost tih proteina s CagA i njihove ekspresije u ljudskim tkivima s rakom želuca ostaju nejasni. Dobili smo ukupno 135 diferencijalnih mrlje od tri stanične linije, od kojih su 73 bili regulira prema gore i 62 su dolje propisanih. Deset diferencijalnih mrlje su zajednički za sve tri stanične linije, uključujući i 6 up-regulirana proteina (P-aktin, LDH, DLD, PRP19, ATP sintaze i CAM) i 4 dolje regulirane proteini (p64 CLCP, RanGAP, P43 i kalretikulin) , izražavanja i 10 proteini "potvrđene su western blot u tim staničnim linijama. Ovi proteini su uključeni u metabolizam energije, kostur pregrađivanjem, obradu pre-mRNA, provođenju signala, te drugi proteini blisko povezana s razvojem i napredovanjem mnogih humanih karcinoma [23,24]. Mi kvantitativno otkriti ekspresiju gena koji kodiraju ove 10 proteina u ljudskim tkivima raka želuca, koji je otkrio da β-aktin pregled, LDH pregled, DLD pregled, PRP19 pregled i CaM pregled dosljedno su vrlo izražen i RanGAP pregled slabo je izražen u oba tkiva karcinoma i /ili metastatskih limfnih čvorova u odnosu na peri-kancerogen tkiva. Aberantnoj ekspresija tih proteina također je potvrđena pomoću Western Blot da rak želuca, te metastaze. Dalje, otkrili smo da CagA pregled + H pregled. pylori pregled kolonizirani u 20 od 30 želučanog tkiva raka i promovira ili inhibira ekspresiju tih gena in vivo. Pregled LDH i DLD usko povezana s energetskom metabolizmu. Poremećaj energetskog metabolizma smatra važan faktor za razvoj i progresiju raka. Za razliku od normalnih stanica, stanice karcinoma pokazuju povećanu ovisnost o glikolitičke puta s dovoljno kisika, nazvan aerobni glikolizu. Velika količina piruvatne kiseline, konačni produkt puta, se prevodi u mliječnu kiselinu LDH, promicanjem glikolize puta i energetski metabolizam neravnotežu [25]. Mliječna kiselina može smanjiti pH stanica mikrookoliša, čime se povećava odgovor na neovaskularne angiogeneze faktora za promociju tumorskih stanica metastaziranje [26,27]. U skladu s našim rezultatima, LDH pregled vrlo je izražen u tkivu raka u 61,8% bolesnika s rakom želuca; bolesnici s LDH prekomjernom ekspresijom imali kraće preživljenje u odnosu na pacijente s niskim izraza [28]. Kim i sur pregled. [29] opaženo da DLD pregled izraz povećava s napredovanja tumora, čime više energije za rast tumorskih stanica. Dakle, visoka ekspresija LDH i DLD je ključni faktor za razvoj i progresiju raka želuca i H Netlogu. pylori pregled infekcija potiče ekspresiju tih dvaju gena u želučanog tkiva raka. Pregled Beta-aktin, ključna komponenta citoskeleta, održava strukturu, gibanje i podjelu stanica pod normalnim uvjetima. β-aktin pregled nenormalno se izražava u mnogim bolestima [30]. PRPF19 protein se vjeruje da funkcioniraju na pre-mRNA. Ubikvintinacija od PRPF19 može dovesti do oštećenja DNA, a nenormalno popravak DNA je važan uzrok nastanku tumora [31]. Kalmodulina je protein koji veže kalcij, koji regulira mnoge signalne putove i tako sudjeluje u staničnoj proliferaciji, mitozu i transkripcije gena. Kalmodulinu potiče proliferaciju stanica u jetri karcinoma u kombinaciji s PI3K i prijelaz iz G1 u S fazu u kombinaciji s ciklina E [32]. Inhibitor kalmodulina uhićenjima stanica u G1 fazi da inhibiraju staničnu diobu [33]. U skladu s tim rezultatima, ustanovili smo da je H Osim toga, primijetili smo dolje regulaciju RanGAP metilacije DNA može izazvati abnormalnu ekspresiju gena. H pregled. pylori pregled infekcija povećava razinu metilacije nekih gena i rezultata u procesu karcinogeneze od želučane sluznice [36,37]. DNA metilacije obično se javlja u CpG otocima gena promotora. Otkrili smo status metilacije CpG otoka tih gena u izgrađenim staničnim linijama i utvrdio da je LDH pregled, DLD pregled i CAM pregled, geni su memetilirani na promotora -2325, -1885 i -276 mjesta, odnosno, i RanGAP pregled gena je vrlo metilirani na promotora -570 i -170 mjestima, u skladu s visokom ekspresijom LDH pregled, DLD pregled i CaM pregled gena i niska ekspresija RanGAP Na kraju, ovi rezultati ukazuju na to da H Priznanja Zahvaljujemo kineski Centar za Helicobacter pylori pregled, soja upravljanje a Očuvanje za pružanje H pregled. pylori pregled NCTC11637 i dr Yang Wenxiu i Wu Jiahong za tehničku pomoć. Pregled
) je spiralnim gram-negativna bakterija koja uzrokuje najčešće kronične infekcije u ljudskom želucu. Oko 1% -3% zaraženih osoba razvije rak želuca. Međutim, mehanizmi kojima H
. pylori pregled izaziva rak želuca nisu u potpunosti razumio. Dostupni dokazi ukazuju na jaku vezu između faktora virulencije u H Netlogu. pylori pregled, citotoksin povezana gen A (CAGA), te rak želuca. Za daljnju karakterizaciju H
. pylori pregled virulencije, ustanovili smo tri stanične linije infekcijom želučanog raka stanične linije SGC-7901 i AGS s CagA pregled + pregled, H
. pylori pregled te transfekcijom SGC-7901 sa vektorom koji nosi pune duljine CagA pregled gena. Otkrili smo 135 različito izražene proteina iz tri stanične linije koriste složenu tehnologiju, te 10 diferencijalne proteine zajedničke tri stanične linije su odabrane i prepoznati po LC-MS /MS, kao i verificirana Western blot: P-aktin, L-laktat dehidrogenaze (LDH), dihydrolipoamide dehidrogenaze (DLD), pre-mRNA za obradu faktor 19 homologa (PRPF19), ATP, kalmodulin (CAM), p64 CLCP, trčao specifične GTPaza aktivirajući protein (RanGAP), P43 i kalretikulin. Detekcija ekspresije tih proteina i geni koji kodiraju ove proteine u ljudskim tkivima, u realnom vremenu PCR (RT-qPCR) i western blot rak želuca otkrila da je ekspresija β-aktin pregled, LDH
, DLD pregled, PRPF19 pregled i CaM
geni su up-regulirana i RanGAP pregled je dolje regulirana u želučanom tkivu raka i /ili metastatski limfni čvorovi u odnosu na peri-kancerogen tkiva. Visoke ekspresije gena opažena je za H Netlogu. pylori pregled infekcije želuca tkiva raka. Nadalje, LDH pregled, DLD pregled i CAM pregled, geni su memetilirani na promotora -2325, -1885 i -276 mjesta, odnosno, i RanGAP pregled gena je vrlo metilirani na promotora -570 i -170 mjesta u H Netlogu. pylori pregled -infected i CagA pregled -overexpressing stanice. Ovi rezultati pružaju novi uvid u molekularne patogenezi i liječenju ciljeva za rak želuca s H Netlogu. pylori infekcija pregled pregled
patogenosti otok ( CAG pregled PAI), koji sadrži 27 do 31 gena koji kodiraju sustav bakterija tipa 4 izlučivanjem (T4SS) [7] , Gen citotiksin povezane Gen ( CagA pregled), koji se nalazi na 3 'kraju CAG
PAI, kodira samo poznate bakterijske onkoprotcin, CagA, koja je premještena u stanice domaćina by T4SS nakon bakterijske vezanosti za želudac. Jednom unutar stanice domaćina, CagA je tirozin fosforiliran članovi obitelji kinaza Abl i Src i komunicira s brojnim intracelularne efektora, što dovodi do aktivacije nizvodne signalne molekule [8]. U kliničkim studijama, CagA pregled pozitivnih sojeva su dosljedno povezana s težom želučane upale i čireva, te mali dio ljudi oboljeti od raka želuca [9]. Međutim, mehanizmi kojima se temelji društvo CagA s rakom nisu razjašnjeni. Pregled
. pylori pregled posredovanih [14-16]. Iako su studije metilacije DNA u porastu, gen metilacije stanja izazvana H Netlogu. pylori pregled još nisu jasne. Pregled
. pylori pregled Selektivno Doplata (oksoid doo, Engleska) na 37 ° C u uvjetima microaerobic. Pregled
. CagA pregled gen je identificiran od strane sekvenciranje (GQ161098). pMD18-T / CAGA pregled je razgrađen s restrikcijskim enzimima Pst I i pregled Bam HI pregled i CAGA pregled je ligiran u pcDNA3.1 /Zeo (-) (Invitrogen, USA) za konstrukciju ekspresijskog vektora pcDNA3.1 eukariotski / CAGA
. Sekvence prajmera su u Tablici 1. pregled
. pylori pregled 16S rRNA pregled gena i CagA pregled gena. Sekvencijama navedeni su u tablici 2. pregled
-vector. CagA protein počeli pojavljivati u omjeru stanica bakterija od 1: 500 u kulturi stanica u 6 sati, a sadržaj je bio najveći u omjeru 1: 1000 u 6 sati (Slika 1A i 1B). Međutim, fosforilirani CagA opažena u stanicama u omjeru 1: 500 nakon uzgoja 12 h, a najveći sadržaj opažena u stanicama u omjeru 1: 1000 nakon 6 h kulture. CagA mRNA i proteina također su zabilježene u stabilno CagA pregled -overexpressing SGC-7901 stanica (Slika 1c i 1d). Ovi podaci ukazuju na to da CagA uspješno je uvedena u tri stanične linije i fosforiliran. Pregled
. pylori pregled selektivno kolonizira ljudski želudac za aktiviranje niza patoloških procesa, gen ekspresija 10 diferencijalnih proteina u 30 uzorka ljudskog raka želuca procijenjena kvantitativnom RT-PCR. Od 10 gena, ekspresija β-aktin pregled, LDH pregled, DLD pregled, PRP19 pregled i CaM pregled u karcinome želuca i /ili metastaze bile doregulirani u usporedbi s peri-kancerozni tkivima, dok je ekspresija RanGAP pregled je podregulirao. Slično tome, u 6 proteini su abnormalno izraženi u istim tkivima (Slika 3B i 3C). Nisu primijećene značajne razlike u ekspresiji drugih gena. pregled
sojevi su CagA pregled pozitivan. Razine mRNA p-aktin Netlogu, LDH pregled, DLD pregled, PRP19 i Cam pregled bila je viša u H Netlogu. pylori pregled pozitivnih tkiva nego u negativnim uzorcima (slika 3D). Pregled
. pylori pregled infekcija je važan faktor za H Netlogu. pylori pregled -associated želučanih bolesti, te da CagA je promicanje faktor za rakom želuca [17,18]. izgrađena smo tri eksperimentalne stanične linije, uključujući i dva želuca staničnim linijama karcinoma zaraženih H Netlogu. pylori pregled ( CagA pregled +) i rak želuca stanične linije ekspresijom CagA pregled i utvrdio da CagA počeo da se pojave u stanicama 6 sati nakon infekcije, a za do 12 sati. Nakon toga, fosforilirani CagA počeo da se pojave, u skladu s ubrizgavanjem i slijedi fosforilacija CagA u želučanog epitela uz T4SS od H Netlogu. pylori pregled nakon infekcije ljudske želučane sluznice. Fosforilirani CagA aktivira nizvodne signalne putove i igra patološku ulogu. Također smo uočili CagA u stanicama stabilno transficiranim s CagA
-vector. Ovi podaci potvrđuju uspješnu izgradnju triju eksperimentalnih staničnim linijama. Pregled
. pylori pregled mogu sudjelovati u razvoju raka želuca tkiva zbog izazivanja visoku ekspresiju tih triju proteina. Pregled
gena u tkiva raka s H Netlogu. pylori pregled infekcija. RanGAP je GTPaza aktivirajući protein. Nakon hidrolize GTP na BDP strane GTPaza, aktivni RanGTP postane neaktivan RanGDP, što dovodi do blokade staničnu signalizaciju za inhibiciju progresije raka [34]. Slično tome, smanjena aktivnost RanGAP izazvana ubiquitination potiče razvoj raka [35]. Pregled
gena u želučanim tkiva raka s CagA
+ H pregled. pylori pregled infekcija. Pregled
. pylori pregled infekcija, putem CagA izgon, mogu izazvati neprirodni metilacije ovih gena dovode do disfunkcionalnih gena u želučanim tkiva raka i stanica. Naši rezultati pružaju novi uvid u molekularne patogeneze raka želuca s H Netlogu. pylori pregled infekcija. Buduće studije će istražiti učinke tih izmijenjenih metilacije uzorke u patogenezi karcinoma želuca u kliničkim uzorcima. Pregled