PLOS ONE: l'immunité innée et de lymphome non hodgkinien (LNH) Les gènes associés à une étude imbriquée Case-Control pour le cancer gastrique Risque

Résumé

Objectif

variants génétiques régulant le système immunitaire de l'hôte peuvent contribuer à la susceptibilité au développement du cancer gastrique. On connaît peu le rôle du immunity- innée et non-hodgkinien (LNH) gènes concernant la PI pour le risque de cancer de l'estomac. Cette étude cas-témoins nichée a été réalisée pour identifier les gènes candidats pour le risque de cancer de l'estomac pour les études futures.

Méthodes

Dans la phase de découverte, 3072 SNPs dans 203 immunity- innée et 264 LNH connexes gènes en utilisant le Illumine GoldenGateTM Panel OPA ont été analysées dans 42 appariés ensembles cas-témoins choisis dans le coréen multi-centre Cancer Cohort (KMCC). Six SNP significatifs sur quatre l'immunité innée ( DEFA6, DEFB1, JAK3,
et ACAA1
) et 11 SNP dans neuf gènes LNH liés ( Insl3, CHMP7, BCL2L11, TNFRSF8, RAD50, CASP7, CHUK, CD79b,
et CLDN9
) avec un permuté p
-value < 0,01 ont été ré-génotypés dans la phase de réplication entre les 386 cas et 348 contrôles. Les odds ratios (RUP) pour le risque de cancer gastrique ont été estimés ajustement pour l'âge, le tabagisme, et H. pylori
et la positivité de CagA. ORs récapitulées dans la population totale de l'étude (428 cas et 390 témoins) sont présentés en utilisant pooled- et méta-analyses

Résultats

Quatre SNP avaient aucune hétérogénéité entre les phases:. Dans le méta- analyse, DEFA6
rs13275170 et DEFB1
rs2738169 avaient tous deux 1,3 fois supérieure odds ratio (OR) pour le cancer gastrique (IC à 95% = 1,1-1,6 et 1,1-1,5, respectivement) . INSL3
rs10421916 et rs11088680 avaient tous deux une fois 0,8 diminué ou pour le cancer gastrique. (IC à 95% = 0,7 à 0,97, et 0,7-0,9, respectivement)

Conclusions

Nos résultats suggèrent que certaines variantes dans l'immunité innée et les gènes de la LNH liés influent sur le risque de cancer de l'estomac, peut-être en modulant les mécanismes infection-inflammation-immunité qui restent à définir

Citation:. Park SK, Yang JJ , Oh S, Cho LY, Ma SH, Shin A, et al. (2012) l'immunité innée et de lymphome non hodgkinien (LNH) Les gènes associés à une étude de cas-témoins pour le cancer gastrique risque. PLoS ONE 7 (9): e45274. doi: 10.1371 /journal.pone.0045274

Editeur: Georgina L. Tenir, Université d'Aberdeen, Royaume-Uni

Reçu: 10 mai 2012; Accepté le 14 Août 2012; Publié le 21 Septembre, 2012

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