Le microbiote rural et urbain diffère dès le plus jeune âge,

trouve une nouvelle étude Une nouvelle étude a montré que les différences dans le microbiome intestinal humain entre les personnes vivant dans les zones rurales et urbaines du Nigeria commencent à un très jeune âge.

Crédit d'image :Alexey Godzenko/Shutterstock

La découverte, qui vient d'être publié dans la revue Rapports de cellule , pourrait aider les chercheurs à comprendre pourquoi les populations traditionnelles ont tendance à avoir des taux beaucoup plus faibles de maladies occidentales.

Des études antérieures analysant les microbiomes ont généralement comparé les zones rurales, communautés de chasseurs-cueilleurs avec des populations urbaines éloignées en Europe ou aux États-Unis, mais cette étude a comparé les microbiomes des populations africaines rurales et urbaines dans la même zone géographique.

Cette recherche a été spécifiquement conçue pour combler les lacunes dans les connaissances sur la variation du microbiome intestinal humain, ainsi que le métabolome, par rapport aux modes de subsistance des populations géographiquement proches.

Funmilola Ayeni, Premier auteur

L'étude était unique car elle analysait les microbiomes des nourrissons (définis comme des enfants âgés de moins de trois ans) et des adultes.

Les enquêteurs ont été surpris de constater que les nourrissons vivant dans les zones rurales avaient des profils de microbiome généralement plus diversifiés et plus similaires à ceux des adultes.

Le régime alimentaire des habitants des zones rurales se composait de tubercules, céréales, soupes de feuilles et eau non traitée, considérant que le régime alimentaire des habitants des zones urbaines comprenait des aliments transformés et de l'eau traitée, mais avait plus d'éléments d'un régime alimentaire traditionnel nigérian que dans les pays occidentaux.

Ayeni et son équipe ont découvert que le microbiote intestinal des populations rurales contenait davantage d'espèces bactériennes nécessaires à la digestion des fibres. Ils avaient également des niveaux inférieurs d'acides aminés et d'amines biogènes, suggérant qu'ils consommaient moins de protéines.

Nous avons toujours supposé que les microbiomes des nourrissons étaient les mêmes partout, et que les différences sont venues plus tard dans la vie. Nous avons été surpris de constater que les microbiomes des nourrissons vivant dans les zones rurales manquaient de composants que nous pensions depuis longtemps être la norme pour toutes les populations de nourrissons. »

Silvia Turroni, Auteur principal

Turroni dit que les résultats sont remarquables et que des études comme celle-ci ont une profonde pertinence évolutive car elles rappellent les modes de vie qui ont caractérisé l'histoire de l'humanité, de la chasse et la cueillette de nos ancêtres paléolithiques à la petite agriculture, au mode de vie occidental post-industriel.

Les traits microbiens et métaboliques distinctifs observés dans les populations traditionnelles, qui ont tendance à avoir des taux beaucoup plus faibles de maladies occidentales, pourrait aider les chercheurs à comprendre les mécanismes qui conduisent à la rupture de ces relations microbiome-hôte.

"Cela pourrait également potentiellement conduire à une meilleure compréhension de l'inflammation et du dérèglement immunitaire qui s'ensuit."

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