PLOS ONE: L'effet de XPD /ERCC2 polymorphismes sur le cancer gastrique risque parmi les différentes ethnies: Une revue systématique et méta-Analysis

Résumé

Contexte

groupe xeroderma pigmentosum potentiel D (XPD) , également appelé réparation par excision groupe inter-gratuit deux (ERCC2), Lys751Gln et Asp312Asn polymorphismes ont été impliqués dans le risque de cancer de l'estomac chez les différentes ethnies.

Méthodes

Nous avons cherché à explorer l'effet de XPD Lys751Gln et Asp312Asn polymorphismes sur la susceptibilité au cancer de l'estomac chez les différentes ethnies à travers une revue systématique et méta-analyse. Chaque article initialement inclus a été marqué pour l'évaluation de la qualité. les données souhaitables ont été extraites et enregistrées dans des bases de données. 13 études ont finalement été admissibles à la méta-analyse de Lys751Gln polymorphisme et 9 études de la méta-analyse de Asp312Asn polymorphisme. Nous avons adopté le modèle le plus probablement approprié génétique (modèle récessif) pour les deux polymorphismes Lys751Gln et Asp312Asn. Les sources potentielles d'hétérogénéité ont été recherchés par sous-groupe et des analyses de sensibilité, et la publication des biais ont été estimés.

Résultats

conclusions statistiquement significatives ont apparemment été noté chez les Asiatiques, mais pas chez les Caucasiens pour les deux XPD Lys751Gln et XPD polymorphismes Asp312Asn. Une constatation statistiquement significative n'a pu être vu dans le cancer gastrique de type noncardia pour XPD Lys751Gln polymorphisme. Une constatation statistiquement significative pourrait également être vu du sous-groupe de haute qualité, de petite et moyenne taille de l'échantillon-sous-groupe, les articles publiés après 2007, ou PCR-RFLP génotypage sous-groupe de XPD Asp312Asn polymorphisme.

Conclusions

Notre méta-analyse indique que XPD Gln751Gln (CC) génotype et Asn312Asn (AA) de génotype peut sembler être plus sensibles au cancer de l'estomac dans les populations asiatiques, mais pas dans les populations caucasiennes, ce qui suggère que les deux génotypes peuvent être des biomarqueurs importants de prédisposition au cancer gastrique pour les populations asiatiques, l'hypothèse qui doit encore être confirmé dans des études bien conçues entre les différentes ethnies. Gln751Gln (CC) du génotype peut également être associée à de type noncardia risque de cancer de l'estomac, ce qui devrait également être confirmé entre les différents groupes ethniques dans l'avenir

Citation:. Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, G Huang (2012) L'effet de XPD /ERCC2 polymorphismes sur le cancer gastrique risque parmi les différentes ethnies: Une revue systématique et méta-analyse. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10.1371 /journal.pone.0043431

Editeur: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncologie, Portugal

reçues: 5 Avril 2012; Accepté 20 Juillet 2012; Publié: Septembre 13, 2012 |

Droit d'auteur: © Xue et al. Ceci est un article en accès libre distribué sous les termes de la licence Creative Commons Attribution, qui permet une utilisation sans restriction, la distribution et la reproduction sur tout support, à condition que l'auteur et la source originelle sont crédités

Financement:. Ce travail a été soutenu par la national science Foundation naturel de Chine (subventions 30830038, 30970842 et 81071180); Projet "973" (2012CB932604); Projet Découverte de drogue nouvelle (2012ZX09506-001-005); Projet clé de la Commission de la science et de la technologie de la municipalité de Shanghai (subventions 10JC1410000); et le Projet de discipline de premier plan académique Shanghai (subvention S30203). Les bailleurs de fonds ont joué aucun rôle dans la conception de l'étude, la collecte et l'analyse des données, la décision de publier, ou de la préparation du manuscrit

Intérêts concurrents:.. Les auteurs ont déclaré aucun conflit d'intérêts existent

Introduction

Bien que l'incidence du cancer gastrique dans le monde a diminué, sa mortalité se classe toujours deuxième [1]. En Chine, le cancer gastrique constitue même l'une des tumeurs malignes les plus meurtrières [2]. Comme on le sait, des facteurs infectieux, alimentaires, environnementaux et génétiques sont impliqués dans la carcinogenèse gastrique, mais ceux qui sont exposés à des facteurs de risque qui, finalement, de développer un cancer gastrique comprend une proportion mineure [3], ce qui suggère que l'hôte susceptibilité génétique joue un rôle important dans l'estomac le risque de cancer chez les différentes ethnies. Ces diverses susceptibilités peuvent être expliquées, en partie, par des polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) de gènes sensibles entre les différents groupes ethniques [4], [5]. Nos papiers méta-analyse publiés précédemment ont fourni des preuves supplémentaires pour de telles différences ethniques sensibles [5], [6].

Il est largement reconnu que l'ADN doit rester stable pour entreprendre ses fonctions physiologiques essentielles, mais il est constamment vulnérables à divers dommages endogènes et /ou exogènes et donc ses mutations probables pourraient accumuler et carcinogenèse peuvent se produire en raison de l'ADN endommagé. système de réparation de l'ADN, cependant, joue un rôle essentiel dans le maintien des fonctions des cellules normales et l'intégrité du génome par l'inversion de l'ADN endommagé [7]. mutations héréditaires polymorphismes fonctionnels ou accumulés de gènes de réparation d'ADN peuvent influencer la capacité d'accueil pour réparer l'ADN endommagé et ainsi moduler le risque de cancer [8]. SNPs des gènes de réparation de l'ADN commun ont été identifiés [9] et a démontré être lié à la cancérogenèse sporadique [10], [11].

Nucleotide excision réparation (NER), l'une des principales voies de réparation d'ADN chez l'homme , est capable d'éliminer les lésions de base hélice-distorsion produite par la lumière ultraviolette (UV) et un réseau d'agents chimiques [12]. XPD est censé participer à l'ADN au cours de déroulement NER et la transcription, car il possède un seul brin d'ADN-dépendante ATPase et 5'-3 activités ADN hélicase '[13], [14]. XPD (ERCC2) gène, situé sur le chromosome 19q13.3, comprend 23 exons et ses polymorphismes sont pensés pour engendrer des modifications structurelles de la voie NER et la sensibilité influence du cancer. Les plus largement étudié les polymorphismes XPD dans les associations avec la susceptibilité au cancer comprennent un non synonyme A > C substitution dans l'exon 23 provoquant une lysine (Lys) de glutamine (Gln) substitution dans le codon 751 (Lys751Gln, rs1052559), un G non synonyme > Une substitution dans l'exon 10 conduisant à un acide aspartique (Asp) à l'asparagine (Asn) la substitution dans le codon 312 (Asp312Asn, rs1799793), et un synonyme C > une substitution dans l'exon 6 tout en conservant l'arginine (R) résidu dans le codon 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

en 2005, Huang WY et al.
publié la première étude impliquée dans XPD Lys751Gln polymorphisme par rapport au risque de cancer gastrique [16]. Depuis lors, les chercheurs ont rapporté des associations de XPD Lys751Gln, Asp312Asn, et /ou Arg156Arg avec la susceptibilité au cancer gastrique entre les différentes ethnies, mais avec des résultats mitigés ou contradictoires [17] - [30]. Il n'y a qu'un article publié concernant Arg156Arg polymorphisme par rapport au risque de cancer gastrique [28]. À ce jour, il y a eu trois documents pertinents publiés méta-analyse portant sur les polymorphismes XPD [31] - [33]. Deux articles ont été principalement concernés par les susceptibilités globaux de cancer plutôt que la prédisposition au cancer gastrique dans la profondeur [31], [32], fournissant ainsi moins d'informations sur son association avec le risque de cancer gastrique. Plus important encore, ces trois méta-analyses [31] - [33] ont tous échoué à adopter le modèle génétique très probablement approprié, et donc les valeurs authentiques de ces résultats statistiques pourraient être compromis

Par conséquent, le but de. notre méta-analyse était d'explorer, en utilisant le modèle génétique le plus approprié, l'effet des polymorphismes XPD sur le risque de cancer de l'estomac entre les différents groupes ethniques et d'identifier les sources possibles d'hétérogénéité entre les études admissibles.

Matériel et méthodes

recherche Stratégie

Une recherche systématique de la littérature a été effectuée pour des articles concernant les SNP XPD /de ERCC2 associés au risque de cancer de l'estomac. Le MEDLINE, les bases de données EMBASE, chinois infrastructure du savoir national (CNKI), Web of Science, et les bases de données BIOSIS ont été utilisés simultanément avec la combinaison de termes "XPD", "ERCC2", "réparation de l'ADN", "NER", "Lys751Gln", "Asp312Asn" ou "Arg156Arg"; "gène"; «Polymorphisme», «variant» ou «SNP»; et "cancer de l'estomac", "cancer de l'estomac", ou "cancer de l'estomac" jusqu'à Décembre 2011. La recherche a été effectuée sans aucune restriction sur la langue. La portée de recherche documentaire informatisée a été élargi en fonction des listes d'articles récupérés de référence. Les articles originaux pertinents ont également été recherchés manuellement.

Sélection
Étude

Études sur l'association de XPD /ERCC2 SNPs (Lys751Gln, Asp312Asn, et /ou Arg156Arg) avec le risque de cancer gastrique ont été inclus si le conditions suivantes sont réunies: (i) toute étude décrit l'association d'au moins un des XPD /ERCC2 SNPs avec cancer de l'estomac; (Ii) toute étude a rapporté les chiffres des deux contrôles et les cas de cancer de l'estomac; (Iii) les résultats ont été exprimés en odds ratio (OR) avec des intervalles de confiance à 95% (IC); et (iv) des études étaient les cas-témoins cas-témoins ou imbriquées.

Pour identifier les études de haute qualité, nous avons surtout adopté des critères prédéfinis de qualité méthodologique d'évaluation pour la qualité d'évaluation initialement proposée par Thakkinstian et al
[34], adapté par Camargo et al
[35], et affinée par Xue et al
[5] -... [7]. Les critères (vu dans le tableau S1 en ligne) couvrent la crédibilité des contrôles, la représentativité des cas, la consolidation du cancer gastrique, l'examen de génotypage et de l'évaluation de l'association. La qualité méthodologique a été évaluée indépendamment par deux chercheurs (Lin B et Lu Y). Les désaccords ont été résolus par la discussion. Les scores ont varié de zéro le plus bas au plus dix. Articles avec le score inférieur à 6,5 ont été considérés comme les «de qualité faible ou modérée», alors que ceux qui ne sont inférieurs à 6,5 ont été pensé comme ceux "de haute qualité".

Extraction
données

Le suivant les données de chaque article ont été extraites: auteurs, année de publication, pays, l'origine ethnique des participants (classés comme Caucasiens, Asiatiques, etc.), la conception de l'étude, la source des contrôles, le nombre de contrôles et de cas, la méthode de génotypage, la distribution de l'âge et le sexe, la classification de Lauren (intestinale, diffuse, ou mixte), la classification anatomique (cardia ou non-cardia cancer), habitude de fumer, de boire habitude et Helicobacter Pylori de l'état de l'infection.

Les données ont été extraites et enregistrées dans deux bases de données indépendamment par deux chercheurs (Lin B et Lu Y) qui étaient aveugles aux noms de revues, des institutions ou des subventions de fonds. Tout écart entre ces deux enquêteurs a été résolu par l'enquêteur (Xue H), qui ont participé à la discussion avec eux et a pris une décision finale.

Analyse statistique

Toutes les analyses statistiques ont été effectuées en utilisant STATA logiciel statistique (Version 10.1, STATA Corp, College station, TX). Deux faces Ps < 0,05 ont été considérées comme statistiquement significatives. Hardy-Weinberg (HWE) dans les contrôles a été calculé à nouveau dans notre méta-analyse. La bonté du chi carré d'ajustement a été utilisé pour tester la déviation de HWE (significatif au niveau de 0,05).

Les odds ratios (OR) et les intervalles de confiance à 95% (IC à 95%) ont été utilisés pour évaluer la force de associations entre XPD /ERCC2 SNP et le risque de cancer de l'estomac. OU _{1, OU 2, et OR 3 ont été calculés pour les génotypes CC par rapport à AA, CA par rapport à AA et CC contre CA pour XPD Lys751Gln polymorphisme; AA contre GG, GA contre GG, et AA par rapport GA pour XPD Asp312Asn polymorphisme; AA par rapport à CC, CA par rapport CC et AA par rapport à CA pour XPD Arg156Arg polymorphisme, respectivement. Les différences appariées ont été utilisés pour déterminer le modèle génétique le plus approprié. Si OU 1 = OU 3 ≠ 1 et OR 2 = 1, un modèle récessif est suggéré. Si OU 1 = OU 2 ≠ 1 et OR 3 = 1, un modèle dominant est implicite. Si OU 2 = 1 /OU 3 ≠ 1 et OR 1 = 1, un modèle overdominant complet est proposé. Si OU 1 > OU 2 > 1 et OR 1 > OU 3 > 1 ou OR 1 < OU 2 < 1 et OR 1 < OU 3 < 1, un modèle de codominant est indiquée [34]. Prenez XPD Lys751Gln polymorphisme comme un exemple pour l'illustrer. Si un modèle dominant a été indiqué, le groupement d'origine a été effondré et le nouveau groupe de transporteurs C (CC plus CA) a été comparé avec le génotype AA; si un modèle récessif a été suggéré, CC a été comparé au groupe de AA ainsi que l'AC; si un modèle overdominant complet a été impliqué, le groupe de CC plus AA a été comparé à CA; ou si un modèle de codominant a été insinué, CC a été comparée à CA et AA, respectivement.}

La statistique Q a été utilisé pour évaluer l'hétérogénéité des études incluses dans la méta-analyse. I-squared ( I
^{2) la valeur, ce qui représente une variation dans OU attribuable à l'hétérogénéité a ensuite été utilisé pour quantifier le degré de cette hétérogénéité entre les études [36]. Selon les critères publiés récemment Venise [37], " I
2 < 25% ne représente pas l'hétérogénéité, I
2 = 25-50% représente l'hétérogénéité modérée, I
2 = 50-75% représente une grande hétérogénéité, et I
2 > 75% représente une extrême hétérogénéité ». variance Entre-étude Tau-squared (τ 2) La valeur a également été utilisé pour évaluer entre l'étude de la variance. Un modèle à effets fixes, en utilisant la méthode de Mantel-Haenszel (M-H), a été utilisée pour calculer les RUP regroupées lorsque l'homogénéité existait sur la base du test Q valeur de p pas moins de contraste 0.1.By, un modèle à effets aléatoires, en utilisant DerSimonian et méthode Laird (D + L), a été utilisé s'il y avait une hétérogénéité sur la base de test Q valeur inférieure à 0,1 p. Même pour l'homogénéité entre-études, D + méthode L a également été utilisé. Les analyses méta-régression et le sous-analyses ont été utilisées pour explorer et contrôler les sources potentielles d'hétérogénéité entre les études. L'importance des RUP groupées a été testé par test Z (P < 0,05 a été considérée comme significative)}

L'analyse de sensibilité a été réalisée, dans laquelle les estimations méta-analyse ont été calculés après chaque une étude étant omise dans chaque tour <.. br>

Enfin, le biais de publication a été évaluée en effectuant des parcelles d'entonnoir qualitativement, et estimé par Begg et les tests de Egger quantitativement.

Résultats> Littérature Recherche et sélection
étude

Après une recherche exhaustive, un total de 140 articles en anglais et 7 en chinois ont été récupérés. Dans notre méta-analyse ont été initialement inclus au total 15 études [16] - [30] qui répondaient aux critères d'inclusion. Ces 15 études ont été préalablement adapté à la méta-analyse des associations avec le cancer gastrique au sujet de XPD SNP, parmi lesquels 13 études concerné polymorphisme XPD Lys751Gln [16] - [26], [28], [29], 9 études concernaient XPD Asp312Asn polymorphisme [17] - [21], [23], [27], [28], [30], et seulement 1 étude concerne XPD Arg156Arg polymorphisme [28]. 1 article [23] a été indexé dans les deux moteurs de LA RECHERCHE anglaise et chinoise

Traditionnellement, toute étude qui a dévié de HWE aurait dû être retiré. cependant, Minelli C et al. a récemment souligné que les études qui semblent dévier de HWE devraient être étudiées plus loin plutôt que de simplement exclus, sauf si il y a d'autres raisons de douter de la qualité de l'étude [38]. À ce jour, il est encore peu concluante si des études dévié de HWE devraient être inclus ou exclus dans la conduite de la méta-analyse. Dans notre méta-analyse, 3 études concernées XPD Lys751Gln polymorphisme [16], [25], [29] ont été déviés de HWE, et 3 études concerné polymorphisme XPD Asp312Asn [17], [27], [30] ont également été dévié de HWE; Toutefois, compte tenu que le nombre de participants à ces études étaient grandes et étant donné que des analyses de sensibilité serait menée, nous avons finalement restés ces études dans notre méta-analyse

Ainsi, 13 études [16] - [26]. , [28], [29] avec un total de 6344 contrôles et 2750 cas pour XPD Lys751Gln polymorphisme, et 9 études [17] - [21], [23], [27], [28], [30] avec 3429 contrôles et 1715 cas pour XPD Asp312Asn polymorphisme ont finalement été admissibles à la méta-analyse des polymorphismes XPD. Les caractéristiques correspondantes ont été observées dans le tableau 1 et le tableau 2. L'organigramme de la recherche documentaire et l'étude sélection a été éclairé à la figure 1.

Dans l'ensemble méta-analyse, analyse méta-régression et sous-groupes Analyses

Pour XPD Lys751Gln polymorphisme, OU _{1 (valeur p), OU 2 (valeur p), et OR 3 (valeur p) a été de 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369) , et 1,02 (p = 0,811), respectivement, à peine insinuant un effet de modèle particulier de putative sensibles allèle C. Hétérogénéité chi-carré était 29.83 (D.F. = 12), la valeur de p était de 0,003, et I
^{2 était de 59,8%. Après une analyse de méta-régression en utilisant covariable unique (ethnie composée de Caucasiens, Asiatiques, ou de la population turque), les valeurs de p de t valeur de coefficient pour les Asiatiques, les Caucasiens, ou de la population turque étaient 0,001, 0,139 et 0,585, respectivement; indiquant fortement que les Asiatiques seule covariable pourrait surtout constituer la source d'hétérogénéité entre les études. τ 2 pour les Asiatiques, les Caucasiens, ou de la population turque seule covariable étaient 0, 0,09178 et 0,1347, respectivement. Pour les Asiatiques seule covariable, τ 2 a diminué de 0,1233 à 0, indiquant Asiatiques seule covariable pourrait représenter 100% de la source d'hétérogénéité entre les études. Après stratification par analyse ethnique de sous-groupe, OU 1 (valeur p), OU 2 (valeur p), et OR 3 (valeur p) parmi la population asiatique étaient 2,63 (p = 0,002), 1,14 ( p = 0,653) et 1,51 (p = 0,034), respectivement, hautement indiquant un effet de modèle récessif putative sensibles allèle C (OR 1 = OU 3 ≠ 1 et OR 2 = 1).}}

Pour XPD Asp312Asn polymorphisme, OU _{1 (valeur p), OU 2 (valeur p), et OR 3 (valeur p) étaient de 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549) et de 1,47 (p = 0,003), respectivement, hautement indiquant un effet de modèle récessif putatif sensible allèle (OR 1 = OR 3 ≠ 1 et OR 2 = 1) . Hétérogénéité chi-carré était 9,91 (D.F. = 8), la valeur de p était 0,272 et I
^{2 était de 19,2%, ce qui indique aucune hétérogénéité entre les études. Après une analyse de méta-régression en utilisant covariable unique (ethnie composée de Caucasiens ou les Asiatiques), valeur p de t valeur de coefficient pour l'appartenance ethnique unique covariable était 0,277, ce qui indique que l'appartenance ethnique pourrait constituer l'une des sources de faible hétérogénéité entre les études. τ 2 a diminué 0,0354 à 0,02075, indiquant l'origine ethnique pourrait expliquer 41,4% de la source de peu d'hétérogénéité entre les études. De même, après stratification par analyse ethnique de sous-groupe, OU 1 (valeur p), OU 2 (valeur p), et OR 3 (valeur p) parmi la population asiatique étaient 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574) et de 1,80 (p = 0,008), respectivement, ce qui indique en outre un effet de modèle récessif putatif sensible allèle (OR 1 = OR 3 ≠ 1 et OR 2 = 1 ).}}

dans l'ensemble, un modèle génétique récessive a finalement été choisi pour les deux polymorphismes XPD Lys751Gln et XPD Asp312Asn dans notre méta-analyse.

dans notre méta-analyse, les données disponibles ont été stratifiés, à la lumière des participants ethniques, dans les Caucasiens, Asiatiques, et de la population turque. Dans la figure 2, les résultats statistiquement significatives ont été observées chez les Asiatiques, mais pas chez les Caucasiens ou de la population turque (polymorphismes deux XPD Lys751Gln et XPD Asp312Asn). Les RUP regroupées (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 2,41 (1,69 à 3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82 à 1,17, p = 0,803), et 0,97 (0,33 à 2,82, p = 0,954) chez les Asiatiques, les Caucasiens, et la population turque (XPD Lys751Gln polymorphisme dans la partie A) ou 1,77 (1,19 à 2,63, p = 0,005) et 1,31 (0,86 à 1,99, p = 0,211) chez les Asiatiques et les Caucasiens (XPD Asp312Asn polymorphisme dans la partie B), respectivement. Quant à XPD Lys751Gln polymorphisme, P valeurs de l'hétérogénéité Q-statistique dans les Caucasiens, Asiatiques, et de la population turque étaient 0,802, 0,701 et 0,045; I
^{2 étaient de 0,0%, 0,0% et 75,1%; et τ 2 étaient 0.0000, 0.0000 et 0,4489, respectivement, ce qui démontre aucune hétérogénéité dans les Caucasiens ou les Asiatiques, mais une extrême hétérogénéité au sein de la population turque (indiqués dans le tableau 3). Quant à XPD Asp312Asn polymorphisme, P valeurs de l'hétérogénéité Q statistique chez les Caucasiens et les Asiatiques étaient 0,180 et 0,470; I
2 étaient de 41,6% et 0,0%; andτ 2 étaient 0,0587 et 0,0000, respectivement, ce qui démontre aucune hétérogénéité au sein des Asiatiques, mais l'hétérogénéité modérée dans les Caucasiens (indiquées dans le tableau 4).}

Comme le montre le tableau 3 et le tableau 4, les données spécifiques pour XPD Lys751Gln et les polymorphismes XPD Asp312Asn ont été stratifiés, respectivement, sur la base de la taille de l'échantillon, en deux sous-groupes: un grand échantillon (le nombre total de contrôles et cas pas moins de 500) et les petites et modérée échantillon (le nombre total de contrôles et cas moins de 500) sous-groupes. Aucune statistique constatation significative n'a été notée dans les deux sous-groupes de l'échantillon de petite et modérée ou grande contrepartie de l'échantillon pour XPD Lys751Gln polymorphisme, étant donné que les RUP en gestion commune (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 0,96 (0,61 à 1,51, p = 0,858) pour la ancien et 1,17 (0,84 à 1,64, p = 0,351) pour celle-ci, respectivement; mais une constatation statistiquement significative n'a été notée dans les petites et modérée sous-groupe de l'échantillon, mais pas en grande contrepartie de l'échantillon pour Asp312Asn polymorphisme, étant donné que les RUP en gestion commune (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 1,74 (1,18 à 2,56, p = 0,005) pour l'ancien et 1,35 (0,82 à 2,21, p = 0,239) pour la seconde, respectivement.

les données ont également été stratifié, en conformité avec les scores d'évaluation de la qualité, en haute qualité (scores pas moins de 6,5) et qualité faible et modérée (scores moins de 6,5) sous-groupes. Quant à XPD Lys751Gln polymorphisme, ne trouvant pas statistiquement significative a été témoin dans les deux sous-groupes de haute qualité ou homologue à faible et modérée de qualité, étant donné que les RUP regroupées (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 1,20 (0,91 à 1,60, p = 0,199) pour le premier et 0,61 (0,34 à 1,11, p = 0,104) pour celui-ci. Lorsque la sous-stratification de l'appartenance ethnique a été réalisée pour sous-groupe de haute qualité, une constatation statistiquement significative a été beaucoup apparemment été témoin chez les Asiatiques, mais aucune conclusion statistiquement significative n'a été notée chez les Caucasiens parce que les ORs communs (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 2,54 (1,77 à 3,65, p = 0,000) pour le premier et 0,98 (0,82 à 1,17, p = 0,803) pour celle-ci, respectivement. Quant à Asp312Asn polymorphisme, une constatation statistiquement significative a été témoin du sous-groupe de haute qualité, mais pas en contrepartie à faible et modérée de qualité, étant donné que les RUP en gestion commune (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 1,56 (1,05 à 2,33, p = 0,028) pour le premier et 1,42 (0,85 à 2,40, p = 0,184) pour celui-ci. De même, lorsque la sous-stratification de l'appartenance ethnique a été réalisée pour sous-groupe de haute qualité, une constatation statistiquement significative a été beaucoup apparemment été témoin chez les Asiatiques, mais aucune conclusion statistiquement significative n'a été notée chez les Caucasiens parce que les ORs communs (IC à 95%, la valeur de p) étaient 2,37 (1.29- 4,36, p = 0,005) pour le premier et 1,31 (0,86 à 1,99, p = 0,211) pour la seconde, respectivement.

les données ont en outre stratifié, en ligne avec le temps de publication, dans la publication antérieure sous-groupe ( articles publiés avant ou en 2007) et la publication sous-groupe plus tard (articles publiés après 2007). Quant à XPD Lys751Gln polymorphisme, aucune différence statistiquement significative n'a été observée au motif que les RUP en gestion commune (IC à 95%, la valeur de p) étaient 0,89 (0,66 à 1,19, p = 0,428) dans le premier et 1,23 (0,84 à 1,81, p = 0,285) dans celui-ci, respectivement. Quant à Asp312Asn polymorphisme, un résultat statistiquement significatif n'a été observé dans la publication sous-groupe plus tard, mais pas dans le sous-groupe publication antérieure au motif que les RUP en gestion commune (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 1,46 (1,02 au 2,09, p = 0,041) dans l'ancien et 1,61 (0,89 à 2,92, p = 0,115) dans le second, respectivement.

Lorsque le cancer gastrique a été classé dans la non-cardia (ou distal) et les sous-types du cardia, une constatation statistiquement significative n'a été observée chez les non Type -cardia mais pas chez type cardia pour XPD Lys751Gln polymorphisme au motif que les RUP regroupées (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 2,03 (1,16 à 3,54, p = 0,013) entre le type non-cardia et 0,88 (0,66 à 1,18, p = 0,403) entre le type de cardia. Quant à Asp312Asn polymorphisme, constatation statistiquement significative n'a été observée entre le type du cardia au motif que la mise en commun OR (IC à 95%, la valeur de p) était de 0,89 (0,56 à 1,43, p = 0,642), mais OR (IC à 95%, la valeur de p ) concernant le type non-cardia ne pouvait pas être calculé car une seule étude [21] mentionne clairement le nombre de génotypes de type non-cardia.

En termes de pathologie, le cancer gastrique pourrait être classé dans l'intestin, diffuse, ou sous-types mélangés, mais seulement 1 étude [19] clairement traitée et a mentionné le nombre de génotypes de cancer du sous-type diffus; ainsi sous-type pathologique stratification ne peut pas être fait dans notre méta-analyse.

Les facteurs de confusion tels que Helicobacter pylori
infection ou le statut tabagique ne pouvaient être analysés dans notre méta-analyse parce que les données pertinentes nécessaires au moins deux études pourraient ne pas être accessibles dans notre méta-analyse.

Et quand les techniques de génotypage ont été considérés, pas statistiquement constatation importante a été notée dans chaque sous-groupe technique de génotypage pour XPD Lys751Gln polymorphisme parce ORs regroupé (IC à 95%, la valeur p) étaient de 0,94 (0,68 à 1,29, p = 0,701) et 1,67 (0,68 à 4,14, p = 0,265) dans RFLP et TagMan sous-groupes, respectivement; mais une constatation statistiquement significative a été notée dans RFLP génotypage sous-groupe, mais pas dans Direct sous-groupe de séquençage pour Asp312Asn polymorphisme parce ORs regroupées (IC à 95%, la valeur de p) étaient 1,90 (de 1,09 à 3,31, p = 0,023) et 1,24 (0,70 à 2,20, p = 0,450), respectivement

. Analyse de sensibilité

Les méta-analyses ont été effectuées à plusieurs reprises lorsque chaque étude particulière avait été enlevé. Les résultats indiquent que les estimations des effets aléatoires avant et après la suppression de chaque étude étaient similaires en général, suggérant modérément grande stabilité des résultats de méta-analyse. Pour XPD Lys751Gln polymorphisme, comme le montre la figure 3, partie A, la seule étude la plus influence sur les estimations groupées ensemble semblait être l'étude menée par Long XD et al. [25], coincidently dévié de HWE, l'analyse de sensibilité, cependant, indiqué modérément grande stabilité des résultats à partir des faits que les RUP (IC à 95%, la valeur de p) étaient 1,12 (0,85 à 1,48, p = 0,410) avant l'enlèvement de cette étude et 0,98 (0,83 à 1,15, p = 0,781) après le retrait de cette étude. Compte tenu de l'étude [16] réalisée par Huang WY et al. qui est dévié de HWE, les RUP (IC à 95%, la valeur de p) étaient 1,12 (0,85 à 1,48, p = 0,410) avant la suppression de cette étude et de 1,17 (0,87 à 1,58, p = 0,309) après le retrait de cette étude pour la toute appartenance ethnique, ce qui indique une grande stabilité des résultats. De même, après le retrait de l'étude [29] menée par AB Engin et al., A également dévié de HWE, l'OR (IC à 95%, la valeur de p) est devenu 1,19 (0,91 à 1,57, p = 0,209) pour la toute appartenance ethnique, indiquant une grande stabilité des résultats. Si toutes les trois études dévié-HWE [16], [25], [29] ont été enlevés, l'OR (IC à 95%, la valeur de p) est devenu 1,06 (0,88 à 1,28, p = 0,555) pour la toute appartenance ethnique, indiquant modérément grande stabilité des résultats (les chiffres illustrant ont été omis en raison de la longueur du papier).

pour Asp312Asn polymorphisme, comme le montre la figure 3, partie B, la seule étude les plus influant sur les estimations groupées ensemble semblait être l'étude menée par Chen Z et al. [28], l'analyse de sensibilité, cependant, a indiqué modérément grande stabilité des résultats à partir des faits que les RUP (IC à 95%, la valeur de p) étaient de 1,48 (1,12 à 1,97, p = 0,007) avant la suppression de cette étude et de 1,32 (1,04 à 1,70, p = 0,025) après le retrait de cette étude. Si toutes les trois études dévié-HWE [17], [27], [30] ont été enlevés, l'OR (IC à 95%, la valeur de p) est devenu 1,56 (1,05 à 2,33, p = 0,028) pour la toute appartenance ethnique, ce qui indique également modérément grande stabilité des résultats (les chiffres illustrant ont été omis en raison de la longueur du papier).

cumulatif méta-analyse

méta-analyses cumulées de XPD Lys751Gln association du polymorphisme ont également été menées chez les Asiatiques et Caucasiens par l'assortiment de temps de publication et le nombre total de la taille de l'échantillon. Comme le montre la figure 4, partie A, les inclinations vers des associations significatives pour XPD Lys751Gln polymorphisme pourrait être vu chez les Asiatiques. Dans la figure 4, partie B, les inclinations vers les associations nulles pour XPD Lys751Gln polymorphisme pourrait être observée chez les personnes de race blanche dans l'ordre chronologique. inclinations similaires pourraient être observés pour Asp312Asn polymorphisme au sein des populations de différentes origines ethniques (Chiffres non représentés).

Publication Bias Analyse

Le biais de publication a été préalablement examiné par des parcelles d'entonnoir qualitativement et estimé par Begg et les tests de Egger quantitativement . Pour XPD Lys751Gln polymorphisme, son intrigue d'entonnoir (figure 5A) a montré que les points presque symétriquement distribués, principalement dans les pseudo 95% des limites de confiance. Les valeurs de P étaient 0,428 et 0,989 dans le test de Begg et le test de Egger, respectivement, insinuant pas de biais de publication. Pour Asp312Asn polymorphisme, son graphique en entonnoir (figure 5B) a montré que les points presque symétriquement distribués, principalement dans les pseudo 95% des limites de confiance. Les valeurs de P étaient 0,108 et 0,045 dans le test de Begg et le test de Egger, respectivement, insinuant pas ou peu de biais de publication.

Discussion

Dans notre méta-analyse des résultats statistiquement significatifs ont apparemment été noté chez les Asiatiques, mais pas dans les Caucasiens à la fois pour XPD Lys751Gln et polymorphismes XPD Asp312Asn. Egalement basé sur les résultats des méta-analyses cumulatives, les inclinations vers des associations significatives dans les Asiatiques pour les deux XPD Lys751Gln et polymorphismes XPD Asp312Asn pourraient être évidemment vus lorsqu'ils sont triés par temps de publication et la taille de l'échantillon total. XPD Gln751Gln (CC) et Asn312Asn (AA) génotypes peuvent sembler être plus sensibles au cancer de l'estomac chez les Asiatiques. Nos méta-analyses suggèrent que Gln751Gln (CC) et Asn312Asn (AA) génotypes peuvent être des biomarqueurs importants de prédisposition au cancer gastrique pour les Asiatiques, l'hypothèse qui doit encore être confirmé dans les futures études bien conçues dans les populations asiatiques. Aussi les différents ou même contradictoires associations de risque, le cas échéant, entre les différents groupes ethniques devraient être plus minutieusement étudiées et reconfirmé à l'avenir.

Pour XPD Asp312Asn SNP, bien que I
^{2 ( %) était de 19,2 et τ 2 0,0354 était, comme le montre le tableau 4, ce qui représente théoriquement peu ou pas d'hétérogénéité; pratiquement, après analyse de sous-groupe ethnique, les valeurs de I
2 (%) et τ 2 est devenu 0.0 et 0.0000 pour les Asiatiques et 41,6 et 0,0587 pour les Caucasiens, respectivement, ce qui indique en outre que, en fait , aucune hétérogénéité existait chez les Asiatiques études plutôt que chez les Caucasiens homologues. Compte tenu de cela, nous pensons que les analyses de stratification ou sous-groupes sont encore nécessaires dans notre méta-analyse.}

• PLOS ONE: l'immunité innée et de lymphome non hodgkinien (LNH) Les gènes associés à une étude imbriquée Case-Control pour le cancer gastrique Risque
• PLOS ONE: Révéler le mécanisme moléculaire de cancer gastrique Marker Annexin A4 dans la prolifération des cellules du cancer utilisant Exon Arrays