PLoS ONE: Die Wechselwirkungen von pri-let-7a-1 rs10739971 mit PGC und ERCC6 Gen-Polymorphismen bei Magenkrebs und Atrophic Gastritis

Abstrakt

Hintergrund

Das Ziel dieser Studie war es die Wechselwirkungen von pri-let-7a-1 rs10739971 mit Pepsinogen C
( PGC
) und Exzisionsreparatur Quer Ergänzung Gruppe 6
( ERCC6 zu untersuchen
) Gen-Polymorphismen und seine Verbindung mit den Risiken von Magenkrebs und atrophische Gastritis. Wir hatten gehofft, miRNA-Polymorphismus oder eine Kombination aus mehreren Polymorphismen zu identifizieren, die als Biomarker für die Vorhersage des Risikos von Magenkrebs und seine präkanzeröse Erkrankungen dienen könnte.

Methoden

Sequenom Massarray-Plattform Methode wurde verwendet, um nachzuweisen Polymorphismen von pri-let-7a-1 rs10739971 G → A, PGC
rs4711690 C → G, PGC
rs6458238 G → A, PGC
rs9471643 G → C, und ERCC6
rs1917799 in 471 Magenkrebs-Patienten, 645 atrophische Gastritis-Patienten und 717 Kontrollen.

Ergebnisse |

Ein Interaktionseffekt von pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus mit ERCC6
rs1917799 Polymorphismus wurde für das Risiko von Magenkrebs beobachtet ( P
_{Interaktion = 0,026); und Interaktionseffekte von pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus mit PGC
rs6458238 Polymorphismus ( P
Interaktion = 0,012) und PGC
rs9471643 Polymorphismus ( P
Interaktion = 0,039) für das Risiko der atrophischen Gastritis beobachtet.}

Fazit

die Kombination von pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und ERCC6
und PGC
Polymorphismen eine größere Vorhersage Potential als ein einzelner Polymorphismus auf seiner eigenen bieten könnte. Groß angelegte Studien und molekularen Mechanismus Forschung nötig sind, um unsere Ergebnisse zu bestätigen

Citation:. Xu Q, Liu J-w, er C-y, Sun L-p, Gong Y-h, Jing J-j et al. (2014) Die Wechselwirkungen von pri-let-7a-1 rs10739971 mit PGC
und ERCC6
Gen-Polymorphismen bei Magenkrebs und atrophische Gastritis. PLoS ONE 9 (2): e89203. doi: 10.1371 /journal.pone.0089203

Editor: Xiaoping Miao, MOE Key Laboratory von Umwelt und Gesundheit, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, China

empfangen: 20. November 2013; Akzeptiert: 16. Januar 2014; Veröffentlicht: 25. Februar 2014

Copyright: © 2014 Xu et al. Dies ist eine Open-Access-Artikel unter den Bedingungen der Lizenz Creative Commons, die uneingeschränkte Nutzung erlaubt, die Verteilung und Vervielfältigung in jedem Medium, vorausgesetzt, der ursprüngliche Autor und Quelle genannt werden

Finanzierung:. Diese Arbeit durch Zuschüsse aus dem National Key Grundlagenforschung Programm von China unterstützt wurde (973 Programm Bezugsnr. 2010CB529304), der National Natural Science Foundation of China (Ref-Nr 31200968) und die Wissenschaft Technologie-Projekt in der Provinz Liaoning (Ref-Nr 2011225002) . Die Geldgeber hatten keine Rolle in Studiendesign, Datenerfassung und Analyse, Entscheidung oder Vorbereitung des Manuskripts zur Veröffentlichung

Konkurrierende Interessen:.. Die Autoren haben erklärt, dass keine Interessenkonflikte bestehen

Einführung

Personen mit ähnlichen Lebensgewohnheiten und Lebens in ähnlichen Umgebungen besitzen unterschiedliche Risiken von Krebs. Die Identifizierung und Personen mit hohem Risiko der Entwicklung von Krebs vorhersagen kann die Notwendigkeit zum Ändern Lebensgewohnheiten an. Einzel-Nukleotid-Polymorphismen (SNPs) spielen eine zentrale Rolle bei Personen mit einem erhöhten Krebsrisiko vorherzusagen. In den letzten Jahren wurden Polymorphismen von pri-miRNA berichtet Biomarker zur Vorhersage Krebsrisiko, wie pri-miR-34b /c rs4938723 Polymorphismus [1], pri-miR-218 rs11134527 Polymorphismus [2] und pri-miR-938 zu sein rs2505901 Polymorphismus [3]. Studien haben gezeigt, dass die Anzahl der einzelnen Gen-Polymorphismen mit dem Risiko von Magenkrebs assoziiert wurde [4]. Allerdings ist Magenkrebs eine komplexe mehrstufige Krankheit mit vielen Genen beteiligt, und einzelne SNPs haben begrenzte Fähigkeit, Magenkrebsrisiko [5] zu prognostizieren - [7]. Mehrere Studien haben berichtet, dass Gen-Gen-Interaktionen wichtiger sind als die Hauptwirkung eines einzelnen Gens in komplexen Krankheiten, wie Krebsarten [7] - [9]. Die grundlegende Forschungsansatz für die Gen-Gen-Interaktionen ist die Kombination von zwei oder mehreren Polymorphismen mit geringen oder keinen Effekt aus früheren Einzel SNP Studien [10], [11] zu untersuchen. Allerdings haben die meisten früheren Studien über die prädiktive Rolle eines einzelnen Gens SNP konzentriert und mit Blick auf die mögliche Anwendung von Gen-Gen-Interaktionen.

Derzeit hauptsächlich Ermittler auf Gen SNP-SNP-Wechselwirkungen Fokus, der kann dazu führen, protein- Protein-Wechselwirkungen, und nur wenige Studien haben Wechselwirkungen zwischen miRNA Polymorphismen und Gen-Polymorphismen untersucht, die Protein-RNA-Interaktionen verursachen. miRNA wurde berichtet Teil in dem Multi-Gen-Netzwerk von Magen Karzinogenese zu nehmen [12]. Das gleiche miRNA wurde berichtet, um mehrere Zielproteine ​​zu regulieren, und die gleichen Proteine ​​könnten von mehreren miRNA [13] moduliert werden. Als Folge bildeten die Auswirkungen der miRNA und Gene ein Netzwerk.

Unsere bisherigen Kandidaten-Gen Assoziationsstudie die Assoziation der untersuchten Pepsinogen C
( PGC
) und Exzisionsreparatur Quer Gruppe 6
Ergänzung ( ERCC6
) mit dem Risiko von Magenkrebs, und festgestellt, dass PGC
Gen rs4711690 C → G, rs6458238 G → A und rs9471643 G → C Polymorphismus hatte schützende Wirkung gegen atrophische Gastritis [4]. PGC hatte schützende Wirkung auf den normalen Magen und zeigten eine geringe Expression in Magenkrebs, und der Verlust an Schutz wurde mit dem Auftreten von Magenkrebs assoziiert [14]. ERCC6 ist ein Mitglied der DNA-Reparatur-Familie, die in der Reparatur von DNA-Schäden in der Karzinogenese beteiligt [15]. ERCC6
rs1917799 T > G-Polymorphismus in der Promotorregion wurde mit einem erhöhten Magenkrebsrisiko in einer chinesischen Bevölkerung verbunden sind [16]. Let-7a ein Tumorsuppressor ist, und neuere Studien festgestellt, dass die Funktion von reifen let-7a eng mit dem Auftreten und der Entwicklung von Magenkrebs in Beziehung steht und verringerte Expression von let-7a mit malignem biologische Verhalten assoziiert ist [17], [ ,,,0],18]. Aber lassen Sie-7a genetische Varianten wurden nicht für ihre Verbände und Magenkrebsrisiko untersucht. Rs10739971 ist ein SNP befindet -559 bp stromaufwärts von let-7a-1, die eine Promotorregion von let-7a-1 sein könnte. In der HapMap-Datenbank, die minimale Allelfrequenz von rs10739971 ist ≥5% sowohl Europäer und Asiaten. Aber ob es einen Zusammenhang zwischen rs10739971 und Krankheitsrisiko und Wechselwirkungen zwischen rs10739971 und anderen Polymorphismen, bleiben unbekannt. Wir stellten die Hypothese, dass die oben genannten Varianten optimalen Kandidaten sein Potenzial SNP-SNP-Wechselwirkungen an zwei oder mehr Loci zu untersuchen, zu Magenkrebs Ätiologie beitragen.

In diesem Fall-Kontroll-Studie eine chinesische Bevölkerung mit, untersuchten wir die Verband der pri-let-7a-1 rs10739971 mit Magenkrebsrisiko und die Wechselwirkungen von miRNA-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und PGC
und ERCC6
Polymorphismen in Proben von der gleichen Gruppe, und diskutieren ihre Anwendung Aussichten bei Magenkrebs und seine präkanzeröse Erkrankungen. Unseres Wissens ist dies die erste Studie versucht, mögliche SNP-SNP-Wechselwirkungen von miRNA SNPs und Gen SNPs an zwei oder mehreren Loci bei Magenkrebs Anfälligkeit verwickelt zu beurteilen. Wir hatten gehofft, Kombinationen von Gen-Gen-Polymorphismen zu finden, die das Risiko von Magenkrebs und seine präkanzeröse Erkrankungen vorhersagen konnte und experimentelle Beweise für die Früherkennung von Magenkrebs zu bieten.

Methoden

Patienten

in dieser Studie wurden insgesamt 1834 Personen, die 471 Patienten mit Magenkrebs eingeschlossen, 646 atrophische Gastritis-Patienten und 717 Kontrollen wurden von Patienten, die eine Gastroskopie Untersuchung Screening in Zhuanghe Region und Patienten retrospektiv rekrutiert, die Gastroskopie Untersuchung unterzog oder Magen-Operation an der ersten Affiliated Hospital der China Medical University, Provinz Liaoning, China zwischen 2002 und 2011 Fasten wurde venöses Blut gesammelt und alle angemeldeten Teilnehmer wurden auf der Grundlage ihrer gastroskopischen und histopathologische Untersuchungen diagnostiziert. Magenkrebs wurde basierend auf WHO-Kriterien diagnostiziert und atrophische Gastritis und oberflächliche Gastritis wurden von Sydney Klassifizierung eingestuft. Berechtigte Kontrollen waren die Teilnehmer mit einem normalen Magen oder nur Gastritis nach Gastroskopie und pathologischen Untersuchungen und hatte keine anderen Krankheiten.

Das Design der Studie wurde von der Human-Ethikkommission der Medizinischen Universität China (Shenyang, China genehmigt ). Eine schriftliche Einverständniserklärung wurde von allen Teilnehmern erhalten. Krankengeschichten (wie Alter, Geschlecht, Rauchen und Alkoholkonsum) wurden mit Hilfe eines Fragebogens erhoben und die Aufzeichnungen computerisiert wurden. Jeder einzelne in der Studie bereitgestellt informierte Zustimmung für die epidemiologische Untersuchung geschrieben. Detaillierte Teilnehmer Eigenschaften sind in Tabelle 1 zusammengefasst

Genomic DNA extrahiert

Genomic DNA extrahiert wurde eine zuvor beschriebene Verfahren mit einer leichten Modifikation unter Verwendung von [19]. Kurz gesagt, eine gefrorene Gerinnsel (500 ul) wurde zu 800 &mgr; l TE-Puffer (Triethanolamid), gut gemischt und zentrifugiert bei 10.000 × g
für 5 min das Gerinnsel zu dispergieren. Folgende clot Störung, 400 &mgr; l TE, 25 ul 10% SDS und 5 &mgr; l von 20 mg /ml Proteinase K wurden zugegeben und bei 37 ° C über Nacht inkubiert. Der Überstand wurde entnommen und ein gleiches Volumen an Phenol zugegeben wurde. Das Röhrchen wurde für 15 min auf einem Rotator angeordnet und dann bei 10.000 × zentrifugiert g
für 15 min. Der Überstand wurde entfernt, und eine zweite Extraktion wurde mit der Zugabe von einem gleichen Volumen eines Gemisches aus Phenol und Chloroform (1.01) durchgeführt. Nach der Zentrifugation wurde der Überstand entfernt und eine dritte Extraktion wurde durch Zugabe eines gleichen Volumens an Chloroform durchgeführt. Nach der Zentrifugation wurde der Überstand aufgenommen und zwei Volumina Proteinfällungslösung (zwei Volumina absolutem Ethanol, enthaltend 10% 3 mol /L Natriumacetat) wurden zugegeben und 2 h bei -20 ° C inkubiert. Jede Probe wurde bei 10.000 × zentrifugiert g
für 10 min. Nach Zentrifugation wurde das resultierende DNA-Pellet mit 75% Ethanol gespült und bei 10.000 × zentrifugiert g
für 10 min. Die 75% Ethanol wurde dekantiert und die Röhrchen 30 min auf sauberen saugfähigem Papier invertiert. Die resultierende DNA wurde in TE-Puffer und gelagert bei -20 ° C bis zum Gebrauch rekonstituiert.

SNP Genotypisierung

DNA-Proben wurden zu Arbeitskonzentrationen von 50 ng /ul vor Genotypisierung verdünnt. Die Tests, Primer-Design, und Genotypisierung von 29 Polymorphismusorte für einen Kandidaten-Gen assoziiert Studie ausgewählt wurden alle von CapitalBio (Beijing, China) mit Sequenom Massarray-Plattform (Sequenom, San Diego, CA, USA), die zwischen Mai 2011 und Dezember 2011 durchgeführt basierend auf den Anweisungen des Herstellers [4], [20]. Fünf von 29 Polymorphismen wurden weitere Interaktionsanalyse in der vorliegenden Studie ausgewählt. Zur Auswertung wurden die Qualität der Genotypisierung, 5% wiederholte Proben Genotypisierung und die Ergebnisse waren 100% konsistent.

Der Nachweis von H. pylori in Serum

Die serologische Tests für H. pylori
wurden durchgeführt, um den Status von H zu überprüfen. pylori
Infektion mittels ELISA ( H. pylori
-IgG ELISA-Kit, BIOHIT Plc, Helsinki, Finnland), wie zuvor beschrieben [21]. Positiv wurde als der Titer von H beurteilt. pylori
-IgG höher als 34EIU (der Cut-off-Wert durch das Protokoll angegeben). Kurz gesagt, wurden Serumproben 1:200 (5 &mgr; l + 995 &mgr; l), verdünnt mit Verdünnungspuffer und gut gemischt. Dann wurden 100 &mgr; l Leerlösung, Kalibratoren, Kontrollen und verdünnten Proben wurden in die Vertiefungen gegeben. Die Platte wurde mit der Inkubation Deckel bedeckt und 30 min bei 37 ° C inkubiert. Nach der Inkubation wurden die Vertiefungen fünfmal mit 350 &mgr; l verdünnt (1:100) Waschpuffer und die Platte mehrmals vorsichtig auf Filterpapier angezapft gewaschen. Dann wurden 100 &mgr; l gemischte Konjugat-Lösung wurde in die Vertiefungen gegeben und für 30 min bei 37 ° C inkubiert. Nach der Inkubation wurden die Vertiefungen wieder gewaschen und 100 ul Substratlösung gemischt wurde zu den Vertiefungen gegeben, bevor sie für 30 min bei Raumtemperatur (20-25 ° C) in einer dunklen Umgebung inkubiert. Schließlich wurden 100 &mgr; l der gemischten Stoplösung zugegeben, und die Extinktion wurde bei 450 nm innerhalb von 30 min zu lesen.

Statistical analysis

Alle statistischen Analysen wurden unter Verwendung von SPSS 16.0 Software (SPSS, Chicago , IL, USA). Pearson χ ^{2 Tests wurden verwendet, um Unterschiede zwischen den Geschlechtern bei und Kontrollgruppen zu bewerten. ANOVA wurde keine Unterschiede zwischen Alter in den unterschiedlichen Gruppen zu bewerten durchgeführt. Likelihood Ratio Tests wurden durchgeführt, um die Interaktion Auswirkungen auf das Risiko von Magenkrebs zu bewerten, indem das Modell zu vergleichen, die nur die Haupteffekte beteiligt und das gesamte Modell, das auch die Interaktion Begriff enthalten. A P
-Wertes. ≪ 0,05 für alle zweiseitigen Tests als statistisch signifikant angesehen wurde}

Ergebnisse |

Hauptwirkungsanalysen einzelner Polymorphismen

in unserer früheren Studie fanden wir, dass pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus signifikant mit einem erhöhten Risiko von atrophischer Gastritis assoziiert war (OR = 2.59, P
= 0,018) in der kleineren Studienpopulation, aber keine signifikante Assoziation wurde in der weiteren Validierungsstudie einer größeren Population (nicht veröffentlichte Daten) gefunden; PG C
rs4711690, rs6458238, rs9471643 und Polymorphismen waren signifikant mit einem erhöhten Risiko von atrophischer Gastritis ( P
= 0,093, OR = 0,75; P
= 0,015, OR = 0,73; P
= 0,033, OR = 0.69, respectively) [4]; ERCC6
rs1917799 Polymorphismus war signifikant mit einem erhöhten Risiko von Magenkrebs (OR = 1.38, P
= 0,035) [20].

Die Zwei-Wege-Interaktion von pri -let-7a-1 rs10739971 und PGC, ERCC6 Polymorphismen im Risiko von Magenkrebs /atrophische Gastritis

Um zu untersuchen, ob Gen-Polymorphismen und miRNA-Polymorphismus eine Interaktion Wirkung hatte, analysierten wir Interaktionen zwischen miRNA-Polymorphismus und jedes Gen-Polymorphismus . Wir fanden, dass miRNA-Polymorphismus und PGC
und ERCC6
Polymorphismen zeigten eine starke statistische Assoziation mit Magenkrebs oder atrophische Gastritis. So haben wir analysiert, um die Interaktionseffekt von pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und PGC
und ERCC6
Polymorphismen und ihre Verbände, mit den Risiken von Magenkrebs und atrophische Gastritis. Die Ergebnisse zeigten, dass pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und ERCC6
rs1917799 Polymorphismus Wechselwirkungen für Magenkrebsrisiko ( P
_{Interaktion = 0,026, Tabelle 2) hatte. Dieses SNP Paar zeigte erhöhtes Risiko für Magenkrebs (OR = 2,59, 95% CI = 1,12-5,97). Pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und PGC
rs65458238 und rs9471643 Polymorphismus hatte Wechselwirkungen für das Risiko der atrophischen Gastritis ( P
Interaktion = 0,012 und 0,039 bzw. Tabelle 3). Für die rs65458238 Polymorphismus zeigte das SNP Paar Risiko der atrophischen Gastritis erhöht (OR = 2,77, 95% CI = 1,25-6,13); während die andere zeigte SNP Paar Risiko der atrophischen Gastritis verringert (OR = 0,52, 95% CI = 0,28-0,97) für rs9471643 (Tabelle 3).}

SNP-SNP-Wechselwirkungen mehrerer SNPs mittels logistischer Regression
Beteiligung

Wir untersuchten weiter die SNP-SNP-Interaktion mit drei positiven SNPs (pri-let-7a-1 rs10739971- PGC
rs6458238- PGC
rs9471643) und das Ergebnis war statistisch signifikant ( P
_{Interaktion = 0,001, Tabelle 4). Der SNP-Kombination zeigte ein erhöhtes Risiko der atrophischen Gastritis (OR = 23,55, 95% CI = 3,73 bis 148,71).}

Diskussion

Polymorphismen von Genen oder miRNA könnten als potentielle Biomarker für die Vorhersage von Krankheitsrisiken dienen . Frühere Studien haben in erster Linie über die Assoziation eines einzigen Gen-Polymorphismus mit Krankheitsrisiko konzentriert, und das Risiko war oft schwacher Effekt (OR < 1,5). Wie für die Kombination von zwei oder mehreren SNP-SNP-Wechselwirkungen war das Risiko oft moderater (OR≥1.5) oder starke Wirkung (OR≥2) [4], [10], [22] - [24]. Die vorliegende Studie zum ersten Mal untersucht die Wechselwirkungen von miRNA-Polymorphismus und PGC
und ERCC6
Polymorphismen in einer nordchinesischen Bevölkerung. Ziel der Studie war experimentellen Beweis für die frühe Diagnose und Mechanismen von Magenkrebs zu schaffen, durch Kombinationen von Gen-Gen-Polymorphismen zu finden, die das Risiko von Magenkrebs und seine präkanzeröse Erkrankungen vorhersagen könnte.

Unter den SNPs aus unserer Gruppe untersucht während unserer Kandidaten-Gen Assoziationsstudie, ERCC6
Single-Locus zeigte eine schwache Wirkung für Magenkrebsrisiko (OR = 1,46) [16]; die drei PGC
Single-Locus eine schwache Schutzwirkung für atrophische Gastritis Risiko nachgewiesen werden (OR für rs4711690 = 0,75; OR für rs6458238 = 0,73; OR für rs9471643 = 0,69) [4]. Wir stellten die Hypothese daher, dass diese Polymorphismen optimalen Kandidaten sein Potenzial SNP-SNP-Wechselwirkungen an zwei oder mehr Loci zu untersuchen, zu Magenkrebs Ätiologie beitragen. Wir führten die Interaktionseffekt Analyse von miRNA-Polymorphismus und Gen-Polymorphismen und fand drei SNP-SNP-Paaren mit Erkrankungen in Verbindung gebracht, von denen die Wechselwirkung von einem Paar (pri-let-7a-1 rs10739971- ERCC6
rs1917799) war im Zusammenhang mit Magenkrebsrisiko und die Wechselwirkungen der beiden anderen Paare (pri-let-7a-1 rs10739971- PGC
rs65458238 und pri-let-7a-1 rs10739971- PGC
rs9471643) wurden mit atrophischer Gastritis Risiko verbunden. ERCC6
rs1917799 Polymorphismus und PGC
rs6458238 und rs9471643 Polymorphismen wurden zuvor berichtet worden. In dieser Studie untersuchten wir zusätzlich pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus in der gleichen Gruppe. Das Paar von pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und ERCC6
rs1917799 Polymorphismus eine ODER ihrer Wechselwirkung von 2,59 für Magenkrebsrisiko hatten, die größer war als ihre einzelnen Single-Locus Effekte von 0,92 und 1,07, beziehungsweise. In ähnlicher Weise ist das Paar von pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und PGC
rs6458238 Polymorphismus ein ODER ihrer Wechselwirkung von 2,77 für atrophische Gastritis Risiko hatte, die größer war als ihre einzelnen single-locus Effekte von 0,74 und 1,23, respectively. Das Paar von pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und PGC
rs9471643 Polymorphismus hatte eine OR ihrer Wechselwirkung von 0,52 für atrophische Gastritis Risiko. Interessanterweise ihre individuellen Einzel Locus Wirkungen waren im Gegensatz zu den obigen Feststellungen mit OR von 1,65 und 1,06 jeweils die Replikation unserer Ergebnisse weiter unabhängig verdient.

Da pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus demonstriert Wechselwirkungen mit sowohl PGC
SNPs auf atrophische Gastritis Risiko, wir weitere Interaktionsanalyse der drei positiven Polymorphismen durchgeführt. Die Ergebnisse zeigten, dass die OR für das Risiko der atrophischen Gastritis war 23,55 ( P
= 0,001). Im Allgemeinen ist ein Single-Locus hat eine schwache Wirkung (OR < 1,5) auf das Krankheitsrisiko und die Kombination von zwei oder mehreren SNP-SNP-Wechselwirkungen zeigt oft eine moderate (OR≥1.5) oder eine starke Wirkung (OR≥2). In der vorliegenden Studie wurde die OR von pri-let-7a-1 einzigen Ort war 1,61; die OR für Wechselwirkungen mit ERCC6
und PGC
waren beide mehr als 2; Die Kombination der drei positiven loci zeigte eine noch höhere oder von 23.55. Diese Ergebnisse angegeben, die Anwendung Aussichten auf eine Kombination von zwei oder mehr SNPs als potentielle Biomarker Krankheitsrisiko vorherzusagen.

, um die Wechselwirkungen von miRNA-Polymorphismen und Gen-Polymorphismen Untersuchung wird auf dem umfassenden Verständnis der Gen-Netzwerk beitragen und die Rolle von miRNAs in der pathogenen Prozesses. Würdigung durch SNP-SNP-Wechselwirkungen haben oft zugrunde liegenden Mechanismen, anstatt lediglich statistischen Ergebnisse [9]. Die drei Paare von SNPs zeigten, dass miRNA mit Genen im Magen Karzinogenese interagieren könnten. PGC-Protein hat eine schützende Wirkung im Epithel des normalen Magen und seine Expression in einer verringerten atrophische Gastritis Gruppe im Vergleich zu einer normalen Gruppe [14], [25]. Die genaue Rolle von PGC in atrophische Gastritis ist noch nicht klar. ERCC6 ist in der DNA-Reparatur-Weg beteiligt, und wiederholte DNA-Schädigung und Reparatur kann zu Zelle Karzinogenese führen [15]. Auf der Grundlage der Ergebnisse in der vorliegenden Studie ist es sinnvoll, dass die let-7a vorschlagen kann in den Prozessen der PGC induzieren atrophische Gastritis und ERCC6 induziert Magenkrebs teilnehmen. Nach den Ergebnissen von miRNA Zielvorhersagesoftware, gab es möglich Bindungsstellen von let-7a mit 3'-UTR für beide PGC
und ERCC6
. Ob die SNP-SNP-Wechselwirkungen in dieser Studie beobachtet wurden, waren wegen der Bindung von miRNA und seine Zielgene noch weitere funktionelle Experimente erfordert.

Diese Studie hatte einige Einschränkungen. Erstens: Obwohl wir eine relativ große Probengröße von 471 Magenkrebs-Patienten, 645 atrophische Gastritis-Patienten und 717 Kontrollen hatten, diese Stichprobengröße noch zum Erfassen Wechselwirkungen, insbesondere für seltene Allele unzureichend. Zweitens müssen die Mechanismen der assoziierten SNP-SNP Wechselwirkungen geklärt werden, und nachfolgende funktionelle Experimente erforderlich sind. Drittens mehrere genomweite Assoziationsstudien deuten auf eine Integration von Daten aus genomweiten Assoziationsstudien von Magenkrebs aus der chinesischen Bevölkerung; Daher sollten die Daten integriert werden, und können verwendet werden als Kandidaten Polymorphismusorte in der Zukunft untersucht werden. Viertens ist die Wechselwirkung zwischen Gen und Umwelt für Magenkrebs Risiko ein wichtiger Faktor, wie Rauchen und Trinken zu betrachten. In dieser Studie haben wir für einige Daten über das Rauchen und Trinken, aber es bleibt fast ein Drittel Daten aus den Proben fehlt. Wechselwirkungen zwischen Genen und Rauchen und Trinkverhalten auf Risiko von Magenkrebs zu prüfen.

Fazit

Diese Studie, die zum ersten Mal, berichtet, dass pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus und ERCC6
rs1917799 Polymorphismus könnte eine Interaktion Wirkung auf die Magenkrebsrisiko haben; und pri-let-7a-1 rs10739971 Polymorphismus könnte eine Wechselwirkung wirken mit PGC
rs6458238 und rs9471643 Polymorphismen auf atrophische Gastritis Risiko. Einige Daten wurden für den möglichen Bau eines Magenkrebs Netzwerk Weg gesammelt bietet. Zukünftige groß angelegte Studien und Experimente Mechanismus erforderlich, um die Ergebnisse dieser Studie zu bestätigen.

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