Abstrakt
Hintergrund
Inherited funktionelle Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) in der DNA-Reparatur-Gene verändern können DNA-Reparaturfähigkeit und damit zur Krebsrisiko beitragen
Methoden
Drei ERCC1 ERCC1 Diese Ergebnisse legen nahe, dass die funktionelle ERCC1 Citation. Er J, Xu Y, Qiu L-X, Li J, Zhou X-Y, Sun M-H, et al. (2012) Polymorphismen in ERCC1 Editor: Xiao-Ping Miao, Huazhong University of Science and Technology, China Empfangen: 18. Juli 2012; Akzeptiert: 8. Oktober 2012; Veröffentlicht: 15. November 2012 Copyright: © 2012 He et al. Dies ist eine Open-Access-Artikel unter den Bedingungen der Lizenz Creative Commons, die uneingeschränkte Nutzung erlaubt, die Verteilung und Vervielfältigung in jedem Medium, vorausgesetzt, der ursprüngliche Autor und Quelle genannt werden Finanzierung:. Diese Forschung wurde durch Mittel aus Chinas Thousand Talents-Programm an der Fudan-Universität und der Zuschuss aus dem Ministerium für Gesundheit (Grantnummer 201002007) unterstützt. Die Geldgeber hatten keine Rolle in Studiendesign, Datenerfassung und Analyse, Entscheidung oder Vorbereitung des Manuskripts zur Veröffentlichung Konkurrierende Interessen:.. Die Autoren haben erklärt, dass keine Interessenkonflikte bestehen Einführung Magenkrebs ist die zweithäufigste Ursache der durch Krebs verursachten Todesfälle weltweit mit schätzungsweise fast eine Million neue Fälle, einem Anteil von 10% aller krebsbedingten Todesfälle im Jahr 2008 aufgetreten ist und etwa 40% aller Fälle aufgetreten in China [1], Ranking der dritthäufigste Krebs in China [2]. Bis heute bleibt die Ätiologie von Magenkrebs unklar, obwohl derzeit vorgeschlagene Risikofaktoren Rauchen und Mangelernährung sind [3], [4], gastroösophagealen Reflux und Fettleibigkeit [5], hohe Body-Mass-Index [6] und Helicobacter pylori DNA Reparatur sind wichtig in der Stabilität und Integrität des menschlichen Genoms zu halten. Beim Menschen gibt es mindestens fünf großen DNA-Reparaturwege, bestehend aus mehr als 130 Gene, von denen die Nukleotidexzisionsreparatur (NER) Weg eine Vielzahl von DNA-Läsionen entfernt, einschließlich sperrige Addukte, Vernetzungen, oxidative DNA-Schädigung, alkylierende Schaden und Thymidin-Dimere [9] - [11]. Zusätzlich wurden mindestens sieben Xeroderma pigmentosum (XP) Komplementationsgruppen identifiziert worden, die die Geschwindigkeit beschränkende diejenigen in der NER Mechanismus sind [12]. Zum Beispiel kann die Exzisionsreparatur Quer kostenlose Gruppe 1 ( ERCC1 Drei gemeinsame ERCC1 Um weitere Evaluierung der Vereinigungen von ERCC1 Materialien und Methoden Studium Bevölkerung Die Probanden wurden aus einem laufenden Fall-Kontroll-Studie rekrutiert, wie zuvor beschrieben [21]. Diese Studie umfasste 1125 nicht verwandten ethnischen Han-Chinesen Patienten mit neu diagnostizierter und histologisch bestätigten primären rekrutiert Adenokarzinom des Magens von der Fudan-Universität Shanghai Cancer Center (FUSCC) zwischen Januar 2009 und März 2011 Alle Patienten aus Ost-China waren, darunter Shanghai, Zhejiang, Jiangsu und die umliegenden Regionen. Da Adenokarzinom des Magens für fast 98,5% aller Patienten mit Magenkrebs Konten in unserer Klinik gesehen, wir von der Teilnahme ausgeschlossen, jene Patienten, die interstitialoma hatte, Magen adenosquamöses Karzinom, Plattenepithelkarzinom, metastasierten Krebs aus anderen Organen oder einer histopathologischen Diagnose andere als Adenokarzinom des Magens. Eine zusätzliche 1196 Kontrollen von alters- (± 5 Jahre) und Geschlecht abgestimmte Krebs-freie ethnische Han-Chinesen mit schriftliche Einverständniserklärung wurden von der Taizhou Longitudinal (TZL) Studie zur gleichen Zeit in Ost-China durchgeführt rekrutiert, die von der genehmigten Komitee für menschliche Ethik der Fudan-Universität, wie zuvor beschrieben [22]. Alle Blutproben von Patienten mit einem Adenokarzinom des Magens wurden durch die Gewebebank von FUSCC zur Verfügung gestellt. Alle Patienten hatten eine schriftliche Einverständniserklärung unterzeichnet für ihre biologischen Proben der Gewebebank von FUSCC spenden. Die Rücklaufquote lag bei ca. 91% für die Fälle und 90% für die Kontrollen. Dieses Forschungsprotokoll wurde von der Institutional Review Board von FUSCC genehmigt SNP Auswahl und Genotypisierung Wir mithilfe der NCBI dbSNP Datenbank und SNPinfo mit folgenden Kriterien potentiell funktionelle SNPs von Interesse ausgewählt. ( 1) die kleine Allelfrequenz berichtet in HapMap war ≥5% für Chinesen; (2) zu beeinflussen Transkriptionsfaktor-Bindungsstelle (TFBS) Aktivität in der mutmaßlichen Promotorregion; (3) Auswirkungen auf die microRNA (miRNA) Bindungsstelle Aktivität; und (4) nicht in der veröffentlichten Gwäss enthalten. Für die ERCC1 Statistische Analyse Wir haben χ 2 Test, um die Unterschiede in den Frequenzen der Allele und Genotypen sowie demographische und andere Kovariaten zwischen den Fällen und Kontrollen zu vergleichen. Die Güte der Anpassung χ 2-Test wurde verwendet, um das Hardy-Weinberg-Gleichgewicht von Genotyp-Verteilungen in den Kontrollen zu berechnen. Wir berechneten rohen und adjustierte Odds Ratios (OR) und 95% Konfidenzintervall (CI) durch univariate und multivariate logistische Regressionsmodelle, die jeweils zu bewerten Assoziationen zwischen den Genotypen und das Risiko von Adenokarzinom des Magens mit und ohne Anpassung für und geschichtet nach Alter, Geschlecht Rauchen /Status des Primärtumors und klinischen Stadium zu trinken. Wir führten auch Homogenitätstests den Unterschied in der Risikoschätzungen unter Untergruppen zu erkennen. Da die ausgewählten SNPs in dem gleichen Block zu sein scheinen, wurde der Haplotyp-Analyse nicht durchgeführt. Wir haben die falsch-positiven Bericht Wahrscheinlichkeit berechnet (FPRP) [23] für alle wichtigen Erkenntnisse. Wir setzen 0.2 als FPRP Schwelle und zugeordnet eine frühere Wahrscheinlichkeit von 0,01 eine OR von 1,50 zu erfassen (für Risikoeffekte) oder 0,67 (für Schutzwirkungen) für einen Zusammenhang mit den Genotypen untersucht. Nur signifikante Ergebnisse mit einem FPRP Wert < 0,2 als bemerkenswert Vereinigungen angesehen wurden Wir führten alle mit SAS Software analysiert (Version 9.1; SAS Institute, Cary, NC)., Und alle statistischen Tests wurden zweiseitig, und P Ergebnisse | Charakteristika der Patienten die Verteilung der demographischen Merkmale der Themen werden vorgestellt in Tabelle S3 und waren ähnlich denen in einem früheren Bericht vorgelegt [21]. der aktuelle Fall-Kontroll-Studie umfasste 1196 Krebs-freie Kontrollen und 1125 Magenkrebsfälle, darunter 305 (27,1%) Kardia Adenokarzinom (GCA) und 820 (72,9%) NGCA, von denen 476 (42,3%) waren von TNM Kurz gesagt, Stufe I + II, und 649 (57,7%) waren der Stufe III + IV nach dem 7 th Ausgabe des AJCC [24]. Assoziation zwischen ausgewählten SNPs und Magenkrebsrisiko die Genotyp Verteilungen der fünf ausgewählten SNPs in Fällen und Kontrollen sind in Tabelle 1. die beobachteten Genotyp Verteilungen unter den Kontrollen gezeigt wurden mit dem Hardy-Weinberg-Gleichgewicht vereinbart ( P Wir fördern die Assoziation zwischen Variante Genotypen von drei ausgewählten SNPs von ERCC1 Die FPRP Werte bei unterschiedlichen Stand der Wahrscheinlichkeitsniveaus für signifikante Ergebnisse in Tabelle 3 für eine frühere Wahrscheinlichkeit von 0,01 gezeigt werden, vorausgesetzt, dass die OR für spezifische Genotyp 1,50 (Risiko) oder 0,67 war (Schutz), mit statistischer Aussagekraft von 0.361 waren die FPRP Werte 0,007 für eine Vereinigung der ERCC1 In diesem Studie fanden wir, dass ERCC1 ERCC1 Wenn wir diese drei ausgewählten kombinierten ERCC1 Insgesamt ist diese große Krankenhaus-Fall-Kontroll-Studie zur Verfügung gestellt statistischer Beweise, dass ERCC1 Hintergrundinformationen
funktionalen SNPs. (rs2298881C > A, rs3212986C > A und rs11615G > A) und zwei XPF
/ ERCC4
funktionalen SNPs (rs2276466C > G und rs6498486A > C) für 1125 Adenokarzinom des Magens Fälle und 1196 Krebs-freie Kontrollen von TaqMan-Assays genotypisiert wurden. Odds Ratios (OR) und 95% Konfidenzintervall (CI) wurden verwendet, um Risiko Assoziationen zu schätzen, und falsch-positiven Bericht Wahrscheinlichkeiten (FPRP) wurden für die Bewertung der wesentlichen Ergebnisse berechnet.
Ergebnisse |
rs2298881C und rs11615A Variante Genotypen wurden mit einem erhöhten Magenkrebsrisiko assoziiert (adjustierte OR = 1,33, 95% CI = 1,05-1,67 für rs2298881 AC /CC und eingestellt OR = 1,23, 95% CI = 1,05-1,46 für rs11615 AG /AA, im Vergleich zu ihrem gemeinsamen Genotyp AA und GG, beziehungsweise). Patienten mit 2-3 ERCC1
Risiko Genotypen hatten signifikant erhöhtes Risiko (adjustierte OR = 1,56, 95% CI = 1,27-1,93), im Vergleich zu denen mit 0-1 ERCC1
Risiko Genotypen, und dieses Risiko war deutlich in Untergruppen von nie Trinker, nicht-Kardia Adenokarzinom (NGCA) und klinischen Stadium I + II. All diese Risiken wurden nicht beobachtet XPF
SNPs.
Schlussfolgerungen
SNPs Risiko von Magenkrebs beitragen können. Größere und gut konzipierte Studien mit verschiedenen ethnischen Bevölkerungsgruppen nötig sind, um unsere Ergebnisse zu validieren
und XPF
Gene und Risiko von Magenkrebs in einer östlichen chinesischen Bevölkerung. PLoS ONE 7 (11): e49308. doi: 10.1371 /journal.pone.0049308
( H. pylori
) Infektion [7]. Es ist wahrscheinlich, dass die genetische Variation auch die Anfälligkeit für Magenkrebs beeinflussen können, [8].
) Gen kodiert für eine Untereinheit des NER-Komplex für die Inzision Schritt des NER erforderlich. Noch wichtiger ist, um die ERCC1 Protein bildet ein Heterodimer mit dem XPF Endonuklease (auch als ERCC4 bekannt), um die 5 'Einschnitt in dem Prozess der DNA-Läsion der Exzision [13] katalysieren. Da das ERCC1 Protein für NER kritisch und genomische Instabilität beeinflussen können, Variationen in ERCC1
wahrscheinlich eine wichtige Rolle zu spielen genomische Stabilität bei der Aufrechterhaltung, die in der Karzinogenese gestört wird [14], [15].
Varianten, nämlich rs11615, rs321986 und rs3212961, wurden bisher untersucht, weil sie wahrscheinlich funktionelle [16] sind. Insbesondere berichteten zwei Fall-Kontroll-Studien, die die Assoziation zwischen ERCC1
rs11615 Variante Genotypen und Magenkrebsrisiko, einschließlich einer Studie von 126 Fällen [17] und eine weitere von 314 Fällen [18] in der italienischen Bevölkerung. Für die Verbindung zwischen ERCC4
Polymorphismen und Krebsrisiko haben frühere Studien vor allem auf eine funktionelle SNP rs1800067G >. A, und einige Fall-Kontroll-Studien an Magenkrebs bisher berichtet [19], [20]
und ERCC4
Polymorphismen mit dem Risiko von Magenkrebs, führten wir eine Fall-Kontroll-Studie durch Genotypisierung fünf potentielle funktionelle SNPs, drei in ERCC1 Karten und zwei in ERCC4,
in einer östlichen chinesischen Han-Bevölkerung von 1125 Magenkrebsfälle und 1196 Krebs-freie Kontrollen.
Gen, wählten wir rs2298881C > A, die die TFBS Aktivität, zusätzlich zu den beiden anderen weit untersucht potentiell funktionelle SNPs (rs3212986C >beeinflussen können; A und rs11615G > A kann mit Transkript Stabilität der ehemaligen Verbindung gebracht werden Änderungen, während die letzteren können mit mRNA-Spiegeln Veränderungen verbunden sein). Für die ERCC4
Gen, wählten wir rs2276466C > G und rs6498486A > C; erstere kann die miRNA-Bindungsstelle Aktivität beeinflussen, während die letzteren die TFBS Aktivität durch den SNPinfo wie vorhergesagt beeinflussen können. Diese fünf potenziell funktionelle SNPs auch andere 49 SNPs in den nahe gelegenen Genen (Tabelle S1 für ERCC1
und Tabelle S2 für ERCC4
) gefangen genommen und wurden, wie zuvor beschrieben [21] genotypisiert.
Werte von weniger als 0,05 als statistisch signifikant betrachtet wurden.
= 0,550 für rs2298881, P
= 0,859 für rs3212986, P
= 0,990 für rs11615, P
= 0,288 für rs2276466 und P
= 0,398 für rs6498486). Die Genotyp Verteilungen waren signifikant unterschiedlich für ERCC1
rs2298881 ( P
= 0,037) und ERCC1
rs11615 ( P
= 0,0496) zwischen den Fällen und Kontrollen, aber nicht für die anderen drei SNPs. Wenn der rs2298881AA Genotyp als Referenz verwendet wurde, wurden die C-Variante Genotypen mit einem erhöhten Risiko von Adenokarzinom des Magens assoziiert (adjustierte OR = 1,37, 95% CI = 1,08-1,74 für AC, eingestellt OR = 1,26, 95% CI = 0.98- 1,63 für CC und adjustierte OR = 1,33; 95% CI = 1,05-1,67 für AC /CC nach Adjustierung für Alter, Geschlecht, Rauchen und trinken Status); wenn der rs11615GG Genotyp als Referenz verwendet wurde, wurden die A-Variante Genotypen mit einem erhöhten Risiko von Adenokarzinom des Magens assoziiert (adjustierte OR = 1,25, 95% CI = 1,05-1,48 für AG, bereinigt OR = 1.13, 95% CI = 0.78- 1,63 für AA und angepasst OR = 1,23; 95% CI = 1,05-1,46 für AG /AA). Dennoch wurden keine Assoziationen mit dem Risiko von Adenokarzinom des Magens für andere drei SNPs (Tabelle 1). Patienten mit 2-3 Risiko Genotypen von ERCC1
signifikant erhöhtes Risiko hatten (bereinigt OR = 1.56, 95% CI = 1,27-1,93), im Vergleich zu denen mit nur 0-1 Risiko Genotypen.
Stratifizierung Analyse
und Risiko von Magenkrebs durch Untergruppen von Alter, Geschlecht, Rauchen und trinken Status, Tumorstelle und klinische geschichtet Bühne, eine dominante genetische Modell auf die Ergebnisse von univariaten Analyse (Tabelle 2) auf der Basis der Annahme. Die rs2298881 Variante AC /CC-Genotypen wurde mit einem erhöhten Risiko verbunden (bereinigtes OPs sofern nicht anders angegeben), die bei Frauen deutlicher war (OR = 1.64, 95% CI = 1,05-2,56), Stromraucher (OR = 1,49, 95% CI = 1,03-2,14), nie Trinker (OR = 1.31, 95% CI = 1,00-1,71), NGCA (OR = 1,33, 95% CI = 1,03-1,71) und klinischen Stadium I + II (OR = 1.58, 95% CI = 1,15-2,18). Ganz ähnliche Ergebnisse wurden für rs11615 Variante AG /AA-Genotypen, vor allem in der jüngeren Gruppe (OR = 1,34, 95% CI = 1,07-1,69), Frauen (OR = 1,38, 95% CI = 1,02-1,88), Strom-Rauchern (OR = 1,38, 95% CI = 1,06-1,80), je Trinker (OR = 1,67, 95% CI = 1,20-2,31), NGCA (OR = 1.23, 95% CI = 1,03-1,47) und der klinischen Phase I + II (OR = 1,33, 95% CI = 1,08-1,65). Wenn alle Risiko Genotypen in eine neue Variable kombiniert wurden, fanden wir, dass die Patienten tragen 2-3 Risiko Genotypen in älteren Gruppe eine offensichtliche Gefahr besteht, hatte (OR = 1.62, 95% CI = 1,19-2,20), Frauen (OR = 1.82, 95% CI = 1,22-2,72), Stromraucher (OR = 1,76, 95% CI = 1,26-2,47), je Trinker (OR = 1,75, 95% CI = 1,16-2,64), NGCA (OR = 1,59, 95% CI = 1,26-2,01) und klinischen Stadium I + II (OR = 1,78, 95% CI = 1,33-2,38). Allerdings schlug weiter Homogenitätstests keine Unterschiede in der Risikoschätzungen unter den Schichten ohne statistische Nachweis der Wechselwirkungen zwischen diesen Variablen und der Variante Genotypen auf das Risiko (Daten nicht gezeigt).
2-3 Risiko Genotypen, mit einem erhöhten Risiko von Adenokarzinom des Magens in allen Individuen. Wir fanden auch eine signifikante Assoziation mit dem Risiko von Adenokarzinom des Magens nie Trinker, NGCA und klinischen Stadium I II mit 2-3 Risiko Genotypen unter den Patienten +. Diese bedeutenden Verbände wurden als bemerkenswert betrachtet, weil die Wahrscheinlichkeit eines falsch-positiven Ergebnis war < 20%. Im Gegensatz dazu größer FPRP Werte wurden für andere signifikante Assoziationen zwischen ERCC
1-Varianten und Adenokarzinom des Magens beobachtet, einige mögliche Verzerrungen in diesen positiven Befunde hindeutet.
Diskussion
rs2298881C und rs11615A Variante Genotypen mit einem ausgeprägten erhöhten Risiko von Adenokarzinom des Magens verbunden waren und dass das erhöhte Risiko im Zusammenhang mit 2-3 Risiko Genotypen war deutlicher in nie Trinker, NGCA und klinischen Stadium I + II. Unseres Wissens ist dies die erste Studie, dass ERCC1
Intron rs2298881 C /A und kodierende Region rs11615 G /A Polymorphismen gefunden wurden mit einem Adenokarzinom des Magens Risiko in Verbindung gebracht werden. Da ERCC1 eine entscheidende Rolle bei NER spielt, sind diese Befunde biologisch plausibel.
auf Chromosom kartiert wurde 19q13.32, bestehend aus 10 Exons und Codieren eines 297 Acetaldehydammoniak Produkt, während ERCC4,
16p13.12 gelegen, besteht aus 11 Exons und kodiert für ein 916 Acetaldehydammoniak Produkt. ERCC1
kodiert für eine Untereinheit für die NER-Komplex, der für den Schnitt Schritt des NER-Weg [15], [25] erforderlich war. Wichtig ist, katalysiert ein Heterodimer von ERCC1 /XPF die 5'Inzision in dem Prozess DNA-Läsionen in rekombinatorischen DNA Reparatur von Exzision und bei der Reparatur von Interstrang-Vernetzungen [26] - [28]. Somit ist es möglich, dass die funktionelle ERCC1
Varianten auch eine Rolle bei der Krebsrisiko spielen können. Zum Beispiel kann die ERCC1
Asn118Asn (rs11615) SNP mit einigen spezifischen Subtyp von Lungenkrebs berichtet wurde, in Verbindung gebracht werden, sowie frühe Einsetzen von Lungenkrebs [29]. Ebenso wurde die ERCC1
19007 C (rs11615) Allel mit einem erhöhten Lungenkrebsrisiko in der asiatischen Bevölkerung [16] zugeordnet werden. Bis heute in den veröffentlichten Studien über die Verbindungen zwischen dem ERCC1
rs11615T > C, rs3212986C > A und rs3212961A > C-Polymorphismen und Krebsrisiko [16], nur zwei Studien konzentrierten sich auf ERCC1
Polymorphismen und das Risiko von Magenkrebs, die beide die rs11615T >sucht; C nur in einem relativ kleinen Italien Bevölkerung, einschließlich einer [17] mit nur 126 Magenkrebsfälle und die andere von lediglich 314 Fälle [18], aber keiner der beiden Studien die SNPs untersuchten in der vorliegenden Studie eingeschlossen.
SNPs, fanden wir, dass Patienten mit 2-3 Risiko Genotypen Risiko von Magenkrebs signifikant erhöht war im Vergleich zu diejenigen mit 0-1 Risiko Genotypen. Im Schicht Analyse fanden wir auch, dass die Wirkung der rs2298881 AC /CC-Genotypen auf das Krebsrisiko war deutlich in Untergruppen von Frauen, Strom Raucher, nie Trinker, NGCA und klinischen Stadium I + II und die recht ähnliche Ergebnisse waren für rs11615 Variante AG /AA-Genotypen, vor allem bei jüngeren Patienten, Frauen, Stromraucher, je Trinker, NGCA und klinischen Stadium I + II. Doch nach FPRP für diese wichtigen Erkenntnisse wurde berechnet, nur die Ergebnisse für nicht-Trinker, NGCA und klinischen Stadium I + II blieben signifikant für die Patienten mit 2-3 Risiko Genotypen. Daher können einige unserer Erkenntnisse aus der geschichtete Analyse Zufallsbefund sein wegen der reduzierten Probengrößen in den Untergruppen. Zum Beispiel fanden wir, dass die sich ständig Trinker hatten ein deutlicher Risiko (OR = 1,75, 95% CI = 1,16-2,64) als die nie-Trinker (OR = 1.51, 95% CI = 1,18-1,93); jedoch auf der Grundlage der Berechnung FPRP, ist das Risiko für die jemals Trinkern gefunden war nicht signifikant für eine Priori-Wahrscheinlichkeit von 0,01. Dies kann zur Verringerung der Stichprobengrößen zugeschrieben werden, denn es gibt mehr waren nie Trinker als je Trinker in unserer aktuellen Studie. Tabakrauch bedingte Karzinogene können verschiedene Arten von DNA-Schäden induzieren, die hauptsächlich durch die NER Weg entfernt [30]. Wenn unrepariert können solche DNA-Schäden zu Mutationen führen und damit die Einleitung der Karzinogenese. Zum Beispiel DNA-Addukte in der fötalen Blut identifiziert erhöhen können nachfolgende Krebsrisiko im Erwachsenenalter zu entwickeln [31]. Für Raucher, durch akkumulierte DNA-Schäden die Wirkung der genetischen Instabilität auf das Krebsrisiko kann durch fortgesetzte Zigarettenrauchen verursacht ergänzt werden. Frauen können anfälliger für Rauch aus zweiter Hand oder durch Luftverschmutzung in Gebäuden von ungelüfteten kohlebetriebenen Öfen und Kochdämpfe [32] betroffen. Magenkrebs umfasst NGCA und GCA und GCA ist an der gastroösophagealen Übergang lokalisiert und unterscheidet sich von NGCA in epidemiologischen Merkmalen und klinische Merkmale [4], [33]. Schließlich ist die Erkenntnis, dass Patienten mit 2-3 ERCC1
Risiko Genotypen hatten ein erhöhtes Risiko von Krebs im Frühstadium, die könnte darauf hindeuten, dass die beobachtete Risiko genetische Anfälligkeit als Ursache für die Karzinogenese des Zielgewebes eher als Tumor sein könnte Progression, die durch zusätzliche Mutationsereignisse [34].
rs2298881 und rs11615 SNPs gefahren werden konnte, aber nicht ERCC4
SNPs wurden mit Magenkrebsrisiko in einer östlichen chinesischen Bevölkerung verbunden sind, vor allem für nicht-Trinker, Patienten mit NGCA und frühen klinischen Phasen. Allerdings hatte die vorliegende Studie einige Einschränkungen. Zunächst wurden die Patienten aus FUSCC ausgewählt, die keine gut definierten Einzugsgebiet für die Fälle, in Ost-China als die TZL Studie für die Kontrollen hatte, die Selektionsbias und Informationen Bias aufweisen. Zweitens nur drei mögliche funktionelle SNPs von ERCC1 Karten und zwei von ERCC4
in der vorliegenden Studie untersucht wurden, die nicht alle SNPs des deckten ERCC1 /XPF
Komplex . Schließlich hatten wir keine zuverlässige und ausreichende Informationen über andere Umwelteinflüsse, wie Nahrungsaufnahme, Beruf und H. pylori
Infektion aufgrund der Natur der retrospektiven Studie Design. Da unsere Patienten vor allem aus dem östlichen China waren, wäre es ideal, um eine multizent basierte Replikation zu haben, um unsere Ergebnisse zu bestätigen. Ohne eine solche Replikation unsere Ergebnisse sollten als vorläufig betrachtet werden. Mit einer solchen vorläufigen Ergebnisse aus der vorliegenden Studie hoffen wir, dass mehr Krebsforschungszentren und Laboratorien in China und anderen Regionen der Welt mit einer hohen Inzidenz von Magenkrebs zu unserer Ergebnisse mit größeren Stichprobengrößen zu validieren, vollständigere Informationen über die Nahrungsaufnahme, Beruf und H.-pylori-Infektion.
Tabelle S1.
erfasst SNPs durch den ausgewählten drei ERCC1
funktionalen SNPs als durch SNPinfo Software vorhergesagt
doi:. 10.1371 /journal.pone.0049308.s001
(DOC)
Tabelle S2.
erfasst SNPs durch die beiden ausgewählten ERCC4
funktionalen SNPs als durch SNPinfo Software vorhergesagt
doi:. 10.1371 /journal.pone.0049308.s002
(DOC)
Tabelle S3.
Häufigkeitsverteilung der demographischen Charakteristika von Magenkrebsfälle und Krebs-freie Kontrollen
doi:. 10.1371 /journal.pone.0049308.s003
(DOC)
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